Table 1.

Observed CrERV insertion frequency by geographic locality

Location	n	Lineage I					Lineage II				Lineage III		Lineage IV
		in1	in3	in12	in9	in6	in10	in13	in5	in8	in2	in4	in7	in11
1	17	1.00	0.41	0.12	0.50	0.00	0.00	0.00	0.35	0.00	0.35	0.53	0.00	0.12
2	17	1.00	0.47	0.18	0.71	0.00	0.00	0.00	0.41	0.00	0.29	0.47	0.12	0.06
3	17	1.00	0.53	0.18	0.56	0.00	0.00	0.00	0.35	0.00	0.47	0.35	0.12	0.06
4	18	1.00	0.50	0.06	0.56	0.00	0.00	0.00	0.22	0.00	0.11	0.56	0.06	0.00
5	17	1.00	0.29	0.00	0.50	0.29	0.12	0.06	0.12	0.06	0.47	0.18	0.00	0.18
6	16	1.00	0.53	0.00	0.56	0.13	0.00	0.00	0.19	0.00	0.25	0.25	0.00	0.00
7	18	1.00	0.56	0.00	0.72	0.11	0.00	0.00	0.17	0.00	0.22	0.39	0.00	0.06
8	13	1.00	0.46	0.00	0.77	0.08	0.00	0.00	0.23	0.00	0.54	0.50	0.00	0.15
9	15	1.00	0.20	0.07	0.60	0.07	0.07	0.00	0.20	0.00	0.40	0.47	0.00	0.00
10	17	1.00	0.50	0.06	0.76	0.06	0.00	0.00	0.29	0.00	0.29	0.65	0.00	0.12
11	15	1.00	0.57	0.07	0.53	0.13	0.00	0.00	0.13	0.00	0.40	0.53	0.00	0.00
12	18	1.00	0.33	0.00	0.83	0.00	0.00	0.00	0.17	0.00	0.22	0.44	0.00	0.06
13	17	1.00	0.47	0.00	0.41	0.06	0.00	0.00	0.38	0.00	0.24	0.41	0.00	0.00
HLN	18	1.00	0.47	0.00	0.56	0.44	0.00	0.00	0.29	0.00	0.47	0.82	0.00	0.00
UT	29	1.00	0.24	0.03	0.43	0.03	0.00	0.00	0.31	0.00	0.32	0.89	0.00	0.00
Proportion		1.000	0.426	0.050	0.593	0.092	0.011	0.004	0.258	0.004	0.331	0.514	0.019	0.050
N		261	258	262	258	262	262	262	260	262	260	259	261	262

Lineages corresponding to phylogenetic results (in Figure 2) are indicated.