Table 2. Primer sequences used for synthesising the codon-optimised endochitinase cDNA.
Primer name | Sequence |
---|---|
F1 | 5′-GGGCCCGAATTCGCTAGTGGTTACGCTAACGCTGTTTACTTTACTAACTGGGGTATTTACGGT-3′ |
F2 | 5′-ACTGGGGTATTTACGGTCGTAACTTTCAACCACAAAACCTTGTTGCTTCTGATATTACT-3′ |
F3 | 5′-TGTTGCTTCTGATATTACTCATGTTATTTACTCTTTTATGAACTTTCAAGCTGATGGTACT-3′ |
F4 | 5′-TTCAAGCTGATGGTACTGTTGTTTCTGGTGATGCTTACGCTGATTACCAAAAGCATTAC-3′ |
F5 | 5′-ATTACCAAAAGCATTACGATGATGATTCTTGGAACGATGTTGGTAACAACGCTTACGGT-3′ |
F6 | 5′-GTAACAACGCTTACGGTTGTGTTAAGCAACTTTTTAAGTTGAAGAAGGCTAACCGTAAC-3′ |
F7 | 5′-AGAAGGCTAACCGTAACTTGAAGGTTATGCTTTCTATTGGTGGTTGGACTTGGTCTACT-3′ |
F8 | 5′-GTTGGACTTGGTCTACTAACTTTCCATCTGCTGCTAGTACTGATGCTAACCGTAAGAAC-3′ |
F9 | 5′-ATGCTAACCGTAAGAACTTTGCTAAGACTGCTATTACTTTTATGAAGGATTGGGGTTTT-3′ |
F10 | 5′-TGAAGGATTGGGGTTTTGATGGTATTGATGTTGATTGGGAATACCCAGCTGATGATACT-3′ |
F11 | 5′-ACCCAGCTGATGATACTCAAGCTACTAACATGGTTCTTCTTCTTAAGGAAATTCGTTCT-3′ |
F12 | 5′-TTAAGGAAATTCGTTCTCAACTTGATGCTTACGCTGCTCAATACGCTCCAGGTTACCAT-3′ |
F13 | 5′-ACGCTCCAGGTTACCATTTTCTTCTTTCTATTGCTGCTCCAGCTGGTCCAGAACATTAC-3′ |
F14 | 5′-CAGCTGGTCCAGAACATTACTCTTTTCTTCATATGTCTGATCTTGGTCAAGTTCTTGAT-3′ |
R1 | 5′-GGGCCCAGCGGCCGCTTAGTTAAGACCACTACGAATGTTATCGTATTGAGAGTT-3′ |
R2 | 5′-TTATCGTATTGAGAGTTTGGGTAACCAAGCAAGTTTTGAGTAGAATCAAGACTACCAAG-3′ |
R3 | 5′-GAATCAAGACTACCAAGAGCTCTATGACTAGTACCAATCAAAGAATCAGAACCAGTCTT-3′ |
R4 | 5′-GAATCAGAACCAGTCTTATCAGCAGAAGCTTCCCAAAACATACTACCACCAAGACCAAG-3′ |
R5 | 5′-CTACCACCAAGACCAAGGTTCTTAAGGTAAGAAACCTTAGTGTTAATCATAGCTGGAGT-3′ |
R6 | 5′-TTAATCATAGCTGGAGTATCAAAAGAAATAAGTTCCTTACTACTTGGATCGTAACTGTA-3′ |
R7 | 5′-CTTGGATCGTAACTGTAGTAAGCTTGAGCAGTAGAATCGTATTGAACAGTAGCACCAGC-3′ |
R8 | 5′-TGAACAGTAGCACCAGCCTTTGGAAGAACCTTGTAATCCCAAATACCGTTTTCCCAACT-3′ |
R9 | 5′-ATACCGTTTTCCCAACTACCAGAACCAATACCACTGTAAGTTTGACCAATACCACCAGT-3′ |
R10 | 5′-TGACCAATACCACCAGTACTTTCAAAAGAACGACCGTAAATTGGCATACCAAGAACAAT-3′ |
R11 | 5′-GGCATACCAAGAACAATCTTACTAGCTGGAACACCACCCTTAATGTAATCCTTAATAGC-3′ |
R12 | 5′-ATGTAATCCTTAATAGCTTGATCAGTGTTGTATGGAGAAGAGTTAGAGTTAGATGGGTT-3′ |
R13 | 5′-TTAGAGTTAGATGGGTTAGCAAACAAGTTAGCATCATGACCAGAGTAACTACTCCAAGA-3′ |
R14 | 5′-GAGTAACTACTCCAAGAACCAGCGTAATCGTAAGCCATAAGGTTAACGTAATCAAGAACTTGACCAA-3′ |
The underlined letters in F1 and R1 are the EcoRI and NotI restriction sites, respectively.