Table 2.
Species distribution of non-tuberculous mycobacteria isolated in 10 European Union countries
| Species* |
Country |
|
Total | ||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Croatia (2008-2010) | Denmark (2011) | Estonia (2004-2011) | Finland (1995-2011) | Germany (2011) | Greece (2005-2011) | Italy (2001-2010) | Luxembourg (2009-2011) | Netherlands (2006-2011) | Slovenia (2000-2010) | ||
|
M. avium |
33 |
86 |
308 |
1,568 |
176 |
101 |
350 |
23 |
1,274 |
349 |
4,268 |
|
M. gordonae |
377 |
9 |
96 |
1,286 |
176 |
31 |
253 |
26 |
623 |
365 |
3,242 |
|
M. xenopi |
122 |
7 |
12 |
|
13 |
9 |
687 |
13 |
77 |
615 |
1,555 |
|
M. intracellulare |
23 |
15 |
52 |
636 |
272 |
49 |
104 |
3 |
359 |
156 |
1,669 |
|
M. fortuitum |
98 |
2 |
65 |
521 |
68 |
66 |
144 |
|
239 |
150 |
1,353 |
|
M. kansasii |
8 |
5 |
11 |
53 |
58 |
22 |
39 |
6 |
283 |
181 |
666 |
|
M. chelonae |
31 |
3 |
20 |
179 |
56 |
37 |
55 |
4 |
173 |
32 |
590 |
|
M. abscessus |
25 |
10 |
17 |
94 |
37 |
17 |
111 |
11 |
228 |
24 |
574 |
|
M. malmoense |
|
12 |
14 |
184 |
10 |
7 |
11 |
6 |
108 |
22 |
374 |
|
M. lentiflavum |
6 |
|
5 |
246 |
4 |
6 |
45 |
|
5 |
|
317 |
|
M. marinum |
|
7 |
3 |
50 |
29 |
5 |
15 |
4 |
115 |
6 |
234 |
|
M. terrae |
52 |
|
|
151 |
|
|
16 |
|
6 |
|
225 |
|
M. peregrinum |
9 |
3 |
15 |
81 |
|
20 |
33 |
1 |
6 |
|
168 |
|
M. simiae |
|
3 |
|
69 |
5 |
|
21 |
3 |
64 |
|
165 |
|
M. bohemicum |
|
|
|
106 |
1 |
|
4 |
3 |
10 |
|
124 |
|
M. chimaera |
|
|
|
|
|
|
48 |
5 |
68 |
|
121 |
|
M. interjectum |
1 |
|
3 |
87 |
6 |
|
9 |
|
14 |
|
120 |
|
M. nonchromogenicum |
18 |
|
|
38 |
1 |
|
41 |
|
1 |
21 |
120 |
|
M. arupense |
|
|
|
|
7 |
|
83 |
3 |
8 |
|
101 |
|
M. celatum |
3 |
7 |
1 |
|
3 |
8 |
12 |
1 |
11 |
21 |
67 |
|
M. mucogenicum |
3 |
|
|
|
6 |
|
38 |
|
15 |
|
62 |
|
M. scrofulaceum |
2 |
|
16 |
|
|
|
12 |
|
12 |
12 |
54 |
|
M. szulgai |
|
2 |
3 |
|
13 |
|
11 |
|
17 |
6 |
52 |
|
M. kumamotonense |
|
|
|
|
1 |
|
46 |
|
1 |
|
48 |
|
M. heraklionense |
|
|
|
|
|
|
46 |
|
|
|
46 |
|
M. genavense |
|
|
|
|
8 |
|
5 |
|
18 |
|
31 |
|
M. phlei |
4 |
|
|
|
7 |
|
3 |
|
13 |
|
27 |
|
M. vulneris |
|
|
|
|
26 |
|
1 |
|
|
|
27 |
|
M. haemophilum |
|
|
|
|
1 |
|
1 |
|
18 |
|
20 |
|
M. triviale |
15 |
|
|
|
|
|
2 |
|
|
|
17 |
|
M. arosiense |
|
|
|
|
|
|
15 |
|
|
|
15 |
|
M. florentinum |
|
|
|
|
1 |
|
6 |
5 |
|
|
12 |
|
M. nebraskense |
|
|
|
|
11 |
|
1 |
|
|
|
12 |
|
M. neoaurum |
|
|
|
|
3 |
|
5 |
|
4 |
|
12 |
|
M. vaccae |
10 |
|
|
|
|
|
1 |
|
|
|
11 |
|
M. elephantis |
|
|
|
|
|
|
10 |
|
|
|
10 |
|
M. insubricum |
|
|
|
|
1 |
|
8 |
|
|
|
9 |
|
M. parascrofulaceum |
|
|
|
|
4 |
|
5 |
|
|
|
9 |
|
M. sherrisii |
|
|
|
|
|
|
9 |
|
|
|
9 |
|
M. alvei |
|
|
|
|
|
|
2 |
|
6 |
|
8 |
|
M. porcinum |
|
|
|
|
|
|
5 |
2 |
1 |
|
8 |
|
M. europaeum |
|
|
|
|
3 |
|
4 |
|
|
|
7 |
|
M. flavescens |
6 |
|
|
|
|
|
1 |
|
|
|
7 |
|
M. shimoidei |
|
|
|
|
|
|
4 |
|
3 |
|
7 |
|
M. gilvum |
|
|
|
|
|
|
6 |
|
|
|
6 |
|
M. longobardum |
|
|
|
|
|
|
6 |
|
|
|
6 |
|
M. paraffinicum |
|
|
|
|
1 |
|
4 |
|
1 |
|
6 |
|
M. triplex |
|
|
|
|
|
|
6 |
|
|
|
6 |
|
M. branderi |
|
1 |
|
|
1 |
|
|
|
3 |
|
5 |
|
M. goodii |
|
|
|
|
1 |
|
1 |
|
3 |
|
5 |
|
M. holsaticum |
|
|
|
|
2 |
|
2 |
|
1 |
|
5 |
|
M. smegmatis |
|
|
|
|
|
|
4 |
|
1 |
|
5 |
|
M. thermoresistibile |
1 |
|
|
|
|
|
4 |
|
|
|
5 |
|
M. cosmeticum |
|
|
|
|
|
|
1 |
|
3 |
|
4 |
|
M. heckeshornense |
|
1 |
|
|
1 |
|
1 |
|
1 |
|
4 |
|
M. agri |
|
1 |
|
|
|
|
|
|
2 |
|
3 |
|
M. brumae |
|
|
|
|
|
|
2 |
|
1 |
|
3 |
|
M. flavescens/ M. novocastrense |
|
|
|
|
3 |
|
|
|
|
|
3 |
|
M. frederiksbergense |
|
|
|
|
|
|
3 |
|
|
|
3 |
|
M. hassiacum |
|
|
|
|
1 |
|
|
|
2 |
|
3 |
|
M. heidelbergense |
|
|
|
|
1 |
|
|
|
2 |
|
3 |
|
M. lepraemurium |
|
|
|
|
3 |
|
|
|
|
|
3 |
|
M. mantenii |
|
|
|
|
|
|
2 |
|
1 |
|
3 |
|
M. noviomagense |
|
|
|
|
|
|
1 |
|
2 |
|
3 |
|
M. palustre |
|
|
|
|
|
|
3 |
|
|
|
3 |
|
M. setense |
|
|
|
|
|
|
3 |
|
|
|
3 |
|
M. wolinskyi |
|
|
|
|
1 |
|
|
|
2 |
|
3 |
|
M. aichiense |
|
|
|
|
|
|
2 |
|
|
|
2 |
|
M. engbaekii |
|
|
|
|
|
|
2 |
|
|
|
2 |
|
M. gastri |
|
|
|
|
|
|
2 |
|
|
|
2 |
|
M. immunogenum |
|
|
|
|
|
|
2 |
|
|
|
2 |
|
M. intermedium |
|
|
|
|
|
|
2 |
|
|
|
2 |
|
M. llatzerense |
|
|
|
|
|
|
2 |
|
|
|
2 |
|
M. mageritense |
|
|
|
|
|
|
|
|
2 |
|
2 |
|
M. monacense |
|
|
|
|
|
|
2 |
|
|
|
2 |
|
M. novocastrense |
|
|
|
|
|
|
1 |
|
1 |
|
2 |
|
M. phocaicum |
|
|
|
|
1 |
|
1 |
|
|
|
2 |
|
M. pulveris |
|
|
|
|
|
|
2 |
|
|
|
2 |
|
M. rhodesiae |
|
|
|
|
|
|
2 |
|
|
|
2 |
|
M. riyadhense |
|
|
|
|
1 |
|
1 |
|
|
|
2 |
|
M. asiaticum |
|
|
|
|
|
|
|
|
1 |
|
1 |
|
M. aubagnense |
|
|
|
|
1 |
|
|
|
|
|
1 |
|
M. chlorophenolicum |
1 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
1 |
|
M. colombiense |
|
|
|
|
|
|
1 |
|
|
|
1 |
|
M. conceptionense |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
1 |
1 |
|
M. conspicuum |
|
|
|
|
|
|
|
|
1 |
|
1 |
|
M. duvalii |
|
|
|
|
|
|
1 |
|
|
|
1 |
|
M. fluoroanthenivorans |
|
|
|
|
1 |
|
|
|
|
|
1 |
|
M. gadium |
|
|
|
|
|
|
1 |
|
|
|
1 |
|
M. hiberniae |
|
|
|
|
|
|
1 |
|
|
|
1 |
|
M. kyorinense |
|
|
|
|
1 |
|
|
|
|
|
1 |
|
M. massiliense |
|
|
|
|
|
|
|
1 |
|
|
1 |
|
M. parmense |
|
|
|
|
|
|
1 |
|
|
|
1 |
|
M. poriferae |
|
|
|
|
|
|
1 |
|
|
|
1 |
|
M. senegalense |
|
|
|
|
|
|
1 |
|
|
|
1 |
|
M. senuense |
|
|
|
|
|
|
1 |
|
|
|
1 |
|
M. timonense |
|
|
|
|
|
|
|
1 |
|
|
1 |
|
M. tokaiense |
|
|
|
|
|
|
1 |
|
|
|
1 |
|
M. tusciae |
|
|
|
|
|
|
1 |
|
|
|
1 |
| Unknown |
|
8 |
57 |
429# |
41 |
48 |
96 |
2 |
186 |
279 |
717 |
| Total | 848 | 182 | 698 | 5,778 | 1,068 | 426 | 2,498 | 123 | 3,996 | 2,240 | 17,857 |
*Croatia, Estonia, Germany, Greece, Luxembourg and Slovenia report positive specimens, Denmark, Finland, Italy and the Netherlands report patients with NTM.
#Unknown species and rare species.