Table 1.

Amplification and sequencing primers for HCV NS5A and NS5B in genotypes 1a and 1b

Gene	Primer name	Primer sequence
GT1a* NS5A	HCV-1a NS5A Fwd out	GACATCTGGGACTGGATATGYGA
	HCV-1a NS5A Rew out	GTCCAGGWRTARGACATYGAGCA
	HCV-1a NS5A Fwd inn	GATATGYGAGGTGYTGAGCGA
	HCV-1a NS5A Rew inn	GAGCARCACACGACRTCYTC
	HCV-1a NS5A Rew Seq	AAGGAGTCCARRATCACCAC
	HCV-1a NS5B Fwd out	GGAGCCKGGRGATCCRGATCTYAGC
GT1a* NS5B	HCV-1a NS5B Rew out	GTTGGGGAGGAGGTAGATGCCTA
	HCV-1a NS5B Fwd inn	GAYGTCGTGTGCTGCTCRATGTC
	HCV-1a NS5B Rew inn	GAGACACGCTGTGATAAATGTCTCCC
	HCV-1a NS5B Fwd Seq	TCGTAAGCCAGCTCGYCTCATCG
	HCV-1a NS5B Rew Seq	CCTATTGATTTCACCTGGAGAG
	HCV-1b NS5A Fwd out	GGATYAAYGARGACTGYTCYAC
	HCV-1b NS5A Rew out	GACCARGACCCGTCRCTGAGRT
	HCV-1b NS5A Fwd inn	GGGAYTGGATATGCACGGT
GT1b § NS5A	HCV-1b NS5A Rew inn	GGCATGGAGGARTAYGAC
	HCV-1b NS5A Fwd Seq	ARTTGTCTGCGCCTTCYYTGAAGG
	HCV-1b NS5B Fwd out	CGYTGAGTCRTAYTCCTCCATGC
	HCV-1b NS5B Rew out	GGGCRCGAGACASGCTGTGATA
	HCV-1b NS5B Fwd inn	CTCAGYGACGGGTCYTGGTC
GT1b § NS5B	HCV-1b NS5B Rew inn	GCTGTGATATATGTCTCCCC
	HCV-1b NS5B Fwd Seq2	TGGGRGTHCGYGTRTGCGAG
	HCV-1b NS5B Rew Seq3	AGCATYGTGCAGTCCYGGAGC

*Genotype 1a; ^§ Genotype 1b.