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. Author manuscript; available in PMC: 2013 Dec 15.
Published in final edited form as: Curr Protoc Bioinformatics. 2005 Jul;0 13:10.1002/0471250953.bi1301s10. doi: 10.1002/0471250953.bi1301s10

Table 13.1.5.

Comparison of Software Features of Products for 2D Electrophoresis Gel Image Analysisa

Progenesis
Discovery
Image
Master
PD
Quest
Proteome
Weaver
Z3 BioNumerics2D Delta2D
Automatic spot detection Y Y Y Y Y Y Y
Create user defined new spots Y Y
Create program defined new spots Y Y Y Y Y Y
Delete spots Y Y Y Y Y Y Y
Join two spots Y Y Y Y Y Y Y
Split two spots Y Y Y Y Y Y
Warping Y Y Y Y Y Y
Average gels Y Y Y Y Y Y
Grouped gels Y Y Y Y Y Y
Automatic matching Y Y Y Y Y Y Y
Manual matching Y Y Y Y Y
View multiple gels at once Y Y Y Y Y Y
Background subtraction Y Y Y Y
Filtering Y Y Y Y Y
Normalization Y Y Y Y Y
3-D view Y Y Y Y Y Y Y
Noise correction Y Y
Select region of interest Y Y Y Y
Calibration Y Y Y Y Y Y
Create virtual gel from different gels Y
a

See Table 13.1.4 for software vendors and product URLs.