Skip to main content
. 2013 Nov;17(11):844–848. doi: 10.1089/gtmb.2013.0264

Table 3.

Genotypic Distribution

 
Population
 
 
 
 
General
White
Pardo
Black
White vs. Pardo
Pardo vs. Black
Black vs. White
SNP genotype No. f No. f No. f No. f p p p
IκBL −62AT
 AA 80 0.428 49 0.454 20 0.345 11 0.524 0.197 0.299 0.411
 AT 82 0.439 42 0.389 31 0.534 9 0.429      
 TT 25 0.134 17 0.157 7 0.121 1 0.048      
 N/a 65                    
IκBL −262TC
 TT 126 0.783 75 0.806 33 0.688 18 0.900 0.191 0.046a 0.217
 TC 24 0.149 12 0.129 12 0.250 0      
 CC 11 0.068 6 0.065 3 0.063 2 0.100      
 N/a 91                    
TNFa −238GA
 GG 203 0.871 119 0.869 63 0.875 21 0.875 0.356 0.833 0.616
 GA 29 0.124 18 0.131 8 0.111 3 0.125      
 AA 1 0.004 0 1 0.014 0      
 N/a 19                    
TNFa −308GA
 GG 190 0.815 112 0.818 57 0.792 21 0.875 0.651 0.280 0.362
 GA 43 0.185 25 0.182 15 0.208 3 0.125      
 AA 0 0.000 0 0 0      
 N/a 19                    
LTa +80AC
 AA 14 0.106 9 0.123 2 0.057 3 0.125 0.520 0.586 0.668
 AC 87 0.659 49 0.671 24 0.686 14 0.583      
 CC 31 0.235 15 0.205 9 0.257 7 0.292      
 N/a 120                    
LTa +252AG
 AA 104 0.491 68 0.548 29 0.460 7 0.280 0.257 0.231 0.006a
 AG 95 0.448 52 0.419 29 0.460 14 0.560      
 GG 13 0.061 4 0.032 5 0.079 4 0.160      
 N/a 40                    
FAS −670AG
 AA 44 0.208 29 0.236 10 0.159 5 0.192 0.473 0.041a 0.016a
 AG 111 0.524 66 0.537 37 0.587 8 0.308      
 GG 57 0.269 28 0.228 16 0.254 13 0.500      
 N/a 40                    
FASL −844TC
 TT 50 0.236 28 0.228 12 0.190 10 0.385 0.781 0.048a 0.096
 TC 102 0.481 59 0.480 30 0.476 13 0.500      
 CC 60 0.283 36 0.293 21 0.333 3 0.115      
 N/a 40                    
a

Significant genotypic differences.

N/a, not available, not included in statistical calculations; f, frequency; p, significance value.