Table 4. Strain identities and PCR results of the ring trial on B. anthracis genome detection by PCR. Five laboratories participated in the ring trial.
| Species | Strain name | DNA ng/µl | BA5345 Antwerpen | PL3 Wielinga | BA5357 Letant | BA813 Coker | sap (S-layer) WHO 1998 | B-type SASP WHO 2008 | ||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| B. anthracis | 17JB | 0.5 | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | − | − | + | + | + | + | + | u | + | u |
| B. anthracis | 08-1298 | 0.5 | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | − | + | + | + | + | − | + | + | + | + | + | u | + | u |
| B. anthracis | 09-1122 | 0.2 | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | u | + | u |
| B. anthracis | 07-1371 | 0.2 | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | − | + | + | + | + | − | u | + | u |
| B. anthracis | 07-1167 | 0.2 | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | − | − | + | + | + | + | − | u | + | u |
| B. anthracis | 92-9066 | 0.1 | + | − | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | − | + | + | + | − | − | − | + | − | + | − | u | + | u |
| B. anthracis | CIP 53.169 | 0.5 | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | u | + | u |
| B. anthracis | CIP 74.12 | 0.5 | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | − | + | + | + | + | + | u | + | u |
| B. anthracis | CIP 81.89 | 0.5 | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | − | − | + | + | + | + | − | u | + | u |
| B. anthracis | CIP A204 | 0.5 | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | − | − | + | + | + | + | + | u | + | u |
| B. anthracis | CIP A205 | 0.5 | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | − | + | + | + | + | + | u | + | u |
| B. anthracis | CIP A206 | 0.5 | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | − | − | + | + | + | + | + | u | + | u |
| B. anthracis | CIP A211 | 0.5 | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | − | − | + | + | + | − | u | + | u |
| B. cereus | ATCC 14579 | 0.5 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | u | + | u |
| B. cereus | 06.1248 | 0.2 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | u | − | u |
| B. cereus | 08.1458 | 0.5 | − | − | − | − | − | − | d | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | u | − | u |
| B. cereus | 97-BC14 | 0.2 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | + | − | + | − | − | − | − | − | − | − | u | − | u |
| B. cereus | 00.624.49 | 0.5 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − | u | − | u |
| B. cereus | 97-BC17 | 0.5 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | u | − | u |
| B. cereus | 97-BC18 | 0.5 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − | u | + | u |
| B. cereus | 97-BC59 | 0.5 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | u | − | u |
| B. cereus | CIP A28 | 0.5 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | d | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | u | − | u |
| B. cereus | CIP 63.81 | 0.1 | − | − | − | − | d | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | u | − | u |
| B. cereus | CIP 70.1 | 0.5 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | d | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | u | − | u |
| B. gibsonii | CIP 104.720 | 0.5 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | d | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | u | − | u |
| B. licheniformis | ATCC 14580 | 0.5 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | u | − | u |
| B. subtilis | ATCC 6051 | 0.3 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | d | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | u | − | u |
| B. anthracis | 23932 | 0.5 | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | u | + | u |
| B. anthracis | 56430 | 0.5 | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | u | + | u |
| B. anthracis | 131959-5 | 0.5 | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | − | + | + | + | + | + | u | + | u |
| B. anthracis | 127491 | 0.5 | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | u | + | u |
| B. anthracis | 188678-1 | 0.5 | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | u | + | u |
| B. anthracis | 13185 | 0.5 | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | u | + | u |
| B. anthracis | 128268 | 0.5 | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | u | + | u |
| B. cereus | 1847 | 0.5 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | u | − | u |
| B. anthracis | 132064-1 | 0.5 | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | u | + | u |
| B. atrophaeus | ATCC 9372 | 0.5 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | u | − | u |
| B. cereus | ATCC 11778 | 0.5 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | u | − | u |
| B. cereus | WSBC 10530 | 0.5 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | d | − | − | − | − | − | − | − | u | − | u |
| B. cereus | WSBC 10536 | 0.5 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | u | − | u |
| B. cereus | WSBC 10583 | 0.5 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | u | − | u |
| B. cereus | WSBC 10619 | 0.5 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | u | − | u |
| B. cereus | NVH0597-99 | 0.5 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | + | + | + | − | − | + | − | + | − | − | u | − | u |
| B. cereus | ATCC 10702 | 0.5 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | d | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | u | − | u |
| B. cereus | WSBC 10286 | 0.5 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | u | − | u |
| B. cereus | WSBC 10483 | 0.5 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − | u | − | u |
| B. cereus | WSBC 10566 | 0.5 | d | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − | u | − | u |
| B. cereus | WSBC 10572 | 0.5 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | + | + | + | − | + | + | + | + | − | − | u | − | u |
| B. cereus | WSBC 10705 | 0.5 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | + | + | + | − | − | + | − | − | − | − | u | − | u |
| B. cereus | WSBC 10763 | 0.5 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | + | + | + | + | + | + | − | − | u | − | u |
| B. cereus | WSBC 10770 | 0.5 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | + | + | + | − | − | − | − | − | − | + | u | − | u |
| B. cereus | ATCC 10987 | 0.5 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − | u | − | u |
| B. coagulans | 0.5 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | u | − | u | |
| B. pumilus | ATCC 27142 | 0.5 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | u | − | u |
| B. megaterium | ATCC 8245 | 0.5 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | u | − | u |
| B. subtilis | ATCC 6633 | 0.5 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | u | − | u |
| B. thuringiensis var galleriae | ATCC 29730 | 0.5 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | u | − | u |
| B. thuringiensis ser thuringiensis | NRRL HD-2 | 0.5 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | u | − | u |
| B. thuringiensis ser aizawai | NRRL HD-11 | 0.5 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | u | − | u |
| B. thuringiensis ser kurstaki | NRRL HD-73 | 0.5 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | u | − | u |
| B. anthracis | NCTC 109 | 0.5 | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | u | + | u |
| B. anthracis | NCTC 8234 | 0.5 | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | − | − | + | + | + | + | + | u | + | u |
| B. anthracis | NCTC 7753 | 0.5 | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | u | + | u |
| B. anthracis | NCTC 7752 | 0.5 | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | u | + | u |
| B. anthracis | NCTC 5444 | 0.5 | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | u | + | u |
| B. anthracis | NCTC 2620 | 0.5 | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | − | − | + | + | + | + | + | u | + | u |
| B. anthracis | NCTC 1328 | 0.5 | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | u | + | u |
| B. anthracis | NCTC 10340 | 0.5 | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | − | − | + | − | + | + | + | u | + | u |
| B. cereus | BGSC 6E1 | 0.5 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − | u | − | u |
| B. thuringiensis ser pulsiensis | BGSC 4CC1 | 0.5 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | − | u | − | u |
| B. thuringiensis ser andalousiensis | BGSC 4AW1 | 0.5 | − | − | − | − | d | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − | u | + | u |
| B. thuringiensis ser pondicheriensis | BGSC 4BA1 | 0.5 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | − | − | u | + | u |
| B. thuringiensis ser monterrey | BGSC 4AJ1 | 0.5 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | − | − | u | − | u |
| B. thuringiensis ser huazhongensis | BGSC 4BD1 | 0.5 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | d | − | d | − | − | − | − | − | − | − | u | − | u |
| B. thuringiensis ser tochigiensis | BGSC 4Y1 | 0.5 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | + | + | + | − | − | − | − | − | + | − | u | + | u |
| B. megaterium | DSM 319 | 0.5 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | d | − | + | − | − | − | − | − | − | − | u | − | u |
| B. pumilus | ATCC 7061 | 0.5 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | d | − | − | − | − | − | − | − | − | − | u | − | u |
| B. thuringiensis ser Berliner | ATCC 10792 | 0.5 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | d | − | + | − | − | − | − | + | − | − | u | − | u |
| B. weihenstephanensis | KBAB4 | 0.5 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | d | − | − | − | − | − | − | + | − | − | u | − | u |
| B. pseudomycoides | DSM 12442 | 0.5 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | d | − | − | − | − | − | − | + | − | − | u | − | u |
| B. cereus | ATCC 10876 | 0.5 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | u | − | u |
| B. mycoides | ATCC 6462 | 0.5 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | u | − | u |
| B. subtilis | NCTC 3610 | 0.5 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | u | − | u |
| B. subtilis | NCTC 10400 | 0.5 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | u | − | u |
| B. thuringiensis ser israelensis | ATCC 35646 | 0.5 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | u | − | u |
| B. cereus | ATCC 4342 | 0.5 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | + | + | + | − | − | − | − | + | − | − | u | − | u |
| B. thuringiensis ser konkukian | 97-27 | 0.5 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | + | + | + | − | − | − | − | + | − | − | u | + | u |
| B. cereus | SJ1 | 0.5 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | + | d | + | − | − | − | − | + | − | − | u | + | u |
| B. anthracis | SVA-2008 | 0.5 | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | u | + | u |
| B. anthracis | SVA-2011 | 0.5 | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | u | + | u |
d, doubtful; u, unsuccesfully analyzed; +, PCR positive; −, PCR negative; ser, serovar; var, variant