Table 2. The top 20 most abundant A. aegypti miRNAs identified by miRanalyzer, when reads aligned to four species database.

A. aegypti		A. gambiae		D. melanogaster		B. mori
strict	loose	strict	loose	strict	loose	strict	loose
miR-184	miR-184	miR-184	miR-184	miR-184-3p	miR-184-3p	miR-184-3p	miR-184-3p
miR-275-3p	miR-275-3p	miR-275	miR-275	miR-275-3p	miR-275-3p	miR-275-3p	miR-275-3p
miR-317	miR-317	miR-317	miR-317	miR-317-3p	miR-317-3p	miR-317-3p	miR-317-3p
miR-2940-3p+	miR-2940-3p+	–	–	–	–	–	–
miR-276-3p	miR-276-3p	miR-276-3p	miR-276-3p	miR-276a-3p	miR-276a-3p	miR-276-3p	miR-276-3p
miR-92b-3p	miR-92b-3p	miR-92b	miR-92b	miR-92b-3p	miR-92b-3p	–	miR-92b
miR-2940-5p+	miR-2940-5p+	–	–	–	–	–	–
miR-281-5p	miR-283	miR-283	miR-283	miR-281-2-5p	miR-281-2-5p	miR-281-5p	miR-281-5p
miR-283	miR-281-5p	miR-2	miR-2	miR-283-5p	miR-283-5p	miR-283-5p	miR-283-5p
miR-989	miR-989	miR-989	miR-989	miR-989-3p	miR-989-3p	miR-2a-3p	miR-2a-3p
miR-305-5p	miR-305-5p	miR-305	miR-305	miR-305-5p	miR-305-5p	miR-989a	miR-989a
miR-34-5p	miR-34-5p	miR-34	miR-34	miR-2a-3p	miR-2a-3p	miR-305-5p	miR-305-5p
miR-2a-3p	miR-2a-3p	–	–	miR-34-5p	miR-34-5p	miR-34-5p	miR-34-5p
miR-998	miR-998	–	–	miR-998-3p	miR-998-3p	miR-998	miR-998
miR-14	miR-14	miR-14	miR-14	miR-14-3p	miR-14-3p	miR-14-3p	miR-14-3p
miR-92a-3p	miR-92a-3p	miR-92a	miR-92a	miR-92a-3p	miR-92a-3p		miR-92a
miR-12-5p	miR-12-5p	miR-12	miR-12	miR-12-5p	miR-12-5p	miR-12	miR-12
miR-11-3p	miR-11-3p	miR-11	miR-11	miR-11-3p	miR-11-3p	miR-11-3p	miR-11-3p
miR-1889-5p+	miR-1889-5p+	–	–	–	miR-310-5p++	miR-2779++	miR-2779++
miR-306-5p	miR-263a-5p	miR-263a	miR-263a	miR-263a-5p	miR-263a-5p	miR-263a-5p	miR-306a-5p
		miR-988++	miR-306	miR-306-5p	miR-306-5p	miR-71-5p++	miR-263a-5p
		miR-970++	bantam++	miR-988-3p++	miR-304-5p++	bantam-3p++	miR-71-5p++
		bantam++	miR-988++	bantam-3p++		miR-970-3p++
		miR-87++	miR-970++			miR-252-5p++
		miR-8++	miR-87++

A. aegypti species-specific miRNAs.

The miRNAs that appear at top 20 list when proxy references were used.