Table 4.
Transcriptional and proteoma analysis of D. rotundus Principal Submaxillary and Accessory glands.
| Peptide link | Total reads | M | * | SP | MW | pI | p | A/P | P/A | Comments/Target | 11 P | 11 S | 7 P | 7 S |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Putative secreted proteins | ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
| Enzymes | ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
| Phosphatase | ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
| BatTrinityAbyss-508800 | 1780 | M | * | SIG | 55.22 | 9.19 | Y | 0.42 | 2.36 | Platelet function | ||||
|
| ||||||||||||||
| Apyrase | ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
| BatTrinityAbyss-537653 | 3555 | M | * | SIG | 51.74 | 5.66 | Y | 0.67 | 1.49 | Platelet function | 1 | 12 | 1 | 12 |
|
| ||||||||||||||
| DNAse (Deoxyribonuclease) | ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
| BatTrinityAbyss-499100 | 11477 | M | * | SIG | 33.91 | 6.06 | Y | 0.01 | 69.51 | Neutrophil function | ||||
| BatTrinityAbyss-532109 | 949 | G | * | BL | 36.22 | 5.81 | N | 1.18 | 0.84 | Neutrophil function | 1 | 15 | 1 | 14 |
|
| ||||||||||||||
| Metalloprotease (ADAMTS-1) | ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
| BatTrinityAbyss-517665 | 10097 | M | * | SIG | 105.26 | 7.45 | Y | 0.01 | 74.75 | Angiogenesis | 0 | 1 | 8 | |
| BatTrinityAbyss-521171 | 6380 | M | * | SIG | 90.73 | 7.71 | Y | 2.34 | 0.43 | Angiogenesis | 1 | 1 | ### | 9 |
|
| ||||||||||||||
| Serine protease | ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
| Plasminogen activator | ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
| BatTrinityAbyss-499018 | 1400766 | M | * | SIG | 44.42 | 8.78 | Y | 0 | 791.49 | Fibrinolytic | 1 | 1 | 1 | 13 |
|
| ||||||||||||||
| Other serine proteases | ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
| BatTrinityAbyss-34346 | 381 | S | * | SIG | 27.93 | 9.24 | Y | 0.45 | 2.06 | Chymase | 1 | 16 | 1 | 16 |
|
| ||||||||||||||
| Clotting pathways serine proteases | ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
| BatTrinityAbyss-499228 | 21684 | N | * | CYT | 16.93 | 6.15 | Y | 0.13 | 7.97 | Protease | ### | 15 | 1 | 15 |
| BatTrinityAbyss-489254 | 42256 | M | * | SIG | 30.95 | 5.8 | Y | 0.11 | 8.85 | Protease | ||||
|
| ||||||||||||||
| Dipeptidyl and tripeptidyl peptidases | ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
| BatTrinityAbyss-561424 | 2794 | M | * | BL | 87.86 | 5.65 | Y | 0.4 | 2.45 | Dipeptidyl peptidases | 1 | 6 | 1 | 7 |
| BatTrinityAbyss-31529 | 825 | M | * | SIG | 52.1 | 6.32 | 1.13 | 0.87 | Dipeptidyl peptidases | 1 | 17 | 1 | 18 | |
|
| ||||||||||||||
| Legumains and cathepsins (may be lysosomal) | ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
| BatTrinityAbyss-529744 | 6521 | M | * | SIG | 44.33 | 6.19 | Y | 0.65 | 1.53 | Cathepsin D | 1 | 16 | 1 | 16 |
| BatTrinityAbyss-32009 | 558 | V | * | SIG | 38.17 | 7.65 | 0.7 | 1.37 | Cathepsin S | 1 | 17 | 1 | 16 | |
|
| ||||||||||||||
| Other peptidases | ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
| BatTrinityAbyss-515689 | 12851 | M | * | SIG | 117.08 | 5.93 | Y | 0.53 | 1.89 | Arginine convertase | 1 | 7 | 1 | 7 |
| BatTrinityAbyss-489052 | 2950 | M | * | BL | 107.07 | 5.73 | Y | 0.83 | 1.2 | Aminopeptidase | 1 | 7 | 1 | 8 |
| BatTrinityAbyss-549050 | 2294 | M | * | SIG | 50.21 | 6.44 | Y | 0.25 | 3.96 | Carboxy peptidases | 1 | 11 | 1 | 11 |
| BatTrinityAbyss-498793 | 4217 | M | * | SIG | 51.92 | 5.36 | Y | 0.87 | 1.14 | Carboxy peptidases | 1 | 11 | 1 | 11 |
| BatTrinityAbyss-545838 | 1041 | M | * | SIG | 37.83 | 5.22 | 0.93 | 1.05 | Prohibitin | 1 | 13 | 1 | 14 | |
|
| ||||||||||||||
| Lipases | ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
| BatTrinityAbyss-549118 | 1863 | M | * | SIG | 51.34 | 5.79 | Y | 0.13 | 7.25 | Sphingomyelinase | ### | 7 | 1 | 11 |
| BatTrinityAbyss-39751 | 2505 | M | * | SIG | 62.08 | 6.1 | Y | 0.73 | 1.36 | Carboxylesterase | 1 | 10 | 1 | 2 |
|
| ||||||||||||||
| Epoxide hydrolase | ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
| BatTrinityAbyss-508632 | 16840 | M | * | SIG | 52.4 | 6.79 | 1.04 | 0.96 | Epoxide hydrolase | 1 | 13 | 1 | 13 | |
|
| ||||||||||||||
| Other enzymes | ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
| BatTrinityAbyss-521692 | 816 | M | * | CYT | 33.42 | 7.77 | 0.87 | 1.12 | Abhydrolase | 1 | 16 | 1 | 16 | |
| BatTrinityAbyss-498378 | 2194 | R | * | SIG | 33.27 | 9.01 | Y | 0.78 | 1.26 | Secreted protein | 1 | 16 | 1 | 16 |
|
| ||||||||||||||
| Protease inhibitor domains | ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
| Kunitz domain (TFPI-like) | ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
| BatTrinityAbyss-523646 | 386161 | E | * | SIG | 19.32 | 9.45 | Y | 0.03 | 36.3 | Anticoagulant | 0 | 1 | 14 | |
|
| ||||||||||||||
| Kunitz domain (Kunitz-type protease inhibitor) | ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
| BatTrinityAbyss-541822 | 3016 | M | * | SIG | 28.02 | 7.89 | 0.96 | 1.04 | Kunitz inhibitor | |||||
|
| ||||||||||||||
| Amyloid Kunitz protein | ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
| BatTrinityAbyss-507602 | 1896 | M | * | SIG | 85.08 | 4.69 | Y | 0.2 | 4.8 | Mucin | ||||
| BatTrinityAbyss-507612 | 13922 | M | * | SIG | 78.72 | 4.72 | Y | 0.2 | 4.98 | Mucin | ||||
|
| ||||||||||||||
| Collagen with VWB and Kunitz domains | ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
| BatTrinityAbyss-22377 | 4540 | M | * | SIG | 293.14 | 5.88 | Y | 0.87 | 1.15 | Collagen | 1 | 2 | 1 | 5 |
| BatTrinityAbyss-555181 | 8671 | M | * | SIG | 118.27 | 7.75 | Y | 0.75 | 1.33 | Collagen | 1 | 5 | 1 | 6 |
|
| ||||||||||||||
| Cystatin | ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
| BatTrinityAbyss-41885 | 1314 | M | * | SIG | 16.48 | 8.9 | Y | 2.26 | 0.44 | Cysteine-type inhibitor | ||||
|
| ||||||||||||||
| Kazal domain | ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
| BatTrinityAbyss-36340 | 45997 | M | * | SIG | 12.01 | 9.48 | Y | 4.91 | 0.2 | Protease inhibitor | 1 | 19 | 0 | |
|
| ||||||||||||||
| Serpins | ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
| BatTrinityAbyss-548577 | 2192 | M | * | SIG | 46.37 | 4.79 | Y | 0.61 | 1.61 | Neuraserpin | ||||
| BatTrinityAbyss-518161 | 1976 | M | * | SIG | 46.8 | 6.68 | Y | 0.33 | 2.93 | α-1 antitrypsin | 1 | 11 | 0 | |
| DrSigp-SigP-532391 | 2305 | M | * | SIG | 61.63 | 4.97 | Y | 0.72 | 1.38 | Protease C1 inh. | 1 | 7 | 1 | 8 |
| BatTrinityAbyss-543253 | 3481 | R | * | CYT | 43.22 | 5.78 | Y | 1.86 | 0.54 | Serpin | 1 | 13 | 1 | 14 |
| BatTrinityAbyss-25903 | 909 | M | * | CYT | 42.7 | 6.15 | Y | 0.71 | 1.38 | Serpin | 1 | 13 | 1 | 14 |
|
| ||||||||||||||
| TIL domain containing protein | ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
| DrSigp-SigP-495835 | 342175 | M | * | SIG | 275.17 | 5.24 | Y | 4.98 | 0.2 | Protease inhibitor | 1 | 6 | ### | 16 |
|
| ||||||||||||||
| Metalloproteinase inhibitor domain | ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
| BatTrinityAbyss-534229 | 862 | M | * | SIG | 24.18 | 9.01 | 0.84 | 1.16 | Protease Inhibitor | |||||
| BatTrinityAbyss-37180 | 425 | M | * | SIG | 23.04 | 8.58 | 0.74 | 1.29 | Protease Inhibitor | |||||
|
| ||||||||||||||
| Other protease inhibitors | ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
| BatTrinityAbyss-8258 | 1034 | A | * | CYT | 92.78 | 5.61 | Y | 1.39 | 0.71 | α-Macroglobulin | 1 | 8 | 1 | 8 |
| DrSigp-SigP-210264 | 130 | M | SIG | 18.17 | 8.73 | 1.24 | 0.73 | Endopeptidase inhibitor | ||||||
| BatTrinityAbyss-321620 | 107 | M | SIG | 25.5 | 9.51 | 1.36 | 0.65 | Inter-α-trypsin inhibitor | ||||||
| DrSigp-SigP-36965 | 1046 | M | * | SIG | 15.45 | 7.76 | Y | 4.06 | 0.25 | Peptidase inhibitor | ||||
|
| ||||||||||||||
| Lipocalin and other lipid carriers | ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
| BatTrinityAbyss-466603 | 212065 | P | * | SIG | 21.18 | 5.09 | Y | 0 | 523.66 | Lipocalin | 0 | 1 | 17 | |
| BatTrinityAbyss-495622 | 1585466 | M | * | SIG | 24.32 | 7 | Y | 0 | 919.23 | Lipocalin | ||||
| BatTrinityAbyss-496761 | 1873290 | M | * | SIG | 24.35 | 7.04 | Y | 0 | 885.83 | Lipocalin | ||||
| BatTrinityAbyss-495626 | 2899256 | K | * | SIG | 23.08 | 8.92 | Y | 0 | 1104.63 | Lipocalin | 0 | 1 | 15 | |
| BatTrinityAbyss-495631 | 964371 | M | * | SIG | 22.44 | 4.92 | Y | 0 | 1089.84 | Lipocalin | ||||
| BatTrinityAbyss-495624 | 316695 | M | * | SIG | 23.89 | 4.74 | Y | 0 | 844.63 | Lipocalin | 0 | 1 | 15 | |
| BatTrinityAbyss-495634 | 268861 | G | CYT | 18.05 | 9.71 | Y | 0 | 663.92 | Lipocalin | ### | 1 | 1 | 15 | |
| BatTrinityAbyss-546328 | 16850 | S | * | CYT | 18.3 | 4.78 | Y | 0.01 | 66.03 | Lipocalin | 0 | ### | 17 | |
| BatTrinityAbyss-562380 | 1146 | M | * | SIG | 29 | 9.67 | 0.84 | 1.17 | Lipocalin | 1 | 15 | 1 | 15 | |
| BatTrinityAbyss-500440 | 1402119 | M | * | SIG | 6.3 | 3.76 | Y | 0 | 1214.13 | Lipocalin | ||||
| BatTrinityAbyss-509991 | 1206 | P | * | CYT | 29.41 | 8.86 | Y | 0.61 | 1.61 | Lipocalin | 1 | 16 | 1 | 16 |
|
| ||||||||||||||
| Lipophilin/secretoglobin precursors | ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
| BatTrinityAbyss-500441 | 1614499 | M | * | SIG | 6.7 | 5.97 | Y | 0 | 1435.33 | Antiinflammatory | ||||
| BatTrinityAbyss-500442 | 2063350 | M | * | SIG | 8.98 | 4.08 | Y | 0 | 1273.86 | Antiinflammatory | 0 | 1 | 1 | |
| BatTrinityAbyss-515986 | 1309024 | M | * | SIG | 10.32 | 8.34 | Y | 0 | 484.86 | Antiinflammatory | 1 | 2 | 1 | 20 |
| BatTrinityAbyss-497146 | 627793 | L | * | SIG | 11.05 | 8.68 | Y | 0 | 697.62 | Antiinflammatory | ||||
| DrSigp-SigP-515987 | 1090871 | M | * | SIG | 10.35 | 8.45 | Y | 0 | 451.73 | Antiinflammatory | ||||
| BatTrinityAbyss-515989 | 681163 | M | * | SIG | 5.76 | 5 | Y | 0 | 354.78 | Antiinflammatory | ||||
| BatTrinityAbyss-497133 | 163306 | F | * | CYT | 9.66 | 9.55 | Y | 0.02 | 46.27 | Antiinflammatory | ### | 15 | 1 | 20 |
| BatTrinityAbyss-497140 | 202043 | S | * | CYT | 12.08 | 9.69 | Y | 0.15 | 6.47 | Antiinflammatory | 1 | 15 | 1 | 20 |
| DrSigp-SigP-515229 | 345027 | M | * | SIG | 6.26 | 6.03 | Y | 0 | 657.26 | Antiinflammatory | ||||
|
| ||||||||||||||
| Antigen 5/CRISP family | ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
| BatTrinityAbyss-495870 | 448565 | M | * | SIG | 27.39 | 8.79 | Y | 0.04 | 26.5 | CRISP | 1 | 16 | 1 | 16 |
|
| ||||||||||||||
| Beta2-microglobulin/Class I major histocompatibility complex | ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
| BatTrinityAbyss-527040 | 10572 | M | * | SIG | 13.37 | 8.57 | Y | 0.71 | 1.41 | MHC | ||||
| BatTrinityAbyss-37556 | 341 | S | * | CYT | 19.81 | 6.27 | Y | 1.6 | 0.6 | MHC | ||||
|
| ||||||||||||||
| Neuropeptide/hormones | ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
| BatTrinityAbyss-500584 | 357219 | M | * | SIG | 20.58 | 6.44 | Y | 0 | 486.05 | Vasodilator (PACA) | ### | 10 | 1 | 14 |
| BatTrinityAbyss-538594 | 23548 | M | * | SIG | 12.78 | ### | Y | 0 | 224.26 | Vasodilator (CNP) | ||||
|
| ||||||||||||||
| Extracellular matrix components | ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
| BatTrinityAbyss-41612 | 1466 | R | * | SIG | 20.25 | 9.16 | Y | 4.9 | 0.2 | ECM | 1 | 17 | 0 | |
| BatTrinityAbyss-67131 | 188 | M | SIG | 19.38 | 5.65 | 0.58 | 1.51 | ECM | ||||||
| BatTrinityAbyss-510471 | 1914 | A | CYT | 86.72 | 6.29 | 0.98 | 1.02 | ECM | 1 | 3 | 1 | 3 | ||
| BatTrinityAbyss-521514 | 4436 | A | CYT | 330.47 | 5.58 | Y | 0.62 | 1.61 | ECM | ### | 2 | 1 | 2 | |
|
| ||||||||||||||
| Lectins | ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
| BatTrinityAbyss-475358 | 289 | N | * | CYT | 26.53 | 8.89 | 1.17 | 0.81 | Galectin-3 | 1 | 15 | 1 | 15 | |
| BatTrinityAbyss-36853 | 411 | E | * | CYT | 20.77 | 6.25 | 0.73 | 1.31 | Galectin-7 | 1 | 19 | 1 | 19 | |
| BatTrinityAbyss-526622 | 3056 | R | * | CYT | 40.44 | 9 | Y | 0.8 | 1.25 | Galectin-8 | 1 | 15 | 1 | 14 |
| DrSigp-SigP-526623 | 1453 | M | * | SIG | 21.88 | 8.38 | Y | 0.69 | 1.43 | Galectin-8 | ||||
| BatTrinityAbyss-467016 | 231 | M | * | CYT | 18.95 | 5.43 | 1.42 | 0.67 | Galectin | |||||
| DrSigp-SigP-534086 | 59576 | M | * | SIG | 26.66 | 7.77 | Y | 4.57 | 0.22 | Lectin | 1 | 18 | 1 | 18 |
| BatTrinityAbyss-508153 | 13694 | V | * | CYT | 289.55 | 5.06 | Y | 0.35 | 2.87 | Lectin | ### | 6 | 1 | 3 |
|
| ||||||||||||||
| Antimicrobial peptides | ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
| Defensin | ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
| BatTrinityAbyss-401005 | 112 | M | * | SIG | 7.52 | 9.05 | 1.78 | 0.51 | β-defensin | |||||
|
| ||||||||||||||
| Lysozyme | ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
| BatTrinityAbyss-500942 | 1442243 | M | * | SIG | 16.63 | 9.34 | Y | 4.53 | 0.22 | Lysozyme | 1 | 19 | 1 | 19 |
|
| ||||||||||||||
| Other antimicrobial agents | ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
| DrSigp-SigP-429618 | 105 | M | * | SIG | 12.51 | 5.65 | 0.59 | 1.35 | BPI/LBP/CETP far | |||||
| BatTrinityAbyss-86412 | 163 | M | * | SIG | 22.15 | 9.03 | Y | 1.73 | 0.54 | lymphotoxin | ||||
|
| ||||||||||||||
| Complement and regulators | ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
| BatTrinityAbyss-547414 | 1280 | A | * | CYT | 25.65 | 4.53 | Y | 0.51 | 1.92 | Complement | 1 | 16 | 1 | 16 |
| DrSigp-SigP-483662 | 454 | M | SIG | 43.51 | 6.21 | 0.95 | 1.02 | Complement | ### | 7 | ### | 8 | ||
| BatTrinityAbyss-483662 | 436 | N | SIG | 43.03 | 6.44 | 0.87 | 1.1 | Complement | ### | 7 | #### | 8 | ||
| BatTrinityAbyss-563735 | 2587 | R | * | SIG | 129.72 | 6.1 | Y | 1.26 | 0.79 | Complement | 1 | 5 | 1 | 5 |
| BatTrinityAbyss-40668 | 724 | M | * | SIG | 25.54 | 5.85 | Y | 0.4 | 2.35 | Complement | 1 | 17 | 1 | 16 |
|
| ||||||||||||||
| Growth factors and immune regulators | ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
| BatTrinityAbyss-533465 | 1694 | M | * | SIG | 23.64 | 6.48 | Y | 0.3 | 3.26 | Stromal cell factor | 1 | 17 | 1 | 17 |
| DrSigp-SigP-38368 | 1290 | M | * | SIG | 28.1 | 4.57 | Y | 1.23 | 0.8 | hypothetical proteins | 1 | 15 | 1 | 15 |
|
| ||||||||||||||
| Immunity related products | ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
| C-C motif chemokine (CCL28-like) | ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
| BatTrinityAbyss-506850 | 4563 | M | * | SIG | 14.37 | ### | Y | 0.03 | 30.37 | Chemokine | ||||
|
| ||||||||||||||
| T cell immunomodullatory protein | ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
| BatTrinityAbyss-511328 | 3228 | M | * | BL | 90.89 | 5.26 | Y | 0.65 | 1.52 | T-cell antigen | ||||
| BatTrinityAbyss-511332 | 23206 | L | * | CYT | 88.87 | 5.18 | Y | 0.8 | 1.25 | T-cell antigen | ||||
| BatTrinityAbyss-511331 | 23214 | L | * | CYT | 87.9 | 5.22 | Y | 0.8 | 1.25 | T-cell antigen | 1 | 7 | 1 | 7 |
| BatTrinityAbyss-550694 | 2918 | M | * | SIG | 25.21 | 8.65 | Y | 3.99 | 0.25 | Insulin secretion | ||||
| BatTrinityAbyss-533680 | 338 | M | * | SIG | 49.25 | 7.76 | Y | 4.98 | 0.2 | BPI/LBP/CETP | 1 | 11 | 0 | |
|
| ||||||||||||||
| Other immunity related products (TSG-6) | ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
| BatTrinityAbyss-527888 | 8330 | M | * | SIG | 31.29 | 7.6 | Y | 0.02 | 42.67 | TNF-inducible gene | 0 | 1 | 14 | |
| BatTrinityAbyss-509950 | 844810 | M | * | SIG | 27.15 | 5.4 | Y | 0 | 345.53 | TNF-inducible gene | 1 | 15 | 1 | 15 |
|
| ||||||||||||||
| MHC class I and II antigen | ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
| BatTrinityAbyss-507167 | 456 | M | SIG | 31.63 | 5.76 | Y | 0.62 | 1.54 | MHC class I B | |||||
|
| ||||||||||||||
| Ig mu chain | ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
| BatTrinityAbyss-39685 | 1674 | S | * | CYT | 49.76 | 5.81 | Y | 1.57 | 0.63 | IgG chain | 1 | 9 | 1 | 9 |
| BatTrinityAbyss-496807 | 479 | M | * | SIG | 15.15 | 9.12 | Y | 0.13 | 6.34 | IgG chain | ### | 17 | 1 | 11 |
| DrSigp-SigP-488712 | 579 | M | SIG | 15.98 | 8.47 | Y | 0.65 | 1.48 | IgG chain | 1 | 11 | 1 | 11 | |
| BatTrinityAbyss-510560 | 570247 | V | * | BL | 51.47 | 5.46 | Y | 0.12 | 8.15 | IgG chain | 1 | 11 | 1 | 12 |
| BatTrinityAbyss-138350 | 42 | V | CYT | 13.54 | 9.43 | 0.36 | 1.37 | IgG chain | 1 | 10 | 1 | 11 | ||
| BatTrinityAbyss-522329 | 586 | V | CYT | 14.08 | 7.94 | Y | 0.67 | 1.44 | IgG chain | 1 | 11 | 1 | 11 | |
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| ||||||||||||||
| Ig lambda chain | ||||||||||||||
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| ||||||||||||||
| BatTrinityAbyss-505962 | 35933 | L | * | SIG | 24.36 | 7.04 | Y | 0.15 | 6.51 | IgG chain | 1 | 17 | 1 | 16 |
| BatTrinityAbyss-46124 | 571 | M | SIG | 15.93 | 5.21 | Y | 2.19 | 0.45 | IgG chain | |||||
| BatTrinityAbyss-521576 | 399 | M | SIG | 15.31 | 5.07 | Y | 0.35 | 2.6 | IgG chain | |||||
| BatTrinityAbyss-505979 | 40645 | T | * | SIG | 26 | 8.17 | Y | 0.11 | 9 | IgG chain | 1 | 17 | 1 | 16 |
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| ||||||||||||||
| Mucins (hundreds not shown) | ||||||||||||||
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| ||||||||||||||
| DrSigp-SigP-493041 | 6272756 | M | * | SIG | 182.75 | 5.29 | Y | 5 | 0.2 | Mucin | 1 | 2 | 1 | 1 |
| BatTrinityAbyss-497247 | 1991177 | M | * | SIG | 13.25 | 4.55 | Y | 5 | 0.2 | Mucin | 1 | 15 | 1 | 18 |
M, indicates the presence of methionine.
SigP, presence of signal peptide.
MW, molecular weight of the the mature protein.
pI, isoelectric point.
*
, indicates the presence of stop codon.
A/P, ratio of transcripts present in the Acessory/Principal gland.
P/A, ratio of transcripts present in the Principal/Acessory gland.
p, p<0.05 for difference in expression levels for Principal vs Accessory glands.
11 P (Accessory Gland), 7 P (Principal Gland). Predict, predictive value for identification (1, maximum).
11 S (Accessory Gland), 7 S (Principal Gland). Slice from the 1D-gel (Figures 2A and 2B) where the protein was found in the proteome.
Inh., inhibitor. ECM, extracellular matrix.
SIG, signal peptide; CYT, cytosolic; BL, borderline prediction.