Table 1.
Compound | Origin | Prominent Raman bands observed | References |
---|---|---|---|
PIGMENTS | |||
Bacterioruberin | Halobacterium salinarum NRC-1 culture | 1505 s, 1152 s, 1000 s | Marshall et al., 2007 |
Halococcus dombrowskii culture | 1507 s, 1152 s, 1002 s | Fendrihan et al., 2009 | |
Halorubrum sodomense culture | 1506 s, 1152 s, 1001 s | Jehlička et al., 2013 | |
Haloarcula vallismortis culture | 1506 s, 1151 s, 1000 s | Jehlička et al., 2013 | |
Salinixanthin | Salinibacter ruber culture | 1512 s, 1155 s, 1003 s | Jehlička et al., 2013 |
Bacteriorhodopsin | Standard | 1526 s, 1199 m, 1168 m, 1150 m, 1007 s | Marshall et al., 2007 |
Chlorophyll | Native crusts Atacama cyanobacteria | 1445 m, 1308 m, 745 m, 508 m | Vítek et al., 2013 |
Scytonemin | Lyngbya aestuarii from native mat | 1595 m, 1554 m, 1173 m | Edwards et al., 2000 |
Native crusts Atacama | 1596 s, 1558 s, 1321 s, 1172 m | Vítek et al., 2010 | |
Phycobiliproteins | Native crusts Atacama | 1631 w, 1583 w, 1370 w, 1283 w, 1235 w, 874 w, 815 w, 665 w | Vítek et al., 2013 |
COMPATIBLE SOLUTES | |||
Glycerol | Standard | 1465 m, 1315 m, 1257 m, 1110 s, 1055 s, 923 m, 850 s, 820 s, 675 m, 485 m, 416 m, 392 s | De Gelder et al., 2007 |
Trehalose | Standard | 1455 m, 1411 m, 1386 m, 1371 m, 1358 vs, 1330 m, 1149 vs, 1120 vs, 1102 s, 1080 m, 1061 m, 1018 m, 912 vs838 vs, 804 m, 697 m, 671 m, 604 m, 540 s, 523 vs, 450 s, 430 m, 407 vs, 369 vs | De Gelder et al., 2007 |
Glutamate | Standard | 1434 m, 1421 s, 1401 vs, 1353 m, 1341 s, 1317 s, 1293 m, 1282 m, 1142 m, 1095 m, 942 vs, 925 m, 876 s, 857 vs, 775 m, 529 m, 499 m | De Gelder et al., 2007 |
L-proline | Standard | 1454 s, 1389 m, 1378 m, 1286 m, 1267 m, 1240 m, 1083 m, 1045 m, 1035 m, 994 m, 947 m, 930 m, 916 vs, 899 vs, 877 m, 850 s, 842 vs, 834 vs, 642 m, 452 vs | De Gelder et al., 2007 |
Ectoine | Standard | 3009 m, 2981 m, 2944 s, 2895 m, 1469 m, 1444 m, 1392 m, 1366 w, 1316 ms, 1280 ms, 1215 w, 1207 w, 1137 m, 1072 w, 1032 w, 999 w, 850 s, 804 vw, 692 vw, br, 657 vw, 599 w, 570 w, 498 w, 432 w | Jehlička et al., 2012a |
Halomonas elongata culture (minimal medium) | 2985 m, sh, 2937 s, br, 2888 m, br, 1633 w, 1465 vw, sh, 1439 w, sh, 1394 s, 1319 vw, sh, 1275 m, 1212 w, sh, 1136 w, 1030 vw, 1000 vw, 903 vw, 845 m, 803 vw, 686 vw, 655 vw, 596 w, 571 w, 435 vw | Jehlička et al., 2012b | |
Hydroxyectoine | Standard | 3017 m, 2935 s, 861 w, 1640 w, 1613 m, 1438 m, 1349 m, 1318 ms, 1263 s, 1213 m, 1151 m, 1092 ms, 1014 s, 970 w, 901 m, 890 m, 828 ms, 751 s, 631 m, 558 m, 395 m, 381 s, 359 m, 311 m | Jehlička et al., 2012a |
Glycine betaine | Standard | 3375 m, 3290 m, 3053 m, 3034 m, 2982 m, 2969 s, 2867 w, 2937 m, 1650 w, 1462 s, 1427 m, 1412 w, 1343 m, 1132 w, 953 w, 939 w, 895 m, 783 s, 539 m, 363 m | Ilczyszyn and Ratajczak, 1996 |
Halomonas elongata culture (complex medium) | 3050 w, 3031 m, 2978 m, 2965 s, 2942 w, 2935 m, 2885 w, 2880 w, 2864 w, 2784 m, 1613 vw, 1458 m, 1423 w, 1410 w, 1340 w, 1129 w, 974 m, 952 m, 933 s, 896 w, 780 s, 725 w, 538 m, 457 w, 361 m | Jehlička et al., 2012b | |
Ectothiorhodospira marismortui culture | 3059 w, 3032 m, 2966 m, 2936 m, 1645 vw, 1625 vw, 1457 m, 1410 vw, 1394 vw, 1342 vw, 1211 vw, 1127 vw, br, 976 w, 954 w, 933 s, 897 w, 779 s, 540 m, 456 w, 422 w, 366 w, 338 w | Jehlička et al., 2012b | |
Native gypsum crust (Eilat, Israel, red layer) | 3058 w, br, 3033 m, 2969 s, 2939 ms, 2880 m, 1458 m, 1452 m, 1421 w, sh, 1337 mW, 1212 w, 1131 vw, 978 w, 956 m, 934 s, 911 mW, 899 mW, 780 s, 730 vw, br, 684 vw, 542 mW, 458 w, 369 w, 339 vw | Oren et al., 2013 | |
Glucosylglycerol | 2930 br, 2907 s, 1460 s, 1366 s, br, 1340 s, br, 1265 w, br, 1127 m, 1103 w, 955 w, 897 m, 842 s, 755 w, 707 w, 666 w, 544 m, 514 m, 435 w | Jehlička et al., 2012a | |
Mannosylglycerate (K salt) | 3585 m, 3405 m, 2975 m, 2956 m, 2938 s, 2931 s, 2906 m, 1461 m, 1353 m, 1308 m, 1153 m, 1135 m, 1107 m, 1093 m, 1069 s, 1055 m, 1004 m, 958 m, 892 s, 825 s, 671 m, 589 m, 517 s, 429 w, 390 m, 350 m | Jehlička et al., 2012a |
s, strong bands; m, medium bands; vw, very weak bands; mw, weak bands; w, weak bands; br, broad bands; sh, shoulder.