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. Author manuscript; available in PMC: 2015 Mar 1.
Published in final edited form as: Immunogenetics. 2013 Nov 30;66(3):199–213. doi: 10.1007/s00251-013-0749-y

Table 3.

Zebrafish Class I putative peptide anchor residues

N-terminus C-terminus

7 59 159 171 84 123 143 146 147
HLA Y Y Y Y Y Y T K W
Fish Y Y Y Y R F T K W
Uaa Y Y Y Y R F T K W
Uba A Y Y Y R F T K W
Uca A Y Y Y R F T K W
Uda Y Y Y Y R F T K W
Uea Y Y Y Y R F T N W
Ufa V F Y Y R F T K W
Uga Y Y Y Y R F T K W
Uha A Y Y Y R F T K L
Uia Y Y Y Y R W T N W
Uja Y F Y Y R F T K W
Uka A Y Y Y R F T K W

Putative peptide anchor residues, based on an alignment with other vertebrate Class I MHC genes. HLA represents a consensus of classical human Class I sequences (HLA-A, B, C). Fish represents a consensus sequence from teleost Class I MHC genes thought to be classical. Anchor residue numbering is based on the human HLA-A2 gene