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. 2012 Aug 1;13:67. doi: 10.1186/1471-2156-13-67

Table 7.

Estimated QTL-specific (multiplied by 105) genotypic variance-covariance matrix between traits PC1 and ADJPC1

    QTL                                                              
Traits
QTL
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
PC1
1
0.11
0.93
0.12
1.49
0.00
0.08
0.01
0.07
0.00
0.03
0.00
-0.01
0.00
0.05
0.01
0.07
0.00
-0.02
-0.01
-0.11
-0.03
-0.28
-0.01
-0.13
0.01
0.06
-0.01
-0.10
-0.01
-0.05
0.00
0.02
0.00
0.03
ADJ
 
0.93
7.69
1.49
16.20
0.08
1.06
0.07
0.64
0.03
0.30
-0.01
0.11
0.05
0.57
0.07
0.54
-0.02
-0.16
-0.11
-1.32
-0.28
-2.44
-0.13
-1.74
0.06
0.61
-0.10
-1.23
-0.05
-0.39
0.02
0.21
0.03
0.28
PC1
2
 
 
0.08
1.21
0.00
0.00
0.00
0.00
0.00
0.02
0.00
-0.03
0.01
0.10
0.01
0.09
0.00
0.02
0.00
0.05
-0.01
-0.16
0.00
-0.05
0.01
0.20
-0.01
-0.13
-0.01
-0.10
0.00
0.00
-0.01
-0.10
ADJ
 
 
 
1.21
19.13
0.00
-0.05
0.00
0.05
0.02
0.26
-0.03
0.17
0.10
1.57
0.09
0.92
0.02
0.29
0.05
0.81
-0.16
-1.83
-0.05
-1.09
0.20
2.66
-0.13
-2.57
-0.10
-1.00
0.00
0.04
-0.10
-1.36
PC1
3
 
 
 
 
0.01
0.52
0.05
1.30
0.02
0.47
0.00
0.09
0.00
-0.03
0.00
-0.04
0.00
0.07
0.00
-0.02
-0.01
-0.22
0.00
-0.08
-0.01
-0.28
0.00
-0.01
0.00
0.04
0.00
0.04
0.00
-0.04
ADJ
 
 
 
 
 
0.52
21.64
1.30
24.16
0.47
9.37
0.09
-0.57
-0.03
-0.63
-0.04
-0.51
0.07
1.06
-0.02
-0.55
-0.22
-3.36
-0.08
-3.13
-0.28
-5.17
-0.01
-0.20
0.04
0.49
0.04
0.70
-0.04
-0.72
PC1
4
 
 
 
 
 
 
0.10
1.18
0.07
0.92
0.03
0.15
0.00
0.00
-0.01
-0.05
0.01
0.11
0.00
-0.02
-0.03
-0.32
-0.01
-0.16
-0.02
-0.24
0.01
0.13
0.01
0.07
0.01
0.06
0.00
-0.03
ADJ
 
 
 
 
 
 
 
1.18
14.08
0.92
11.44
0.15
-1.12
0.00
-0.03
-0.05
-0.45
0.11
1.14
-0.02
-0.36
-0.32
-3.32
-0.16
-2.94
-0.24
-2.88
0.13
2.22
0.07
0.64
0.06
0.68
-0.03
-0.41
PC1
5
 
 
 
 
 
 
 
 
0.02
0.31
0.03
0.13
0.00
0.04
0.00
-0.01
0.00
0.05
0.00
-0.02
-0.01
-0.13
0.00
-0.07
-0.01
-0.10
0.00
0.05
0.00
0.03
0.00
0.03
0.00
0.03
ADJ
 
 
 
 
 
 
 
 
 
0.31
4.06
0.13
-0.93
0.04
0.57
-0.01
-0.05
0.05
0.50
-0.02
-0.39
-0.13
-1.40
-0.07
-1.44
-0.10
-1.19
0.05
0.83
0.03
0.32
0.03
0.37
0.03
0.38
PC1
6
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
0.07
-0.20
0.02
0.16
0.01
0.02
0.00
-0.01
-0.01
-0.06
-0.01
-0.02
0.00
-0.01
0.00
0.00
0.00
0.05
0.00
0.01
0.00
0.01
0.00
0.01
ADJ
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
-0.20
0.57
0.16
-1.08
0.02
-0.17
-0.01
0.08
-0.06
0.39
-0.02
0.16
-0.01
0.08
0.00
0.03
0.05
-0.33
0.01
-0.05
0.01
-0.07
0.01
-0.09
PC1
7
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
0.03
0.49
0.03
0.32
0.00
0.01
0.00
0.08
0.00
0.03
0.00
0.02
0.00
0.02
0.00
-0.10
0.00
-0.05
0.00
-0.03
-0.01
-0.11
ADJ
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
0.49
7.76
0.32
3.09
0.01
0.09
0.08
1.38
0.03
0.30
0.02
0.35
0.02
0.21
-0.10
-2.07
-0.05
-0.56
-0.03
-0.41
-0.11
-1.61
PC1
8
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
0.03
0.22
0.00
0.00
0.00
0.04
0.00
-0.02
0.00
0.00
0.00
0.03
0.00
-0.04
0.00
-0.01
0.00
-0.01
0.00
-0.02
ADJ
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
0.22
1.54
0.00
0.01
0.04
0.37
-0.02
-0.13
0.00
0.01
0.03
0.26
-0.04
-0.44
-0.01
-0.11
-0.01
-0.04
-0.02
-0.15
 
9
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
0.03
0.30
0.08
1.24
0.04
0.34
0.01
0.15
-0.01
-0.08
0.00
0.01
0.00
0.00
0.00
0.00
0.00
0.00
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
0.30
2.88
1.24
16.13
0.34
3.25
0.15
2.34
-0.08
-0.85
0.01
0.14
0.00
0.00
0.00
-0.01
0.00
-0.05
 
10
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
0.12
2.32
0.13
1.93
0.02
0.73
0.02
0.29
0.00
0.06
0.00
-0.01
0.00
-0.04
-0.01
-0.20
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
2.32
45.50
1.93
24.29
0.73
18.94
0.29
4.25
0.06
1.36
-0.01
-0.07
-0.04
-0.61
-0.20
-3.05
 
11
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
0.18
1.64
0.07
1.66
0.15
1.58
0.01
0.27
0.01
0.08
0.00
-0.01
-0.01
-0.14
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
1.64
15.19
1.66
24.92
1.58
16.29
0.27
3.81
0.08
0.68
-0.01
-0.14
-0.14
-1.48
 
12
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
0.01
0.38
0.05
1.16
0.00
0.14
0.00
0.07
0.00
0.00
0.00
-0.07
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
0.38
14.74
1.16
20.87
0.14
4.55
0.07
0.89
0.00
-0.04
-0.07
-1.41
 
13
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
0.27
3.12
0.05
0.91
0.04
0.39
0.01
0.17
0.01
0.09
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
3.12
36.41
0.91
15.12
0.39
3.66
0.17
1.89
0.09
1.06
 
14
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
0.02
0.53
0.04
0.70
0.02
0.31
0.01
0.31
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
0.53
15.11
0.70
8.66
0.31
5.01
0.31
5.53
 
15
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
0.04
0.29
0.03
0.30
0.04
0.38
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
0.29
2.27
0.30
2.82
0.38
3.73
 
16
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
0.02
0.18
0.05
0.57
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
0.18
2.03
0.57
6.83
 
17
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
0.11
1.44
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
1.44
18.55
 
Total
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
2.36
31.48
                                                                    31.48 453.20