Table 2.
Mutations in Regionb |
RFLP Polymorphismsc |
||||||||||||||
Haplogroup | SampleNumbera | 16001–16497 HVS-I (16000+) | 30–407 HVS-II(73 and 263) | 10171–10659(10000+) | 14055–14590(14000+) | 663e | 3010 | 3206 | 3391e | 4831f | 5176a | 7598f | 9-bp | 9820g | Other Polymorphismsd |
M7b1 | 4YN285 | 129 192 223 297 | 150 152 199 315+C | 398 400 | 2 | + | |||||||||
M7b1 | YN156 | 051 129 192 223 297 | 150 199 315+C | 398 400 | 2 | + | 9824 | ||||||||
M7b1 | YN288 | 129 192 223 271 297 | 150 199 309+C 315+C | 398 400 | 2 | + | |||||||||
M7b1 | XJ8415 | 129 192 223 297 301G 391 | 150 199 315+C | 398 400 | 2 | + | |||||||||
M7b1 | QD8160 | 129 188G 192 223 297 | 150 199 315+C | ND | 2 | + | |||||||||
M7b1 | LN7717 | 093 129 192 297 | 150 199 309+C 315+C | 398 400 | 2 | + | |||||||||
M7b2 | QD8142 | 129 189 223 297 298 | 150 195A 199 309+CC 315+C | 345398 400 | 2 | + | |||||||||
M7b2 | XJ8450 | 129 183C 189 223 297 298 | 150 199 204 228 309+CC 315+C | 345398 400 | CRS | 2 | + | ||||||||
M7b2 | WH6953 | 129 183C 189 223 297 298325 | 150 199204 309+C 315+C | 345 398 400 | 2 | + | |||||||||
M7b2 | XJ8422 | 129 183C 189 223 297 298325 | 150 199309+C 315+C | 345398 400 | 2 | + | |||||||||
M7b | WH6242 | 129 189 223 293 297 | 150 195 198 199 315+C | 398 400 | 2 | + | |||||||||
M7b | YN173 | 129 223 297 | 150 159 199 309+C 315+C | 398 400 | + | 2 | + | 9824 | |||||||
M7c | GD7823 | 223 295 | 146 199 262 315+C | 398 400 | − | + | + | 2 | + | ||||||
M7c | 2LN7711 | 223 295 | 146 199 315+C | 398 400 | − | + | + | 2 | + | ||||||
M7c | XJ8439n | 223 295 | 146 199 309+C 315+C | 398 400 | + | 2 | + | ||||||||
M7c | WH6939 | 295 319 | 146 199 315+C | 398 400 | − | − | + | + | 2 | + | |||||
M7c | LN7605 | 223 295 296 319 | 146 199 309+C 315+C | 398 400 | + | + | 2 | + | |||||||
M7 | YN250 | 172 223 311 | 146 199 315+C | 398 400 | − | + | + | 2 | + | ||||||
M7 | XJ8438 | 172 223 287 311 | 093 146 315+C | 398 400 | 2 | + | 9824 | ||||||||
M7 | WH6955 | 230 304 | 146A 199 309+C 315+C | 398 400 | 2 | + |
98249861 | ||||||||
M8a | WH6952 | 223 298 319 | 309+C 315+C | 398 400 | 470 | + | 2 | ||||||||
M8a | QD8159 | 184 223 278 298 319 | 234 309+C 315+C | 398 400 646 | 470 | + | 2 | ||||||||
M8a | 2XJ8417 | 184 223 293C 298 319 | 152 309+C 315+C | 398 400 | 470 | 2 | 4715 4769; 7357–7804=CRS; 15487T | ||||||||
M8a | QD8150 | 184 223 293 298 319 | 152 200 315+C | 398 400 | 470 | + | 2 | ||||||||
M8a | LN7715 | 184 209 223 293 298 311 319 | 207 309+CC 315+C | 398 400 | 470 | + | 2 | ||||||||
M8a | WH6958 | 184 189 223 298 311 319 390 468 470 471 473 | 152 309+C 315+C | 398 400 | 470 | + | 3 | ||||||||
M8a | WH6981 | 134 184 223 298 319 | 315+C | 398 400 | 470 | + | 2 | ||||||||
M8a | 2QD8120 | 134 184 223 298 319 | 309+C 315+C | 398 400 | 470 | + | 2 | 7357–7804=CRS; 15487T | |||||||
M8a | 2LN7597 | 184 223 298 319 400 | 152 315+C | 398 400 | 470 | + | 2 | ||||||||
M8a | LN7590 | 184 223 298 319 | 315+C | 398 400 | 94 470 | + | 2 | ||||||||
C | XJ8453 | 223 327 | 249d 309+C 315+C | 398 400 | 318 | 2 | |||||||||
C | YN157 | 093 129 223 298 327 | 146 194 249d 315+C | 398 400 | 318 | 2 | |||||||||
C | XJ8435 | 129 223 298 327 | 195 249d 309+C 315+C | 398 400 | 318 | 2 | 4715 4769; 7357–7804=CRS; 15487T 15968 | ||||||||
C | XJ8418 | 223 243 297 298 324 327 | 146 249d 309+C 315+C | 398 400 | 318 | + | 2 | − | 4715 4769; 7382; 15487T 15515 | ||||||
C | YN177 | 092 183C 189 223 298 327 355 | 249d 309+C 315+C | 398 400 | 318 | 2 | |||||||||
C | WH6938 | 189 298 327 | 234 249d 309+C 315+C | 398 400 | 318 | 2 | |||||||||
C | GD7839n | 183C 189 223 298 327 | 249d 309+C 315+C | 398 400 | 2 | ||||||||||
C | LN7710 | 217 223 298 311 327 | 146 249d 309+CC 315+C | 398 400 | 318 | 2 | 4715 4769; 7357–7804=CRS; 15487T 15930 | ||||||||
Z | WH6249 | 185 223 260 298 302 | 152 249d 309+C 315+C | 398 400 | 2 | ||||||||||
Z | XJ8419 | 185 223 260 298 | 152 249d 309+C 315+C | 208 398 400 | CRS | 2 | 4715 4769; 7357–7804=CRS; 15487T 15784 | ||||||||
Z | LN7620 | 185 223 260 298 | 152 249d 315+C | 398 400 | 2 | ||||||||||
Z | WH6943 | 136 185 223 260 298 | 152 249d 309+C 315+C | 398 400 | 2 | ||||||||||
(continued) | |||||||||||||||
Z | WH6979 | 185 189 223 224 260 261 298302 | 152 185 249d 309+C 315+C | 398 400 | 2 | 4715 4769; 7357–7804=CRS; 15475 15487T 15784 15944d | |||||||||
M9 | QD8125 | 223 234 291 316 | 153 309+C 315+C | 398 400 | 308 417 | + | + | + | 2 | − | |||||
M9 | XJ8452 | 145 223 234 316 | 153 315+C | 398 400 | 308 | + | − | + | 2 | ||||||
M9 | LN7584 | 223 234 316 362 | 152 153 315+C | 398 400 | 308 | + | − | + | 2 | ||||||
M9 | XJ8420 | 223 234 291 316 362 | 153 315+C | 398 400 | 308 | + | − | + | + | 2 | 7357–7804=CRS | ||||
M9 | LN7606 | 209 223 234 291 316 362 | 153 309+C 315+C | 398 400 | 308 417 | + | − | + | + | 2 | 7719A | ||||
M9 | QD8155 | 223 234 255 271 362 | 153 315+C | 398 400 | 308 | + | − | + | 2 | ||||||
M9 | GD7822 | 223 234 311 362 | 146 217 309+C 315+C | 398 400 | 308 | + |
− | + | 2 | ||||||
M10 | LN7720 | 223 311 | 195 315+C 331 | 398 400 646 | + | + | 2 | − | |||||||
M10 | LN7596 | 066 086 092 223 311 | 152 315+C | 398 400 646 | + | + | 2 | − | |||||||
M10 | YN163 | 093 129 223 311 357 497 | 309+CC 315+C | 398 400 646 | − | − | + | + | 2 | − | |||||
M10 | LN7593 | 093 129 193 223 311 357 497 | 146 152 309+C 315+C | 398 400 646 | + | + | 2 | − | |||||||
M10 | QD8122 | 129 223 311 | 315+C | 398 400 646 | + | + | 2 | − | |||||||
M | GD7825 | 172 223 234 290 311 | 125 127 309+C 315+C | 398 400 | - | − | + | + | 2 | − | |||||
M | GD7835n | 223 234 287 290 362 | 125 127 128 309+C 315+C 318 | 398 400 | − | − | + | + | 2 | − | 5437 | ||||
M | QD8130 | 223 | 189 198 200 215 315+C 318 326 | 398 400 | − | + | + | 2 | − | 12351 12705 | |||||
M | XJ8436 | 223 294 295 | 200 215 309+C 315+C 318 326 | 398 400 | + | + | 2 | − | 9950 | ||||||
M | GD7817 | 172 173 223 | 146 151 200 215 309+C 315+C 318 326 | 398 400 | − | − | + | + | 2 | − | |||||
M | YN149 | 183C 189 293C 325 362 | 146 234 315+C | 325 398 400 | − | − | + | + | 2 | − | |||||
M | 2GD7819 | 129 223 270 362 | 103 204 309+C 315+C | 398 400 | − | − | + | + | 1 | − | |||||
M | LN7594 | 172 174 223 362 | 315+C | 398 400 | − | − | + | + | 2 | − | |||||
M | GD7815 | 093 104 111 223 362 | 146 309+C 315+C | 398 400 | G | C | − | + | + | 2 | − | ||||
M | GD7821 | 093 104 111 223 235 362 | 309+C 315+C | 398 400 | CRS | − | − |
+ | + |
2 | − | ||||
G2 | LN7709 | 166 223 278 335 362 | 152 315+C | 398 400 | + | + | − | 2 | − | 4769, 4833; 7600; 15392–16047=CRS | |||||
G2a | QD8136 | 223 227 278 311 362 | 152 315+C | 398 400 | + | + | − | 2 | − | ||||||
G2a | LN7719 | 189 194 223 227 278 311 362 | 309+C 315+C | 398 400 | + | + | − | 2 | − | ||||||
G2a | XJ8416 | 189 223 227 256 278 362 | 153 195 309+C 315+C | 398 400 | + | + | − | 2 | − | 4769, 4833; 7533 7600; 15392–16047=CRS | |||||
G2a | WH6251 | 223 227 262 278 362 | 152 309+C 315+C | 398 400 | + | + | − | 2 | − | ||||||
G2a | LN7551 | 111 223 227 278 362 | 309+CC 315+C | 398 400 | + | + | − | 2 | − | ||||||
G2a | LN7587 | 111 209 223 227 274 278 326 362 | 309+C 315+C | 398 400 | + | + | − | 2 | − | ||||||
G2a | QD8117 | 209 223 227 234 278 309 362 | 152 315+C | 398 400 | + | + | − | 2 | − | ||||||
G2a | QD8152 | 223 227 272 278 319 362 365 | 152 198 282 309+C 315+C | 398 400 | + |
+ |
− |
2 | − | ||||||
D5a | GD7837 | 164 172 182C 183C 189 223 235 266 291 491G | 150315+C | 364 397398 400 | − | 2 | |||||||||
D5a | WH6250 | 164 172 182C 183C 189 223 266 300 362 | 309+C 315+C | 397 398 400 | − | 2 | |||||||||
D5a | QD8126 | 164 172 182C 183C 189 223 266 362 | 150 315+C | 397 398 400 | − | 2 | |||||||||
D5a | XJ8437 | 092 145 164 182d 183C 189 223 266 362 | 150 315+C | 397 398 400 | − | 2 | |||||||||
D5a | QD8124 | 092 164 167 182C 183C 189 266 362 | 150 309+CC 315+C | 397 398 400 | − | 2 | |||||||||
D5a | QD8144 | 092 172 182C 183C 189 223 362 | 150 315+C | 397 398 400 | − | 2 | |||||||||
D5a | XJ8423 | 092 172 182C 183C 189 223 266 362 | 150 309+C 315+C | 397 398 400 | − | − | 2 | ||||||||
D5a | WH6984 | 172 182d 183C 189 223 266 362 | 150 309+CC 315+C | 397 398 400 | − | 2 | |||||||||
D5a | YN167 | 172 182C 183C 189 223 266 299 319 362 | 150 309+C 315+C | 397398 400 | − | 2 | |||||||||
D5a | LN7577 | 169 172 182C 183C 189 223 266 362 | 150 309+C 315+C | 397 398 400 | − | 2 | |||||||||
D5 | LN7713 | 092 148 183C 189 223 256 362 | 150 152 185 309+C 315+C | 397398 400 654 | − | 2 | |||||||||
D5 | QD8149n | 189 223 319 362 | 150 185 237 309+CC 315+C | 397 398 400 | − | 2 | |||||||||
D5 | GD7820 | 148 182C 183C 189 223 362 | 150 152 309+C 315+C | 397 398 400 | − | 2 | |||||||||
D5 | LN7578 | 189 210 223 311 316 362 | 150 151 152 309 C 315+C | 397398 400 | − | 2 | |||||||||
D5 | YN289 | 189 223 362 | 150 315+C | 397 398 400 | − | 2 | |||||||||
D5 | XJ8412 | 183C 189 223 362 | 150 152 309+C 315+C | 397 398 400 | CRS | − | 2 | ||||||||
D5 | QD8162 | ND | 146 150 247 309+CC 315+C | 397 398 400 | − | 2 | 9775–10163=CRS | ||||||||
D4a | XJ8441 | 129 223 249 278 311 362 | 152 200 309+CC 315+C | 398 400 | A | T | − | − | + | 2 | − | ||||
D4a | QD8166 | 129 223 234 249 311 362 | 152 315+C | 398 400 | CRS | − | 2 | 5178A | |||||||
D4a | LN7581 | 129 193 223 256 362 | 152 315+C | 398 400 410 | A | T | − | 2 | |||||||
D4a | LN7600 | 111G 129 223 362 | 152 315+C | 398 400 | A | T | − | 2 | − | ||||||
D4a | 2QD8127 | 129 223 362 | 152 309+C 315+C | 398 400 | A | T | − | 2 | |||||||
D4a | QD8140 | 129 223 362 | 152 217 315+C | 398 400 | A | T | − | 2 | |||||||
D4a | GD7841 | 129 162 223 362 | 152 282 309+C 315+C | 398 400 | A | T |
− | 2 | |||||||
D4b | YN171 | 184d 186 189 223 319 362 | 185 189 315+C | 181 398 400 | A | C | − | 2 | |||||||
D4b | GD7830 | 223 287 319 362 380 | 315+C | 181 398 400 | A | C | − | 1 | |||||||
D4 | WH6245 | 111 223 261 362 | 194 315+C | 398 400 | A | C | − | 2 | |||||||
D4 | LN7599 | 111 187 223 362 | 194 309+C 315+C | 398 400 | A | C | − | 2 | |||||||
D4 | LN7575 | 176 223 291A 362 | 94 194 315+C | 398 400 | A | C | − | 2 | |||||||
D4 | QD8137 | 093 176 223 362 | 94 194 309+C 315+C | 398 400 | A | C | − | 2 | |||||||
D4 | YN283 | 093 223 232 290 362 | 195 198 315+C | 398 400 646 | A | C | − | 2 | |||||||
D4 | XJ8425 | 093 223 362 | 94 315+C 325 | 398 400 | A | C | − | 2 | |||||||
D4 | XJ8434 | 093 362 | 109 153 194 315+C | 398 400 | A | C | − | 2 | |||||||
D4 | QD8146 | 051 069 223 362 | 194 315+C | 274 398 400 | A | C | − | 2 | |||||||
D4 | YN286 | 223 291 362 | 150 194 310 315+C | 398 400 | A | C | − | 2 | |||||||
D4 | LN7603 | 223 245 269 362 368 | 315+C | 398 400 | A | C | − | 2 | |||||||
D4 | QD8131 | 223 224 245 292 362 | 146 315+C | 398 400 | A | C | − | 2 | |||||||
D4 | QD8115 | 184 223 311 362 | 152 309+C 315+C | 398 400 | A | C | − | 2 | |||||||
D4 | WH6253 | 192 223 278 316 362 | 143 184 309+C 315+C | 398 400 | A | C | − | − | + | 2 | − | ||||
D4 | XJ8433 | 223 249 261 278 362 | 152 204 309+C 315+C | 398 400 | A | C | − | − | + | 2 | − | ||||
D4 | QD8121 | 223 249 362 | 309+C 315+C | 398 400 | A | C | − | 2 | |||||||
D4 | QD8153 | 148 223 249 301 342 362 | 152 309+CC 315+C | 398 400 | A | C | − | 2 | |||||||
D4 | LN7582 | 223 274 362 | 151 298 309+C 315+C | 398 400 | A | C | − | 2 | |||||||
D4 | LN7568 | 095 209 223 294 362 | 195 315+C | 398 400 | A | C | − | 3 | |||||||
D4 | LN7553 | 174 223 362 | 182 309+C 315+C | 400 | A | C | − | 2 | |||||||
D4 | XJ8444 | 174 362 | 309+CC 315+C | 398 400 | A | C | − | 2 | |||||||
D4 | XJ8432 | 362 | 194 315+C | 398 400 | A | C | − | 2 | |||||||
D4 | 3XJ8411 | 223 362 | 194 315+C | 398 400 | A | C | − | 2 | |||||||
D4 | LN7550 | 223 362 | 309+C 315+C | 398 400 | A | C | − | 2 | |||||||
D4 | QD8129 | 223 362 | 184 199 204 309+C 315+C | 398 400 | A | C | − | 2 | |||||||
D4 | QD8157 | 223 362 | (263) 315+C | 398 400 | − | 2 | |||||||||
D4 | QD8139 | 174 223 311 343 362 | 152 309+C 315+C | 398 400 | − | 2 | 5048 5147 5178A | ||||||||
D4 | YN159 | 223 362 497 | 94 315+C | 398 400 | A |
C | − | 2 | |||||||
D | GD7829 | 183C 189 223 311 362 | 152 204 309+C 315+C | 398 400 | G | C | − | 2 | |||||||
(continued) | |||||||||||||||
A | XJ8409 | 223 290 319 362 | 152 235 315+C | CRS | CRS | + | 2 | (522–523)d 663750 | |||||||
A | WH6247 | 223 290 319 362 | 152 207 235 (263) 309+C 315+C 372 | CRS | + | 2 | |||||||||
A | QD8164 | 223 290 319 362 | 152 156 159 182 235 309+CC 315+C | CRS | + | 2 | |||||||||
A | XJ8446 | 223 289 290 319 362 | 151 152 235 315+C | CRS | + | 2 | |||||||||
A | 2XJ8430 | 223 274 290 319 362 | 200 235 309+C 315+C | CRS | + | 2 | |||||||||
A | WH6243 | 223 274 290 319 362 | 151 152 235 309+C 315+C | CRS | + | 2 | |||||||||
A | WH6959 | 126 223 290 319 362 | 152 235 309+C 315+C | 320 335 | + | 2 | |||||||||
A | WH6980 | 223 290 294 319 362 | 152 235 315+C | CRS | + | 2 | |||||||||
A | QD8148 | 131 222A 223 290 319 362 | 151 152 200 235 309+CC 315+C | CRS | + | 2 | |||||||||
A | LN7604 | 037 086 223 290 319 356 362 | 152 235 315+C | CRS | + | 2 | |||||||||
A | YN178 | 086 223 290 319 362 | 150 235 249d 315+C | 364 | + | 2 | |||||||||
A | YN271 | 051 223 290 319 | 152 235 315+C | 646 | + | G | C | 2 | |||||||
A | WH6965 | 189 223 290 319 | 152 235 292 309+C 315+C | CRS | + | 1 | |||||||||
A | WH6956 | 051 129 182C 183C 189 223 290 319 | 152 200 235 309+C 315+C | CRS | + | 2 | |||||||||
A | XJ8445 | 223 290 293C 319 | 152 309+C 315+C | CRS | + | 2 | |||||||||
A | LN7588 | 093 223 263 290 293C 319 | 152 235 315+CC | CRS | + | 2 | |||||||||
A | WH6954 | 223 290 319 | 152 235 309+C 315+C | CRS | + | 2 | |||||||||
A | LN7580 | 129 213 223 290 319 | 152 235 309+CC 315+C 392 | CRS | + |
2 | |||||||||
N | WH6976 | 189 223 355 | 195 198 315+C | 289 | − | + | 2 | 4888–5441=CRS; 12634 12705 | |||||||
N9a | WH6254n | 086 111 129 192A 223 257A 261 | 150 309+CC 315+C | CRS | 2 | 12358 12372 12705 | |||||||||
N9a | GD7834 | 111 129 223 257A 261 | 146 150 309+C 315+C | CRS | 2 | 5231 5417 | |||||||||
N9a | YN284n | 129 162 223 250 257A 261 | 150 309+C 315+C | CRS | 2 | ||||||||||
N9a | WH6972 | 166C 173 223 250 257A 324 | 150 315+C | CRS | + | 2 | − | 5231 5417 | |||||||
N9a | WH6977 | 129 189 223 257A 261 | 150 183 194 195 309+CC 315+C | CRS | 2 | ||||||||||
N9a | QD8145 | 066 092 145 172 223 245 257A 261 | 150 315+C | CRS | 2 | ||||||||||
N9a | GD7828 | 145 172 223 245 257A 261 | 150 309+C 315+C | CRS | 2 | ||||||||||
N9a | YN175 | 172 223 257A 261 311 | 150 195 309+CC 315+C | CRS | 2 | ||||||||||
N9a | YN176 | 223 257A 261 362 | 150 309+C 315+C | CRS | 2 | ||||||||||
N9a | LN7591 | 223 257A 261 | 150 309+CC 315+C | CRS | 2 | ||||||||||
N9a | QD8123 | 223 257A 261 | 150 309+C 315+C | CRS | 2 | ||||||||||
N9a | QD8156 | 223 257A 261 | 150 309+C 315+C | CRS | 2 | 5231 5417 | |||||||||
Y | XJ8426 | 126 231 266 | 146 309+CC 315+C | 398 | 178 | 2 | 5417 | ||||||||
Y | LN7579 | 126 231 266 293 | 146 315+C | 398 | 178 | 2 | 5417 | ||||||||
Y | QD8151 | 126 193 231 266 | 146 245 315+C | 205 398 | 178 | 2 | 5417 | ||||||||
B4a | LN7565 | 182C 183C 189 217 261 | 71+G 73C 75 89 315+C | 238 | 1 | ||||||||||
B4a | QD8118 | 182C 183C 189 217 261 | 146 150 152 195 309+CCC 315+C | 238 | 1 | ||||||||||
B4a | LN7585 | 153 182C 183C 189 217 261 | 146 (306–309)d 315+C | 238 | 1 | ||||||||||
B4a | QD8128 | 129 182C 183C 189 223 261 311 | 151 152 310 (314–315)d | 238 | + | 1 | − | ||||||||
B4a | YN155 | 182C 183C 189 217 261 299 355 390 | 35 36 152 309+CC 315+C | 495 | 1 | ||||||||||
B4a | YN158 | 092 182C 183C 189 217 261 299 | 193 309+C 315+C | CRS | 1 | ||||||||||
B4a | LN7602 | 182C 183C 184 189 217 247 261 299 | 193 315+C | CRS | 1 | ||||||||||
B4a | GD7840 | 093 153 (181–183)C 189 217 261 292 311 362 | 309+CC 315+C | CRS | 1 | ||||||||||
B4a | GD7812 | 181d 182C 183C 189 217 261 292 | 309d 315+C | CRS | 1 | ||||||||||
B4a | YN174 | 129 182C 183C 189 217 261 | 146 195 257 309+C 315+C | CRS | 1 | ||||||||||
B4a | QD8170 | 129 182C 183C 189 223 261 | 309+CC 315+C | CRS | + | 1 | |||||||||
B4a | WH6248 | 182C 183C 189 257 261 360 | 152 309+CC 315+C | CRS | CRS | 1 | |||||||||
B4b | GD7838 | 136 183C 189 217 218 | 93 309+CC 315+C | CRS | 1 | ||||||||||
B4b | WH6961 | 136 182C 183C 189 217 218 | 309+CC 315+C | ND | 1 | ||||||||||
B4b | GD7813 | 136 183C 189 217 309 354 | 207 309+C 315+C | CRS | 1 | ||||||||||
B4b | GD7814 | 136 183C 189 217 309 354 | 146 207 315+C | CRS | 1 | ||||||||||
B4b | QD8119 | 092 136 183C 189 309 354 | 207 315+C | CRS | 1 | ||||||||||
B4b | QD8169 | 136 183T 189 217 218 239 248 | 309+C 315+C | CRS | 1 | ||||||||||
B4b | WH6978 | 136 183C 189 257 | 309+C 315+C | CRS | 1 | ||||||||||
B4b | XJ8428 | 136 183C 189 | 114 309+CC 315+C | CRS | 1 | ||||||||||
B4b | LN7716 | 136 183C 189 284 | 199 202 207 309+CCC 315+C | CRS | 1 | ||||||||||
B4 | LN7589 | 183C 189 217 | 309+CC 315+C 316 | CRS | 1 | ||||||||||
B4 | WH6945 | 182C 183C 189 217 223 311 320 | 315+C | CRS | 1 | ||||||||||
B4 | LN7572 | 182d 183C 189 217 223 235 291 316 | 146 185 189 195 196 309+C 315+C | CRS | 1 | ||||||||||
B4 | YN169 | 182C 183C 189 217 234 | 309+C 315+C | CRS | 1 | ||||||||||
B4 | LN7552 | 140 182d 183C 189 217 274 311 | 146 150 315+C | CRS | 1 | 9775–10163=CRS | |||||||||
B4 | YN154 | 140 183C 189 217 274 | 150 152 309+C 315+C | CRS | CRS | 1 | 9775–10163=CRS; 11440 11719 11887; 12335–12877=CRS; 14687 14766 | ||||||||
B5a | XJ8424 | 140 182C 183C 189 266A | 210 309+CC 315+C 391 | 398 | 1 | ||||||||||
B5a | WH6967 | 140 183C 189 266A | 210 315+C | 398 | 1 | ||||||||||
B5a | XJ8454 | 140 187 189 256 266G | 93 210 315+C | 398 | 1 | ||||||||||
B5a | YN150 | 140 145 183C 189 217 266A | 93 146 315+C | 398 | 1 | ||||||||||
B5a | LN7564 | 140 187 189 266A | 93 146 210 315+C | 398 | 1 | ||||||||||
B5a | YN168 | 140 145 183C 189 266A | 210 309+C 315+C | 398 | 1 | ||||||||||
B5b | YN284 | 111 129 140 182C 183C 189 234 243 249 250 463 | 131 199 204 292 315+C | ND | 1 | ||||||||||
B5b | XJ8413 | 111 140 182C 183C 189 234 243344 463 | 103 315+C | 398 | 1 | ||||||||||
B5b | WH6973 | 111 140 182C 183C 189 234 243291 463 | 131 204 309+C 315+C | 398 | 1 | ||||||||||
B5b | LN7714 | 111 140 182C 183C 189 234 243463 | 131 204 207 309+C 315+C | 398 | 1 | ||||||||||
B5 | WH6246 | 183C 189 311 | 150 195 214 279 309+CC 315+C | 398 | 1 | ||||||||||
B | QD8141 | 183C 189 | 309+C 315+C | CRS | 1 | ||||||||||
B | WH6982 | 183C 189 234 | 315+C | CRS | 1 | ||||||||||
B | GD7832 | 129 183C 189 352 355 | 150 152 185 189 309+C 315+C | 589 595 | 1 | ||||||||||
B | YN172 | 093 179 182C 183C 189 | 150 185 309+CC 315+C | CRS | 1 | ||||||||||
R9a | XJ8451 | 209 298 311 355 362 | 195 249d 309+C 315+C | 310 320 | 2 | ||||||||||
R9a | XJ8408 | 093 260 298 355 362 | 152 207 249d 309+C 315+C | 310 320 | 2 | ||||||||||
R9a | YN153 | 093 111 126 192 249 263 298 355 362 390 | 207 249d 309+C 315+C | 310 320496 | 2 | ||||||||||
F1a | YN160 | 108 129 162 172 293 304 | 249d 315+C | 310 609 653 | 2 | ||||||||||
F1a | LN7721 | 108 129 162 172 304 | 150 249d 309+C 315+C | 310 609 | 2 | ||||||||||
F1a | GD7824 | 108 129 162 172 304 | 195 249d 309+C 315+C | 310 609 | CRS | 2 | |||||||||
F1a | YN161 | 129 162 172 260 304 | 249d 315+C | 310 609 | 2 | ||||||||||
F1a | XJ8427 | 129 162 172 304 | 151 153 249d 315+C | 310 609 | 170 | 2 | |||||||||
F1a | WH6252 | 129 162 172 304 311 | 249d 315+C | 310 609 | 2 | ||||||||||
(continued) | |||||||||||||||
F1a | QD8116 | 129 162 172 304 399 | 152 249d 315+C | 310 609 | 2 | ||||||||||
F1a | QD8161 | 129 162 172 304 497 | 249d 315+C | 310 609 | 2 | ||||||||||
F1a | WH6985 | 129 172 295 304 311 | 249d 315+C | 310 609 | 2 | 15930 | |||||||||
F1a | WH6975 | 129 172 218 304 354 | 195 249d 315+C | 310 604 609 | 2 | ||||||||||
F1a | GD7816 | 129 172 304 362 | 151 249d 315+C | 310 604 609 | 2 | ||||||||||
F1a | YN281n | 129 172 304 | 152 249d 315+C | 310 604 609 | 2 | ||||||||||
F1a | YN151 | 129 172 184 304 | 249d 309+CC 315+C | 310 609 | CRS | 2 | |||||||||
F1a | XJ8431 | 129 172 304 399C | 152 249d 315+C | 310 609 | 2 | ||||||||||
F1a | YN165 | 093 129 172 294 304 362 | 152 249d 315+C | 310 609 | 2 | ||||||||||
F1c | XJ8421 | 111 129 294 304 | 152 234 249d 315+C | 310 454 609 | 2 | ||||||||||
F1c | WH6971 | 111 129 266 304 | 152 249d 309+C 315+C | 310 454 609 | CRS | 2 | |||||||||
F1c | QD8167 | 111 129 266 304 | 152 249d 309+CC 315+C | 310 454 609 | 2 | ||||||||||
F1b | YN166 | 183C 189 232A 249 304 311 | 146 204 207 249d 309+C 315+C | 310 609 | 2 | ||||||||||
F1b | LN7586 | 183C 189 232A 249 304 311 | 143 204 249d 309+C 315+C | 310 609 | 2 | ||||||||||
F1b | XJ8447 | 183C 189 232A 249 264 304 311 | 199 204 249d 309+C 315+C | 310 609 | + | 2 | − | ||||||||
F1b | YN290 | 129 145 182C 183C 189 232A 249 304 311 344 | 152 249d 315+C | ND | 2 | ||||||||||
F1b | QD8154 | 183C 189 304 311 | 195 249d 309+C 315+C | 310 609 | 2 | ||||||||||
F1b | GD7811 | 172 180 189 304 465 | 217 249d 309+CC 315+C | 310 609 | 2 | ||||||||||
F1b | WH6949n | 051 129 183C 189 304 | 150 238 249d 315+C | 310 609 | 2 | ||||||||||
F1b | QD8143 | 189 304 | 150 195 249d 315+C | 609 | 2 | ||||||||||
F2a | XJ8414 | 092A 291 304 | 249d 309+CC 315+C | 310 535 586 | 2 | ||||||||||
F2a | GD7836n | 092A 291 304 359 | 249d 309+C 315+C | 310 535 586 | 2 | ||||||||||
F2a | YN281 | 051 291 304 | 195 249d 315+C | ND | 2 | ||||||||||
F2a | QD8147 | 266 291 304 | 146 249d 315+C | 310 535 586 | 2 | ||||||||||
F2a | XJ8407 | 203 239 291 304 | 249d 309+C 315+C | 310 535 586 | 2 | ||||||||||
F2 | GD7809 | 086 203 304 | 249d 315+C | 310 535 586 | 2 | ||||||||||
F2 | LN7601 | 129 203 304 | 195 249d 315+C | 310 535 586 | 2 | ||||||||||
F2 | WH6974 | 192 304 | 249d 315+C | 265 310 535 586 | 2 | ||||||||||
F2 | WH6948 | 299 304 | 249d 309+C 315+C | 310 535 586 | 2 | ||||||||||
F2 | GD7810 | 261 | 194 235 249d 309+C 315+C | 310 535 586 | − | 2 | 11719; 12338; 14766 | ||||||||
F2 | GD7842 | 129 189 304 | 207 249d 315+C | 310 535 | 2 | ||||||||||
F | XJ8440 | 207 304 362 399 | 146 152 249d 315+C | 310 | 2 | ||||||||||
F | YN170 | 157 256 304 335 | 236 249d 315+C | CRS | 2 | ||||||||||
R | XJ8448 | 093 304 309 390 | 152 309+C 315+C | CRS | 2 | ||||||||||
R | LN7595 | 182C 183C 189 304 311 | 185 189 309+CCC 315+C | 398 | + | 2 | |||||||||
R | QD8168 | 182C 183C 189 259 311 390 | 150 185 189 234 309+CC 315+C | 398 | + | 2 | |||||||||
T1 | LN7592 | 126 163 186 189 294 | 152 195 309+C 315+C | 463 | CRS | + | 2 | 11719; 14766 14905 | |||||||
HV | YN287 | 217 240 | 152 309+CC 315+C | CRS | 2 | 11339–11943=CRS; 12681; 14576–15085=CRS |
Note.— The mtDNAs that had no mutation in a sequenced region compared with the reference sequence are labeled by CRS. ND = not determined.
The Han populations from Yunnan, Wuhan, Gongdong, Qingdao, Liaoning, and Xinjiang are abbreviated as YN, WH, GD, QD, LN, and XJ, respectively. Numbers prefixing sample identification codes indicate sample frequencies >1 in the same population; for example, 4YN285 means that four Yunnan Han individuals share the same haplotype.
Sites are numbered according to the revised CRS of Andrews et al. (1999). The suffixes A, G, C, and T indicate transversions, d indicates a deletion, and a plus sign (+) indicates an insertion. Insertions and deletions are recorded at the last possible site (as is usual in forensics); thus, insertions and deletions in HVS-II are scored at 249, 309, 315, and 522–523, instead of, for example, at 248, 303, 311, and 514–515. For each haplogroup, characteristic mutations are shown in boldface, and diagnostic restriction sites are boxed.
The restriction enzymes used in the analyses are designated by the following single-letter codes: a=AluI; e=HaeIII; f=HhaI; g=HinfI; − and + denote the absence and presence of the restriction site, respectively. “1” denotes the presence of the 9-bp (CCCCCTCTA) deletion, “2” denotes nondeletion (i.e., two repeats of the 9-bp fragment), and “3” denotes triplication of the 9-bp fragment.
Additional polymorphisms in the coding region refer to the segments listed in table 1.