Skip to main content
. 2013 Aug;94(Pt 8):1791–1806. doi: 10.1099/vir.0.053686-0

Table 1. Limits of intra- and inter- clade VP1 p-distance for HRV-A, -B and -C.

New HRV types defined on the basis of sequence divergence in VP1 are indicated in bold.

Type Intra* Inter†
A1 0.0906 0.1185
A1B 0.1092 0.1185
A2 0.1060 0.1407
A7 0.0046 0.1816
A8 0.0035 0.0153
A9 0.1085 0.1476
A10 0.0999 0.1701
A11 0.0000 0.1722
A12 0.0999 0.2625
A13 0.0816 0.1713
A15 0.1034 0.1638
A16 0.0889 0.1719
A18 0.0859 0.1754
A19 0.0977 0.2272
A20 0.0999 0.1504
A21 0.0952 0.2054
A22 0.1133 0.1903
A23 0.1072 0.1429
A24 0.0760 0.1310
A25 0.0059 0.0934
A28 0.1123 0.2280
A29 0.0072 0.0724
A30 0.1107 0.1429
A31 0.1166 0.1404
A32 0.0012 0.1476
A33 0.1026 0.1608
A34 0.0964 0.1580
A36 0.1150 0.1200
A38 0.0943 0.1916
A39 0.0094 0.2340
A40 0.1214 0.1597
A41 0.0057 0.1713
A43 0.1096 0.1606
A44 0.0072 0.0724
A45 0.0813 0.2521
A46 0.0057 0.2027
A47 0.1216 0.1404
A49 0.1001 0.1407
A50 0.0023 0.1580
A51 0.0991 0.1903
A53 0.1027 0.2220
A54 0.0872 0.1072
A55 0.0557 0.2066
A56 0.0000 0.2006
A57 0.0000 0.1285
A58 0.0862 0.1567
A59 0.0897 0.1362
A60 0.0977 0.1965
A61 0.1017 0.1804
A62 0.0071 0.0934
A63 0.0000 0.1737
A64 0.0058 0.1580
A65 0.0653 0.1903
A66 0.0845 0.1302
A67 0.0946 0.1778
A68 0.1044 0.1504
A71 0.0045 0.1719
A73 0.0034 0.1822
A74 0.0058 0.1638
A75 0.0785 0.1606
A76 0.0921 0.1608
A77 0.0012 0.1852
A78 0.1162 0.2625
A80 0.0871 0.2027
A81 0.1298 0.1719
A82 0.1050 0.1951
A85 0.0058 0.1597
A88 0.0011 0.1816
A89 0.0879 0.1200
A90 0.0000 0.1743
A94 0.0000 0.1580
A95 0.0000 0.0153
A96 0.0000 0.1804
A98 0.0000 0.1072
A100 0.0000 0.1468
A101 0.0611 0.2608
A102 0.0000 0.1509
A103 0.0685 0.2162
A104 0.0000 0.1310
A105 0.0671 0.1285
A106 0.0000 0.1719
B3 0.0045 0.2176
B4 0.0938 0.1957
B5 0.0139 0.1667
B6 0.0881 0.1134
B14 0.0178 0.1862
B17 0.0068 0.1242
B26 0.0022 0.1863
B27 0.0034 0.1762
B35 0.0134 0.1910
B37 0.0782 0.1474
B42 0.0984 0.1667
B48 0.1101 0.1876
B52 0.0057 0.1209
B69 0.1017 0.1810
B70 0.1160 0.1242
B72 0.0992 0.1862
B79 0.0046 0.1924
B83 0.0884 0.1695
B84 0.1013 0.2226
B86 0.1048 0.2184
B91 0.0846 0.1427
B92 0.0046 0.1695
B93 0.0024 0.1762
B97 0.0035 0.1937
B99 0.0012 0.1817
B100 0.0000 0.1655
B101 0.0157 0.1627
B102 0.0000 0.1627
B103 0.0351 0.1134
B104 0.0845 0.1209
C1 0.0515 0.2293
C2 0.0569 0.1650
C3 0.0388 0.1460
C4 0.0158 0.1394
C5 0.0421 0.1704
C6 0.0663 0.1460
C7 0.0751 0.1516
C8 0.1315 0.2196
C9 0.1103 0.2818
C10 0.0368 0.2049
C11 0.0000 0.1704
C12 0.1007 0.1965
C13 0.0045 0.2640
C14 0.0000 0.2147
C15 0.0917 0.2714
C16 0.0440 0.1473
C17 0.0175 0.1473
C18 0.0527 0.1925
C19 0.0724 0.3017
C20 0.0073 0.1510
C21 0.0098 0.1516
C22 0.0368 0.2500
C23 0.0813 0.2699
C24 0.0000 0.2274
C25 0.1088 0.2274
C26 0.0394 0.2611
C27 0.0308 0.2239
C28 0.0348 0.1925
C29 0.0000 0.2390
C30 0.0000 0.1842
C31 0.0000 0.2196
C32 0.0282 0.1357
C33 0.0209 0.1890
C34 0.0266 0.1510
C35 0.0000 0.3263
C36 0.1111 0.2564
C37 0.0000 0.2069
C38 0.0344 0.1735
C39 0.0257 0.1357
C40 0.0702 0.1650
C41 0.0748 0.1842
C42 0.0856 0.2407
C43 0.1157 0.2466
C44 0.0000 0.1965
C45 0.0428 0.2390
C46 0.0000 0.2564
C47 0.0000 0.2217
C48 0.0000 0.1890
C49 0.0311 0.1394
C50 0.0000 0.2859
C51 0.0049 0.2069
*

Maximum VP1 p-distance observed within a bootstrap-supported phylogenetic clade or putative type.

Minimum VP1 p-distance observed between one particular bootstrap-supported phylogenetic clade and its nearest neighbour.

In cases where contemporary strains group separately from prototype strains of two types, which should potentially be combined (A29/A44), the p-distance listed involves the prototype strains only.