Skip to main content
. 2013 Jun 7;2:257. doi: 10.1186/2193-1801-2-257

Table 1.

PCR primers and amplification conditions

Primer Sequence 5’→3’ References PCR conditions *
Denaturing Annealing Extension Cycles
PLB AGAGTTTGATCCTGGCTCAG Kullen et al. (2000)
MLB GGCTGCTGGCACGTAGTTAG 94°C, 1 min 50°C, 1 min 72°C, 1 min 30
Bact 8 F AGAGTTTGATCCTGGCTCAG Edwards et al. (1989)
1391R GACGGGCGGTGTGTRCA Lane et al. (1985) 94°C, 1 min 56°C, 1 min 72°C, 1 min 30
16S/p2 CTTGTACACACCGCCCGTC Gürtler and Stanisich (1996)
23S/p7 GGTACTTAGATGTTTCAGTTC 94°C, 1 min 56°C, 1 min 72°C, 1 min 35
CS-f GAGCTTGCTCCTCATTGATAA Lee et al. (2004)
CS-r TTGGATACCGTCACTACCTG
Uni-f GATAAACCAAATGTGTAGGG 94°C, 0.5 min 58°C, 0.5 min 72°C, 1 min 35
M13 GAG GGT GGC GGT TCT Huey and Hall (1989) 94°C, 1 min 45°C, 0.2 min 72°C, 2 min 40
RAPD1 AGC AGG GTC G Cocconcelli et al. (1995) 94°C, 1 min 29°C, 1 min 72°C, 2 min 20
RAPD2 AGC AGC GTG G 94°C, 0.5 min 55°C, 0.5 min 72°C, 0.3 min 45

*All PCR programs included a first step of 94°C, 5 min and a final extension at 72°C, 5 min.