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. 2013 Jun 20;8(6):e66386. doi: 10.1371/journal.pone.0066386

Table 4. Metabolite concentrations (µmol/gCDW) in the wild-type E. coli Nissle 1917, ΔcsrBC and ΔcsrA51 mutants.

Glucose Gluconate
Metabolite wild-type ΔcsrBC ΔcsrA51 wild-type ΔcsrBC ΔcsrA51
1,3-diPGa 2.28±1.06 3.89±3.76 1.90±0.15 4.45±0.56 3.30±3.00 3.68±0.73
2/3-PG 1.42±0.11 1.67±0.52 1.12±0.23 4.20±0.33 4.66±0.45 2.66±0.20
6PG 0.38±0.09 0.38±0.07 0.77±0.20 3.59±0.21 2.33±0.55 0.65±0.79
ADP 0.71±0.06 0.82±0.25 0.91±0.27 0.95±0.28 1.01±0.35 0.80±0.19
AMP 0.16±0.03 0.11±0.09 0.21±0.06 0.20±0.05 0.40±0.10 0.17±0.02
ATP 3.50±0.29 3.21±0.03 2.86±0.48 3.51±0.15 4.08±0.15 2.95±0.24
cAMP 0.01±0.02 0.00±0.02 0.01±0.01 0.01±0.01 0.01±0.01 0.01±0.03
Cit 1.01±0.90 0.81±0.33 0.40±0.14 0.27±0.10 0.35±0.25 0.57±1.05
F1P 0.03±0.01 0.04±0.01 0.02±0.01 0.19±0.11 0.21±0.05 0.14±0.05
F6P 0.44±0.03 0.41±0.03 0.90±0.08 0.26±0.02 0.19±0.03 0.19±0.01
FBP 2.01±0.55 2.30±0.12 1.44±0.32 2.95±0.47 2.51±0.14 1.82±0.09
Fum 0.59±0.34 0.56±0.16 0.44±0.09 0.75±0.26 0.72±0.10 0.63±0.15
G6P 1.78±0.19 1.93±0.61 2.00±0.40 0.97±0.70 0.48±0.05 0.39±0.05
M6P 0.26±0.04 0.26±0.04 0.56±0.17 0.05±0.03 0.12±0.01 0.15±0.01
Mal 1.82±0.45 0.93±0.30 0.95±0.30 1.64±0.57 2.29±0.29 2.35±0.67
PEP 0.19±0.05 0.21±0.08 0.21±0.05 0.49±0.05 0.54±0.12 0.49±0.11
R1P 0.02±0.01 0.01±0.001 0.01±0.01 7.81±0.81 42.2±9.2 17.9±4.3
R5P 0.75±0.06 0.73±0.28 0.71±0.15 1.93±0.45 2.60±0.16 3.38±0.41
S7Pa 4.63±0.31 4.17±1.19 12.8±1.5 19.9±1.5 27.8±2.5 52.9±2.7
Suc 4.44±0.27 5.34±1.52 1.98±0.46 3.34±0.38 5.58±0.85 6.69±0.56
UDP-Glucose 4.6 5±0.14 4.86±0.47 5.20±0.47 2.86±0.31 3.79±0.57 2.14±0.56

Values represent the mean ± standard deviation of three independent biological replicates.

a

For these metabolites only the 12C/13C ratio is given. This ratio represents the concentration of the metabolite in samples relative to the IDMS standard, which added at the same amounts in all samples.