. Author manuscript; available in PMC: 2014 Aug 1.

Published in final edited form as: J Acquir Immune Defic Syndr. 2013 Aug 1;63(4):428–437. doi: 10.1097/QAI.0b013e31828ac85f

TABLE 2.

In situ hybridization signals for cellular and pathogen RNAs in macaque HiLNs

	Uninfected						Acute		Clinical latency		AIDS
	6202	7102	13402	13502	5702	7402	6002	7902	13002	13102	5802	5902	7002	12402^b	12602^b	12802^b
CXCL9/Mig	++^a	++	++	++	++	++	+++	+++	+++	+++	+++	+++	+++	+++	+++	+++
CXCL10/IP-10	+	++	++	+	++	++	+++	+++	+++	+++	+++	+++	+++	+++	+++	++
CXCL11/I-TAC	+	+	+	+	+	+	+++	+++	++	+++	+++	+	+++	+++	+++	++
CCL2/MCP1	+/−	+	++	+	++	++	+++	+++	+++	+++	+++	++	+++	+++	+++	+++
CCL3/MIP-1α	+	+	+	+/−	+	+	+++	+++	++	+++	+++	−	++	+++	+++	++
CCL5/RANTES	++	++	+	−	−	−	−	+++	+++	+++	+++	−	+++	+++	+++	+++
CCL20/MIP-3α	+++	+++	+++	++	+++	+++	+++	+++	++	+++	+	+/−	+	++	+	++
CCL21/6Ckine	+++	+++	+++	+++	+++	+++	+++	+++	+++	+++	+++	+++	+++	+++	+++	+++
IFN-γ	−	+/−	+/−	+	+	+/−	++	+++	++	++	+	+	++	+++	++	++
IL-10	+	+	+	+	+	++	++	++	++	++	++	+	++	+++	+++	++
P.carinii	−	−	nd^c	nd	nd	nd	−	nd	−	nd	−	−	−	+++	++	+++
SIV	−	−	−	−	−	−	+++	+++	+	+++	+++	++	+	++	+	++

ISH was performed with antisense and control sense 35S-labeled riboprobes specific for the indicated host gene-specific mRNA, SIV mRNA, or P. carinii rRNA. -, no signal detected; +/-, rare mRNA+ cells in entire tissue section; +, 1-5 mRNA+ cells per 200X field; ++, 6-10 mRNA+ cells per 200X field; +++, >10 mRNA+ cells per 200X field.

These three macaques had clear histologic evidence of severe P. carinii pneumonia (PCP), as detailed in ref. 5.

nd, not done.