Table 1.
Straina | Origin | Typeb | Yr | MIC (μg/ml) | Mutationc in QRDR of: |
vlhA type | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ParC |
ParE |
GyrA |
GyrB |
|||||||||||
79 | 80 | 81 | 84 | 420 | 454 | 87 | 401 | 402 | ||||||
WVU1853 | USA | C | 1955 | 0.5 | Asp | Thr | Ser | Asp | Asp | Glu | Asn | Ser | Ser | 19 |
FMT | USA | C | <1980 | 0.5 | Asp | Thr | Ser | Asp | Asp | Asp | Asn | Ser | Ser | 20 |
AMS-5 | Austria | MT | 2009 | 0.03 | Asp | Thr | Ser | Asp | Asp | Asp | Asn | Ser | Ser | 1 |
AMS-8 | Austria | BB | 2010 | 0.06 | Asp | Thr | Ser | Asp | Asp | Glu | Asn | Ser | Ser | 2 |
AMS-9 | Austria | BB | 2010 | 0.06 | Asp | Thr | Ser | Asp | Asp | Glu | Asn | Ser | Ser | 3 |
AMS-10 | Austria | MT | 2010 | 0.06 | Asp | Thr | Ser | Asp | Asp | Glu | Asn | Ser | Ser | 2 |
AMS-11 | Austria | MT | 2011 | 0.06 | Asp | Thr | Ser | Asp | Asp | Glu | Asn | Ser | Ser | 2 |
AMS-12 | Austria | MT | 2011 | 0.06 | Asp | Thr | Ser | Asp | Asp | Glu | Asn | Ser | Ser | 2 |
AMS-3 | Austria | BB | 2009 | 0.06 | Asp | Thr | Ser | Asp | NT | NT | Asn | Ser | Ser | 2 |
AMS-4 | Austria | BB | 2009 | 0.06 | Asp | Thr | Ser | Asp | Asp | Glu | Asn | Ser | Ser | 2 |
NJ-1998d | Israel | MT | 1998 | 0.125 | Asp | Thr | Ser | Asp | Asp | Asp | Asn | Ser | Ser | 4 |
MES-2 | Israel | MT | 1999 | 0.125 | Asp | Thr | Ser | Asp | NT | NT | Asn | Ser | Ser | 4 |
TF-4C | Israel | TB | 2000 | 0.125 | Asp | Thr | Ser | Asp | Asp | Asp | Asn | Ser | Ser | 4 |
NJR-1D | Israel | TB | 2008 | 0.125 | Asp | Thr | Ser | Asp | Asp | Glu | Asn | Tyr | Ser | 5 |
CK-7 | Israel | BB | 2009 | 0.125 | Asp | Thr | Ser | Asp | Asp | Asp | Asn | Ser | Ser | 4 |
AMS-6 | Austria | MT | 2009 | 0.125 | Asp | Thr | Ser | Asp | NT | NT | Asn | Ser | Ser | 2 |
TK-2d | Israel | MT | 1997 | 0.25 | Asp | Thr | Ser | Asp | Asp | Asp | Asn | Ser | Ser | 4 |
EB-11B | Israel | TB | 2000 | 0.25 | Asp | Thr | Ser | Asp | Asp | Asp | Asn | Ser | Ser | 4 |
IB-1D | Israel | TB | 2001 | 0.25 | Asp | Thr | Ser | Asp | Asp | Asp | Asn | Tyr | Ser | 6 |
FB-8 | Israel | TB | 2001 | 0.25 | Asp | Thr | Ser | Asp | Asp | Asp | Asn | Ser | Ser | 7 |
SMA-22 | Israel | TB | 2002 | 0.25 | Asp | Thr | Ser | Asp | Asp | Glu | Ser | Ser | Ser | 7 |
KYZ-2 | Israel | TB | 2003 | 0.25 | Asp | Thr | Ser | Asp | Asp | Glu | Asn | Ser | Ser | 5 |
RAM-6G | Israel | TB | 2005 | 0.25 | Asp | Thr | Ser | Asp | Asp | Glu | Asn | Ser | Ser | 5 |
ODS-2A | Israel | MT | 2007 | 0.25 | Asp | Thr | Ser | Asp | Asp | Asp | Asn | Ser | Ser | 4 |
AMS-2 | Austria | BB | 2009 | 0.25 | Asp | Thr | Ser | Asp | Asn | Glu | Asn | Ser | Ser | 3 |
MSH-19 | Israel | L | 1995 | 0.25 | Asp | Thr | Ser | Asp | Asp | Asp | Asn | Tyr | Ser | 8 |
IZSVE/4564 | Italy | B | 2010 | 0.25 | Asp | Thr | Ser | Asp | Asp | Asp | Asn | Tyr | Ser | 9 |
SB-5Ad | Israel | TB | 2000 | 0.5 | Asp | Thr | Ser | Asp | Asp | Asp | Asn | Ser | Ser | 4 |
RAC-19 | Israel | TB | 2000 | 0.5 | Asp | Thr | Ser | Asp | Asp | Asp | Asn | Tyr | Ser | 4 |
JS-2 | Israel | TB | 2001 | 0.5 | Asp | Thr | Ser | Asp | Asp | Asp | Asn | Ser | Ser | 4 |
ASM-2d | Israel | MT | 2002 | 0.5 | Asp | Thr | Ser | Asp | Asp | Asp | Asn | Ser | Ser | 4 |
OR-2d | Israel | MT | 2002 | 0.5 | Asp | Thr | Ser | Asp | Asn | Asp | Asn | Ser | Ser | 4 |
IZSVE/4383/11 | Italy | BB | 2011 | 1 | Asp | Thr | Ser | Asp | Asn | Asp | Asn | Ser | Asn | 10 |
FTF-8C | Israel | TB | 2000 | 1 | Asn | Thr | Ser | Asp | Asp | Asp | Asn | Ser | Ser | 4 |
NBR-12D | Israel | TB | 2006 | 1 | Asn | Thr | Ser | Asp | Asp | Asp | Asn | Ser | Ser | 11 |
HVL-1d | Israel | MT | 1996 | 1 | Asp | Ala | Ser | Asp | Asp | Asp | Asn | Ser | Ser | 4 |
ASB-19B | Israel | TB | 2001 | 1 | Asp | Thr | Pro | Asp | Asp | Asp | Asn | Ser | Ser | 4 |
ASH-2H | Israel | MT | 2006 | 1 | Asp | Thr | Pro | Asp | Asp | Asp | Asn | Ser | Ser | 4 |
NGA-3D | Israel | B | 2004 | 2 | Asp | Thr | Pro | Asp | NT | NT | Asn | Ser | Ser | 4 |
FYZ-7D | Israel | TB | 2004 | 2 | Asp | Thr | Pro | Asp | Asp | Asp | Asn | Ser | Ser | 4 |
ODP-12 | Israel | MT | 2007 | 2 | Asp | Thr | Pro | Asp | Asp | Asp | Asn | Ser | Ser | 4 |
OZ-6 | Israel | MT | 2009 | 2 | Asp | Thr | Pro | Asp | Asp | Asp | Asn | Ser | Ser | 4 |
KLD-1 | Israel | BB | 2009 | 2 | Asp | Thr | Pro | Asp | Asp | Asp | Asn | Ser | Ser | 4 |
MTT | Israel | BB | 2011 | 2 | Asp | Thr | Ser | Asn | Asp | Asp | Asn | Ser | Ser | 12 |
AMS-7 | Austria | BB | 2010 | 4 | Asp | Ile | Ser | Asp | Asp | Asp | Asn | Ser | Ser | 10 |
HB-3 | Israel | MT | 2000 | 4 | Asp | Ile | Ser | Asp | Asp | Glu | Asn | Tyr | Ser | 4 |
BTU-4 | Israel | L | 2011 | 4 | Asp | Ile | Ser | Asp | Asp | Asp | Asn | Ser | Ser | 12 |
NT-3E | Israel | MT | 2002 | 4 | Asp | Ile | Ser | Asp | Asp | Asp | Asn | Ser | Ser | 4 |
KTY-8D | Israel | BB | 2009 | 4 | Asp | Thr | Ser | Tyr | Asp | Asp | Asn | Ser | Ser | 4 |
HL-1 | Israel | MT | 2007 | 4 | Asp | Thr | Ser | His | Asp | Asp | Asn | Tyr | Ser | 13 |
RMJ-1 | Israel | MT | 2007 | 4 | Asp | Thr | Ser | His | Asp | Asp | Asn | Tyr | Ser | 13 |
IZSVE/4761/20 | Italy | L | 2011 | 4 | Asp | Ile | Ser | Asp | Asp | Asp | Asn | Ser | Asn | 9 |
IZSVE/428/1 | Italy | BB | 2011 | 4 | Asp | Ile | Ser | Asp | Asp | Glu | Lys | Tyr | Ser | 14 |
NJK-09E | Israel | MT | 2009 | 8 | Asp | Ile | Ser | Asp | Asp | Asp | Asn | Ser | Ser | 12 |
ST-3H | Israel | MT | 2010 | 8 | Asp | Ile | Ser | Asp | Asp | Asp | Asn | Ser | Ser | 12 |
MSK-1 | Israel | MT | 2010 | 8 | Asp | Ile | Ser | Asp | Asp | Asp | Asn | Ser | Ser | 12 |
MZ-3 | Israel | BB | 2011 | 8 | Asp | Ile | Ser | Asp | Asp | Asp | Asn | Ser | Ser | 15 |
ALN-5F | Israel | MT | 2011 | 8 | Asp | Ile | Ser | Asp | Asp | Asp | Asn | Ser | Ser | 12 |
AMS-1 | Austria | BB | 2009 | 8 | Asp | Ile | Ser | Asp | Asp | Asp | Asn | Ser | Ser | 9 |
IZSVE/4558 | Italy | MT | 2010 | 8 | Asp | Ile | Ser | Asp | Asp | Asp | Asn | Ser | Ser | 9 |
IZSVE/1216/5 | Spain | L | 2012 | 8 | Asp | Ile | Ser | Asp | Asp | Asp | Asn | Ser | Ser | 16 |
IZSVE/700 | Belgium | L | 2011 | 8 | Asp | Ile | Ser | Asp | Asp | Asp | Asn | Ser | Asn | 10 |
IZSVE/701 | Belgium | L | 2011 | 8 | Asp | Ile | Ser | Asp | Asp | Asp | Asn | Tyr | Ser | 10 |
IZSVE/1184/2 | Spain | L | 2012 | 8 | Asp | Ile | Ser | Asp | Asp | Asp | Asn | Tyr | Ser | 16 |
IZSVE/4504 | Italy | BB | 2009 | 8 | Asp | Ile | Ser | Asp | Asp | Asp | Asn | Tyr | Ser | 17 |
IZSVE/3447/16 | Italy | L | 2011 | 8 | Asp | Ile | Ser | Asp | Asp | Glu | Asn | Tyr | Ser | 10 |
RAMP-16Gd | Israel | TB | 2003 | 8 | Asp | Thr | Ser | Tyr | Asp | Asp | Asn | Ser | Ser | 4 |
BLTF | Israel | TB | 2002 | 8 | Asp | Thr | Ser | Tyr | Asp | Asp | Asn | Ser | Ser | 4 |
IZSVE/86/2 | Italy | BB | 2012 | 16 | Asp | Ile | Ser | Asp | Asp | Asp | Asn | Ser | Ser | 10 |
IZSVE/71/7 | Italy | L | 2012 | 16 | Asp | Ile | Ser | Asp | Asp | Asp | Asn | Tyr | Ser | 9 |
IZSVE/1774/18 | Spain | BB | 2012 | 16 | Asp | Ile | Ser | Asp | Asp | Asp | Asn | Tyr | Ser | 4 |
IZSVE/1181/2 | Spain | B | 2012 | 16 | Asp | Ile | Ser | Asp | Asp | Asp | Asn | Tyr | Ser | 16 |
IZSVE/6642 | Italy | TB | 2011 | 16 | Asp | Ile | Ser | Asp | Asp | Glu | Asn | Ser | Ser | 18 |
IZSVE/2713/13 | Italy | L | 2011 | 16 | Asp | Ile | Ser | Asp | Asn | Asp | Asn | Tyr | Ser | 10 |
SBS | Israel | BB | 2011 | 16 | Asp | Ile | Ser | Asp | Asp | Asp | Ser | Ser | Ser | 15 |
The same superscript letter (A to H) indicates that the M. synoviae strains were isolated from the same farm or from closely located farms.
MT, meat-type turkey; TB, turkey breeder; BB, broiler breeder; B, broiler; L, layer; C, chicken.
Amino acid substitutions within the QRDRs in comparison to the reference strains are marked in bold. NT, not tested.
En MIC published by Gerchman et al. (8).