Table 4.
Detailed Description of Observed Inconsistencies between Maps and DNA Sequence
No. of |
|||||
Map | Inversionsa | InconsistentGroups (Markers)a | Misplaced Markers | Misplaced Marker | EstimatedDisplacement(Mb)b |
Généthon | 2 | 0 (0) | 3 | D22S1175 | −15.7 |
D22S1155 | +1.9 | ||||
D22S277 | −.25 | ||||
Marshfield | 3 | 0 (0) | 7 | D22S1175 | −15.2 |
D22S534 | −7.6 | ||||
D22S529 | +2.2 | ||||
D22S531 | −1.3 | ||||
D22S444 | −.346 | ||||
D22S1163 | −.329 | ||||
D22S533 | −.466 | ||||
GM99-G3 | 1 | 4 (27) | 4 | D22S1154 | −2.1 |
D22S1144 | +1.6 | ||||
D22S1556 | +1.3 | ||||
SHGC-30811 | +.472 | ||||
SHGC | 1 | 5 (27) | 8 | D22S597 | −9.5 |
D22S1154 | −2.2 | ||||
D22S1132 | −2.1 | ||||
SGC34055 | −.98 | ||||
D22S1556 | −.929 | ||||
D22S678 | −.925 | ||||
D22S1674 | +.828 | ||||
SHGC-7765 | +.242 | ||||
GM99-GB4 | 3 | 8 (72) | 10 | D22S927 | −24 |
KIAA0015 | +2.3 | ||||
stSG50626 | +2.0 | ||||
Ib1320 | +.736 | ||||
EMBL-T95789 | −.590 | ||||
stSG30356 | −.391 | ||||
TIGR-A004X26 | −.383 | ||||
D22S1257 | −.216 | ||||
sts-N72133 | +.211 | ||||
stSG4190 | −.203 | ||||
WI | 2 | 9 (120) | 4 | SGC34075 | +3.8 |
SHGC-31563 | +3.0 | ||||
TIGR-A002E09 | −1.2 | ||||
WI-15873 | −.195 | ||||
LDB | NA | NA | 7 | D22S1175 | −15.4 |
SSTR3 | −9.6 | ||||
D22S1263 | +5.1 | ||||
D22S534 | −6.4 | ||||
sts-T83848 | +5.2 | ||||
SGC34075 | +6.8 | ||||
D22S1033 | −4.6 | ||||
UDB | NA | NA | 6 | D22S927 | −23.7 |
D22S418 | −16 | ||||
D22S597 | −9.8 | ||||
SGC34075 | +8.6 | ||||
stSG44859 | +8.5 | ||||
A005T29 | −7.3 |
NA = inconsistencies too complex to characterize.
+ = positive displacements (map position closer to telomere than sequence position); − = negative displacements.