Table 1.

Empirical sizes and powers of various tests with nominal significance level α = 0.05 for simulated data with three correlation structures (compound symmetry (CS), AR-1 and random (Rand)) and 10 SNPs; n = 500

Corr	OR	Sco	SSU	SSUw	UminP	Sum	Test combination			Test selection
							MinP	Fisher	TPM
CS	1.0	0.045	0.043	0.044	0.046	0.051	0.043	0.045	0.045	0.059
	1.2	0.057	0.080	0.077	0.077	0.098	0.079	0.084	0.080	0.100
	1.4	0.085	0.193	0.199	0.149	0.235	0.153	0.193	0.198	0.201
	1.6	0.139	0.356	0.358	0.237	0.393	0.255	0.353	0.357	0.372
	1.8	0.245	0.519	0.518	0.365	0.577	0.405	0.504	0.520	0.540
	2.0	0.346	0.662	0.661	0.489	0.711	0.546	0.644	0.663	0.665
AR-1	1.0	0.051	0.048	0.048	0.040	0.055	0.043	0.046	0.050	0.063
	1.2	0.077	0.125	0.124	0.109	0.132	0.111	0.129	0.131	0.145
	1.4	0.182	0.352	0.354	0.296	0.350	0.298	0.356	0.354	0.361
	1.6	0.356	0.577	0.585	0.512	0.599	0.516	0.582	0.585	0.584
	1.8	0.543	0.785	0.783	0.712	0.797	0.720	0.784	0.781	0.774
	2.0	0.719	0.901	0.896	0.849	0.894	0.848	0.898	0.901	0.899
Rand	1.0	0.047	0.046	0.044	0.052	0.044	0.052	0.053	0.049	0.065
	1.2	0.076	0.114	0.116	0.086	0.134	0.086	0.116	0.121	0.137
	1.4	0.141	0.284	0.281	0.207	0.319	0.216	0.273	0.284	0.312
	1.6	0.238	0.500	0.505	0.357	0.546	0.392	0.495	0.507	0.508
	1.8	0.378	0.721	0.718	0.531	0.753	0.585	0.708	0.720	0.717
	2.0	0.517	0.836	0.837	0.687	0.863	0.742	0.830	0.836	0.837