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. 2013 Dec 10;4:380. doi: 10.3389/fmicb.2013.00380

Table 1.

Main Raman bands and intensities for pigments and compatible solutes.

Compound Origin Prominent Raman bands observed References
PIGMENTS
Bacterioruberin Halobacterium salinarum NRC-1 culture 1505 s, 1152 s, 1000 s Marshall et al., 2007
Halococcus dombrowskii culture 1507 s, 1152 s, 1002 s Fendrihan et al., 2009
Halorubrum sodomense culture 1506 s, 1152 s, 1001 s Jehlička et al., 2013
Haloarcula vallismortis culture 1506 s, 1151 s, 1000 s Jehlička et al., 2013
Salinixanthin Salinibacter ruber culture 1512 s, 1155 s, 1003 s Jehlička et al., 2013
Bacteriorhodopsin Standard 1526 s, 1199 m, 1168 m, 1150 m, 1007 s Marshall et al., 2007
Chlorophyll Native crusts Atacama cyanobacteria 1445 m, 1308 m, 745 m, 508 m Vítek et al., 2013
Scytonemin Lyngbya aestuarii from native mat 1595 m, 1554 m, 1173 m Edwards et al., 2000
Native crusts Atacama 1596 s, 1558 s, 1321 s, 1172 m Vítek et al., 2010
Phycobiliproteins Native crusts Atacama 1631 w, 1583 w, 1370 w, 1283 w, 1235 w, 874 w, 815 w, 665 w Vítek et al., 2013
COMPATIBLE SOLUTES
Glycerol Standard 1465 m, 1315 m, 1257 m, 1110 s, 1055 s, 923 m, 850 s, 820 s, 675 m, 485 m, 416 m, 392 s De Gelder et al., 2007
Trehalose Standard 1455 m, 1411 m, 1386 m, 1371 m, 1358 vs, 1330 m, 1149 vs, 1120 vs, 1102 s, 1080 m, 1061 m, 1018 m, 912 vs838 vs, 804 m, 697 m, 671 m, 604 m, 540 s, 523 vs, 450 s, 430 m, 407 vs, 369 vs De Gelder et al., 2007
Glutamate Standard 1434 m, 1421 s, 1401 vs, 1353 m, 1341 s, 1317 s, 1293 m, 1282 m, 1142 m, 1095 m, 942 vs, 925 m, 876 s, 857 vs, 775 m, 529 m, 499 m De Gelder et al., 2007
L-proline Standard 1454 s, 1389 m, 1378 m, 1286 m, 1267 m, 1240 m, 1083 m, 1045 m, 1035 m, 994 m, 947 m, 930 m, 916 vs, 899 vs, 877 m, 850 s, 842 vs, 834 vs, 642 m, 452 vs De Gelder et al., 2007
Ectoine Standard 3009 m, 2981 m, 2944 s, 2895 m, 1469 m, 1444 m, 1392 m, 1366 w, 1316 ms, 1280 ms, 1215 w, 1207 w, 1137 m, 1072 w, 1032 w, 999 w, 850 s, 804 vw, 692 vw, br, 657 vw, 599 w, 570 w, 498 w, 432 w Jehlička et al., 2012a
Halomonas elongata culture (minimal medium) 2985 m, sh, 2937 s, br, 2888 m, br, 1633 w, 1465 vw, sh, 1439 w, sh, 1394 s, 1319 vw, sh, 1275 m, 1212 w, sh, 1136 w, 1030 vw, 1000 vw, 903 vw, 845 m, 803 vw, 686 vw, 655 vw, 596 w, 571 w, 435 vw Jehlička et al., 2012b
Hydroxyectoine Standard 3017 m, 2935 s, 861 w, 1640 w, 1613 m, 1438 m, 1349 m, 1318 ms, 1263 s, 1213 m, 1151 m, 1092 ms, 1014 s, 970 w, 901 m, 890 m, 828 ms, 751 s, 631 m, 558 m, 395 m, 381 s, 359 m, 311 m Jehlička et al., 2012a
Glycine betaine Standard 3375 m, 3290 m, 3053 m, 3034 m, 2982 m, 2969 s, 2867 w, 2937 m, 1650 w, 1462 s, 1427 m, 1412 w, 1343 m, 1132 w, 953 w, 939 w, 895 m, 783 s, 539 m, 363 m Ilczyszyn and Ratajczak, 1996
Halomonas elongata culture (complex medium) 3050 w, 3031 m, 2978 m, 2965 s, 2942 w, 2935 m, 2885 w, 2880 w, 2864 w, 2784 m, 1613 vw, 1458 m, 1423 w, 1410 w, 1340 w, 1129 w, 974 m, 952 m, 933 s, 896 w, 780 s, 725 w, 538 m, 457 w, 361 m Jehlička et al., 2012b
Ectothiorhodospira marismortui culture 3059 w, 3032 m, 2966 m, 2936 m, 1645 vw, 1625 vw, 1457 m, 1410 vw, 1394 vw, 1342 vw, 1211 vw, 1127 vw, br, 976 w, 954 w, 933 s, 897 w, 779 s, 540 m, 456 w, 422 w, 366 w, 338 w Jehlička et al., 2012b
Native gypsum crust (Eilat, Israel, red layer) 3058 w, br, 3033 m, 2969 s, 2939 ms, 2880 m, 1458 m, 1452 m, 1421 w, sh, 1337 mW, 1212 w, 1131 vw, 978 w, 956 m, 934 s, 911 mW, 899 mW, 780 s, 730 vw, br, 684 vw, 542 mW, 458 w, 369 w, 339 vw Oren et al., 2013
Glucosylglycerol 2930 br, 2907 s, 1460 s, 1366 s, br, 1340 s, br, 1265 w, br, 1127 m, 1103 w, 955 w, 897 m, 842 s, 755 w, 707 w, 666 w, 544 m, 514 m, 435 w Jehlička et al., 2012a
Mannosylglycerate (K salt) 3585 m, 3405 m, 2975 m, 2956 m, 2938 s, 2931 s, 2906 m, 1461 m, 1353 m, 1308 m, 1153 m, 1135 m, 1107 m, 1093 m, 1069 s, 1055 m, 1004 m, 958 m, 892 s, 825 s, 671 m, 589 m, 517 s, 429 w, 390 m, 350 m Jehlička et al., 2012a

s, strong bands; m, medium bands; vw, very weak bands; mw, weak bands; w, weak bands; br, broad bands; sh, shoulder.