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. 2013 Nov 22;116(2):395–404. doi: 10.1007/s11060-013-1311-3

Table 3.

Genetic aberrations in AOA, GBMO-STS, GBMO-LTS, and GBM

Characteristic Subgroup 1 P value Subgroup 2 P value Subgroup 3 P value
GBMO-STS (n = 11) AOA (n = 36) GBM (n = 110) GBMO-STS (n = 11) GBMO-LTS (n = 29) GBMO-STS (n = 11)
1p/19q co-deletion
 Yes (%) 0 (0.0) (n = 11) 14 (40.0) (n = 35) 0.032* 3 (6.5) (n = 46) 0 (0.0) (n = 11) 1.0# 11 (37.9) (n = 29) 0 (0.0) (n = 11) 0.045*
IDH1 mutation
 Yes (%) 0 (0.0) (n = 10) 14 (42.4) (n = 33) 0.034* 8 (12.3) (n = 65) 0 (0.0) (n = 10) 0.533 16 (55.2) (n = 29) 0 (0.0) (n = 10) 0.005*
1q polysomy
 Yes (%) 7 (63.6) (n = 11) 8 (23.5) (n = 34) 0.037* 12 (24.5) (n = 49) 7 (63.6) (n = 11) 0.030* 13 (44.8) (n = 29) 7 (63.6) (n = 11) 0.288
19p polysomy
 Yes (%) 8 (72.7) (n = 11) 9 (26.5) (n = 34) 0.017* 13 (26.5) (n = 49) 8 (72.7) (n = 11) 0.011* 16 (55.2) (n = 29) 8 (72.7) (n = 11) 0.515
MGMT promoter
 Methylated (%) 2 (18.2) (n = 11) 16 (44.4) (n = 36) 0.225 16 (34.8) (n = 46) 2 (18.2) (n = 11) 0.482 10 (34.5) (n = 29) 2 (18.2) (n = 11) 0.536
PTEN
 Negative expression (%) 1 (12.5) (n = 8) 6 (20.7) (n = 29) 1.0# 7 (17.1) (n = 41) 1 (12.5) (n = 8) 1.0 6 (20.7) (n = 29) 1 (12.5) (n = 8) 1.0#
P53
 Negative expression (%) 2 (25.0) (n = 8) 7 (24.1) (n = 29) 1.0# 11 (26.8) (n = 41) 2 (25.0) (n = 8) 1.0 6 (20.7) (n = 29) 2 (25.0) (n = 8) 1.0#
Ki-67
 Negative expression (%) 1 (12.5) (n = 8) 13 (44.8) (n = 29) 0.123# 14 (34.1) (n = 41) 1 (12.5) (n = 8) 0.426 9 (31.0) (n = 29) 1 (12.5) (n = 8) 0.404#
EGFR
 Negative expression (%) 1 (12.5) (n = 8) 7 (24.1) (n = 29) 0.655# 4 (9.8) (n = 41) 1 (12.5) (n = 8) 1.0# 5 (17.2) (n = 29) 1 (12.5) (n = 8) 1.0#
VEGF
 Negative expression (%) 1 (12.5) (n = 8) 2 (6.9) (n = 29) 0.530# 2 (4.9) (n = 41) 1 (12.5) (n = 8) 0.421# 3 (10.3) (n = 29) 1 (12.5) (n = 8) 1.0#

MGMT O6-methylguanine-DNA-methyltransferase, PTEN phosphatase and tensin homolog, EGFR epidermal growth factor receptor, VEGF vascular endothelial growth factor

# Fisher’s exact test