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. 2013 Oct 1;14(Suppl 4):S3. doi: 10.1186/1471-2164-14-S4-S3

Table 4.

REPTree regression correlation coefficients (r) using TSM positions for both NRTIs and NNRTIs to construct structure-based mutant feature vectors

NRTIs NNRTIs


Train/Test 3TC ABC AZT d4T ddC ddI FTC TDF DLV EFV NVP
NRTIs
3TC 0.99 0.71 -0.05 0.04 0.45 0.39 1.00 -0.29 -0.11 -0.16 -0.23
ABC 0.83 0.92 0.28 0.44 0.64 0.67 0.91 0.02 -0.13 -0.08 -0.17
AZT 0.07 0.39 0.90 0.75 0.17 0.28 0.34 0.63 -0.03 0.02 -0.01
d4T 0.17 0.55 0.76 0.93 0.56 0.64 0.36 0.56 -0.11 -0.04 -0.08
ddC 0.57 0.67 0.15 0.48 0.90 0.85 0.93 -0.03 -0.14 -0.14 -0.20
ddI 0.41 0.69 0.28 0.63 0.85 0.92 0.70 0.13 -0.12 -0.06 -0.12
FTC 0.94 0.67 -0.02 0.02 0.42 0.35 0.99 -0.30 -0.15 -0.19 -0.26
TDF -0.46 -0.03 0.68 0.57 -0.08 0.04 -0.41 0.86 0.04 0.09 0.10
NNRTIs
DLV -0.15 -0.12 0.08 0.01 -0.08 -0.09 -0.33 -0.01 0.89 0.60 0.68
EFV -0.09 -0.01 0.12 0.04 -0.09 -0.04 -0.13 0.04 0.64 0.93 0.79
NVP -0.13 -0.05 0.16 0.08 -0.13 -0.09 -0.21 0.03 0.63 0.72 0.93