Table 3. Comparison of deduced amino acid sequences (specific positions) of Angolan HBV isolates and HBV/E consensus.

	Consensus amino acids and positions
	Pre-S1 region								Pre-S2 region								S region
Samples	34	38	56	66	76	84	85	90	5	11	16	17	18	19	22	39	3	10	13	14	20	21	45	83	129	164	189	193	195	203	204
	R	R	K	F	W	L	K	D	S	A	R	V	R	G	F	A	S	G	L	V	F	L	A	F	Q	E	T	S	I	P	S
Concurrent HBsAg and anti-HBs
LDA067	.	.	.	.	.	.	.	N	.	.	.	.	K	.	.	.	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
LDA072	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	.	.	.	.
LDA111	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
LDA232	.	.	.	–	–	.	T	.	A	.	.	.	K	.	.	.	.	.	P	.	S	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.
LDA265	K	.	E	.	.	.	T	.	.	.	.	.	.	.	–	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	.	.	.	.	.	.
LDA277	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
LDA278	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
LDA423	K	.	.	.	.	.	T	.	.	.	K	A	K	–	–	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
LDA470	.	.	.	.	S	.	.	N	.	.	K	–	–	–	–	.	.	E	R	.	.	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.
LDA481	K	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	.	.	Q	N
LDA489	.	.		.	.	.	.	.	.	.	.	–	–	–	–	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	.	.	K
LDA494	K	.	.	I	.	.	.	.	.	.	K	.	.	.	.	.	.	.	.	A	.	S	.	.	.	.	.	.	.	R	.
HBsAg without anti-HBs
LDA154	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
LDA173	.	.	.	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	.	.	M	.	.
LDA264	.	K	.	V	.	.	.	.	Y	T	.	.	.	.	S	.	.	K	.	.	.	.	.	.	.	.	I	.	.	.	.
LDA274	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
LDA332	.	.	.	.	.	.	.	N	.	.	.	.	.	D	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	.	.	.	.	.
LDA335	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
LDA339	.	.	.	.	.	.	T	.	.	.	.	.	.	.	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	D	.	L	M	.	.
LDA379	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	.	.	.	.	.	.	.	.
LDA349	.	.	.	.	*	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
LDA386	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
LDA399	.	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
LDA405	.	.	.	.	.	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	.	.	.	.	.	.	.	.
LDA408	.	K	Q	.	.	.	.	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	S	.	.	C	.	G	I	.	.	.	.
LDA417	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
LDA439	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
LDA445	.	.	.	.	.	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
LDA452	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	.	.	.	.	.	.	C	.	.	.	.	.	.	.
LDA504	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.

Consensus sequence shown at the top of the table was deduced from the HBV/E full-length sequences available in GenBank. Only positions for which at least two, but not all, Angolan isolates showed differences with the consensus sequence, are shown.

–: deletion; *: stop codon.