Table 2.
The detection FPR/TPR with different copy number c
| c | CNV-seq | FREEC | SegSeq | CNV-TV1 | readDepth | CNVnator | EWT | CNV-TV2 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 0 |
3.4e-4/0.98 |
2.1e-3/1.00 |
4.8e-3/0.00 |
1.5e-3/0.99 |
4.0e-5/0.99 |
1.3e-4/0.99 |
3.4e-4/0.99 |
2.2e-4/0.99 |
| 1 |
0.0e-0/0.23 |
5.2e-4/0.99 |
4.4e-3/0.95 |
1.4e-3/0.98 |
3.0e-5/0.30 |
3.4e-4/0.95 |
2.5e-4/0.98 |
4.2e-4/0.98 |
| 3 |
1.4e-5/0.05 |
7.2e-4/0.97 |
4.7e-3/0.85 |
2.9e-3/0.98 |
1.9e-5/0.06 |
2.2e-4/0.92 |
2.8e-4/0.82 |
4.6e-4/0.99 |
| 6 | 3.5e-4/1.00 | 9.9e-4/1.00 | 4.9e-3/0.99 | 7.9e-4/0.99 | 3.1e-5/0.99 | 2.5e-5/0.99 | 1.3e-4/0.99 | 6.2e-5/0.99 |