Table 2.
RNAP β1 | CarD | Distance (Å) | Interaction type |
---|---|---|---|
Thr138 | Asn52 | 2.8 | H-bond and van der Waals |
Pro49 | 3.5 | van der Waals | |
Val56 | 3.9 | van der Waals | |
Gly139 | Pro49 | 3.5 | van der Waals |
Arg47 | 3.5 | van der Waals | |
Glu140 | Arg47 | 3.4 | van der Waals |
Val48 | 3.8 | van der Waals | |
Tyr11 | 2.4 | H-bond and van der Waals | |
Val56 | 3.6 | van der Waals | |
Ile141 | Arg47 | 2.8 | H-bond and van der Waals |
Thr45 | 3.4 | van der Waals | |
Val46 | 3.2 | van der Waals, hydrophobic | |
Arg25 | 3.9 | van der Waals | |
Lys142 | Thr45 | 3.3 | van der Waals |
His14 | 2.9 | H-bond and van der Waals | |
Ser143 | Thr45 | 2.8 | H-bond and van der Waals |
Leu44 | 3.6 | van der Waals | |
Gln144 | Leu44 | 3.8 | van der Waals |
Asp43 | 3.8 | van der Waals | |
Gly42 | 3.0 | H-bond and van der Waals | |
Glu404 | His14 | 3.8 | van der Waals |
His13 | 3.4 | van der Waals | |
Ala405 | His13 | 3.7 | van der Waals |
His14 | 3.7 | van der Waals | |
Thr407 | His14 | 3.3 | van der Waals |