TABLE 3.
PCR amplification data for four MNR loci in the 72 ECOR strains
| Groupa | Strain | Amplificationb
|
Groupa | Strain | Amplificationb
|
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|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| YaiN | ycgW | b2345 | ykgE | Seq | YaiN | ycgW | b2345 | ykgE | Seq | |||||
| A | EC01 | + | + | + | + | Y | ||||||||
| EC02 | + | + | + | + | ||||||||||
| EC03 | + | + | + | + | ||||||||||
| EC04 | + | + | + | + | Y | |||||||||
| EC05 | + | + | + | + | ||||||||||
| EC06 | + | − | + | − | ||||||||||
| EC07 | + | + | + | + | ||||||||||
| EC08 | + | + | + | + | Y | |||||||||
| EC09 | + | + | + | + | ||||||||||
| EC10 | + | + | + | + | Y | |||||||||
| EC11 | + | + | + | + | ||||||||||
| EC12 | + | + | + | + | ||||||||||
| EC13 | + | + | + | + | ||||||||||
| EC14 | + | + | + | + | Y | |||||||||
| EC15 | + | + | + | + | Y | |||||||||
| EC16 | + | + | + | + | ||||||||||
| EC17 | + | + | + | + | ||||||||||
| EC18 | + | + | + | + | ||||||||||
| EC19 | + | + | + | + | ||||||||||
| EC20 | + | − | + | + | ||||||||||
| EC21 | + | − | + | + | ||||||||||
| EC22 | + | + | + | + | ||||||||||
| EC23 | + | + | + | + | ||||||||||
| EC24 | + | + | + | + | ||||||||||
| EC25 | + | + | + | + | ||||||||||
| B1 | EC26 | + | + | + | + | |||||||||
| EC27 | + | + | + | + | Y | |||||||||
| EC28 | + | + | + | + | Y | |||||||||
| EC29 | + | + | + | + | ||||||||||
| EC30 | + | + | + | + | ||||||||||
| EC32 | + | + | + | + | Y | |||||||||
| EC33 | + | + | + | + | ||||||||||
| EC34 | + | + | + | + | ||||||||||
| EC45 | + | + | + | + | ||||||||||
| EC58 | − | − | + | + | ||||||||||
| EC66 | − | − | − | − | ||||||||||
| EC67 | + | + | + | + | ||||||||||
| EC68 | + | + | + | + | Y | |||||||||
| EC69 | + | − | + | + | ||||||||||
| EC70 | + | + | + | + | Y | |||||||||
| EC71 | + | + | + | + | ||||||||||
| EC72 | + | + | + | + | ||||||||||
| B2 | EC51 | + | − | − | − | |||||||||
| EC52 | + | − | − | − | ||||||||||
| EC53 | + | − | − | − | ||||||||||
| EC54 | + | − | − | − | ||||||||||
| EC55 | + | − | − | − | ||||||||||
| EC56 | − | − | − | − | ||||||||||
| EC57 | + | − | − | − | ||||||||||
| EC59 | + | − | − | − | ||||||||||
| EC60 | + | − | − | − | ||||||||||
| EC61 | + | − | − | − | ||||||||||
| EC62 | + | − | − | − | ||||||||||
| EC63 | + | − | − | − | ||||||||||
| EC64 | + | − | − | − | ||||||||||
| EC65 | + | − | − | + | ||||||||||
| D | EC35 | + | + | + | − | |||||||||
| EC36 | + | + | + | − | ||||||||||
| EC38 | + | − | + | − | ||||||||||
| EC39 | + | + | + | − | ||||||||||
| EC40 | + | + | + | − | Y | |||||||||
| EC41 | + | + | + | − | ||||||||||
| EC44 | + | + | + | + | Y | |||||||||
| EC46 | + | + | + | + | Y | |||||||||
| EC47 | + | + | + | − | ||||||||||
| EC48 | + | + | + | − | ||||||||||
| EC49 | + | + | + | + | Y | |||||||||
| EC50 | + | + | + | + | Y | |||||||||
| E | EC31 | − | + | + | + | |||||||||
| EC37 | − | + | + | + | Y | |||||||||
| EC42 | − | + | + | + | Y | |||||||||
| EC43 | − | − | + | + | ||||||||||
a
Group classification follows Herzer et al. (12).
b
+, successful PCR amplification; −, no PCR amplification. SeqY, PCR fragments were further sequenced for the strain.