Table 2.

MICs and RE of genes harboring efflux pumps^c

Straina	MICd (mg/liter)										REb
	TIG	GEN	AMK	DOX	MIN	NET	TET	RIF	TOB	DOR	adeB	adeJ	adeG	craA	abeM	amvA
65	≤0.25	8	<2	16	2	1	>64	2	1	4	1.13	3.10	1.00	0.43	0.21	0.002
34	0.5	2	32	32	2	>64	>64	64	32	8	27.73	0.55	0.70	1.31	0.60	0.003
35	0.5	4	16	32	2	>64	>64	64	64	8	31.97	0.40	0.82	1.12	0.66	0.003
37	0.5	4	16	32	2	>64	>64	64	32	8	28.10	0.42	0.70	1.25	0.78	0.003
41	0.5	4	32	16	2	>64	>64	64	64	4	26.89	0.57	0.66	1.34	0.50	0.003
51	0.5	4	16	32	4	>64	>64	64	64	8	16.21	1.62	0.41	0.65	0.70	0.004
53	0.5	4	16	32	4	>64	>64	64	32	8	17.03	1.06	0.49	0.70	0.48	0.003
55	0.5	4	16	32	4	>64	>64	64	64	8	18.25	1.38	0.85	0.64	0.37	0.004
57	0.5	4	16	32	4	>64	>64	64	64	8	10.43	4.69	0.37	0.70	0.78	0.003
78	0.5	32	<2	16	2	4	>64	64	<0.5	4	23.88	5.44	0.96	1.14	0.40	0.007
88	0.5	4	32	16	2	>64	>64	32	32	4	11.77	6.60	0.92	0.73	0.24	0.003
118	0.5	32	16	32	2	>64	>64	32	64	4	35.08	0.61	1.31	0.64	0.27	0.003
126	0.5	16	<2	2	4	4	>64	32	<0.5	4	1.77	1.06	1.27	0.64	0.32	0.004
36	1	4	16	32	2	>64	>64	64	64	4	32.25	0.61	0.80	1.03	0.69	0.004
38	1	4	32	32	2	>64	>64	64	64	8	30.51	1.34	0.78	1.14	0.51	0.002
58	1	4	32	32	4	>64	>64	64	64	8	26.93	2.20	0.44	0.85	0.45	0.005
83	1	2	32	32	4	>64	>64	64	32	4	33.76	7.98	1.37	0.80	0.19	0.002
84	1	2	32	32	4	>64	>64	64	64	4	13.45	10.02	1.08	0.85	0.24	0.003
86	1	64	8	32	4	32	>64	2	2	4	22.39	6.85	0.97	0.69	0.19	0.004
87	1	64	4	64	4	16	>64	2	2	4	43.48	6.82	0.92	0.67	0.08	0.003
89	1	>64	4	64	4	32	>64	64	64	4	7.25	5.61	1.17	0.89	0.21	0.003
90	1	2	16	64	4	>64	>64	64	32	8	20.86	10.33	1.00	0.72	0.23	0.004
110	1	2	16	16	4	>64	>64	32	64	4	30.22	5.18	1.25	0.31	0.30	0.003
111	1	2	16	16	2	>64	>64	32	32	4	9.86	5.39	1.55	0.31	0.21	0.003
112	1	2	8	16	2	>64	>64	32	32	8	11.45	3.06	1.23	0.21	0.18	0.36
113	1	2	<2	32	2	4	>64	32	<0.5	4	24.40	4.27	0.89	0.31	0.25	0.006
114	1	1	<2	32	2	4	>64	32	1	4	7.01	3.87	0.77	0.27	0.26	0.004
115	1	1	<2	16	2	4	>64	16	<0.5	4	30.32	3.13	0.82	0.75	0.19	0.003
119	1	32	16	32	2	>64	>64	32	32	4	43.01	0.60	1.23	0.54	0.33	0.003
120	1	32	16	16	2	>64	>64	32	32	4	35.43	0.66	0.75	0.65	0.19	0.003
124	1	4	64	64	4	>64	>64	32	64	4	46.58	0.72	0.79	0.63	0.30	0.004
125	1	4	16	32	8	>64	>64	64	32	4	32.77	8.97	0.45	0.70	0.30	0.005
56	2	2	<2	32	4	8	>64	64	1	8	21.05	5.82	0.48	0.87	0.38	0.003
64	2	64	4	32	2	16	>64	2	4	4	68.98	2.94	0.36	0.62	0.21	0.004
79	2	>64	4	16	1	16	>64	2	2	8	37.66	12.58	1.57	0.59	0.22	0.004
80	2	>64	8	32	4	32	>64	1	2	8	32.70	10.77	0.97	0.63	0.19	0.002
81	2	64	4	32	4	16	>64	2	2	4	46.54	11.16	0.92	0.86	0.18	0.002
82	2	64	<2	32	2	16	>64	1	1	4	27.63	10.04	1.00	0.97	0.15	0.002
101	2	2	16	32	4	>64	>64	32	32	4	12.44	4.13	1.25	0.24	0.13	0.003
102	2	2	16	32	4	>64	>64	32	32	4	8.91	7.26	1.17	0.36	0.28	0.005
106	2	2	8	64	8	>64	>64	64	32	4	12.06	10.55	1.38	0.76	0.31	0.006
107	2	2	32	64	8	>64	>64	64	32	4	16.38	10.80	0.91	0.25	0.32	0.004
108	2	4	32	64	8	>64	>64	64	32	8	23.92	10.94	1.07	0.21	0.29	0.002
109	2	4	32	64	8	>64	>64	64	32	8	23.37	6.32	0.68	0.32	0.22	0.003

^aStrains are ranked according to the MIC of tigecycline.

^bIncreased gene RE values of ≥2 are indicated in bold.

^cThe reference strain used was A. baumannii ATCC 17978. RNA (50 μg/ml) was from strains of the PFGE-ROC-1_OXA58 clone.

^dTIG, tigecycline; GEN, gentamicin; AMK, amikacin; DOX, doxycycline; MIN, minocycline; NET, netilmicin; TET, tetracycline; RIF, rifampin; TOB, tobramycin; DOR, doripenem.