Table 1. Bacillus subtilis strains used in this study.
| Strain | Genotype | Source/construction†‡ |
| 168 | trpC2 | Laboratory collection |
| 8G5 sinR : : tet | trpC2 tyr-1 his ade met rib ura nic sinR : : tet | Oscar Kuipers, Groningen, the Netherlands |
| AM373 | sfp+ ermC epsC+ swrA+ degQ+ amyE : : (P-rapP phrP cat) (yvzG/yvyD spc) | McLoon et al. (2011) |
| GP736 | trpC2 ΔsinR : : tet | 8G5 sinR : : tet → 168 |
| GP1517 | trpC2 ΔepsA : : aphA3 | this work |
| GP1518 | trpC2 ΔepsB : : aphA3 | this work |
| GP1519 | trpC2 ΔepsAB : : aphA3 | this work |
| GP1526 | trpC2 epsA-3x FLAG spc | pGP2127 → 168 |
| GP1528 | trpC2 sfp+ ermC epsC+ swrA+ degQ+ amyE : : (P-rapP phrP cat)(yvzG/yvyD Ωspc) ΔepsAB : : aphA3 | GP1519 → AM373 |
| GP1535 | trpC2 sfp+ ermC epsC+ swrA+ degQ+ amyE : : (P-rapP phrP cat)(yvzG/yvyD Ωspc) ΔepsB : : aphA3 | GP1518 → AM373 |
| GP1540 | trpC2 sfp+ ermC epsC+ swrA+ degQ+ amyE : : (P-rapP phrP cat)(yvzG/yvyD Ωspc) ΔepsA : : aphA3 | GP1517 → AM373 |
| GP1542 | trpC2 xkdE : : Pxyl-epsB ermC | pGP2129 → 168 |
| GP1566 | trpC2 ΔtkmA : : spc | this work |
| GP1567 | trpC2 ΔepsA : : aphA3 ΔtkmA : : spc | GP1566 → GP1517 |
| GP1568 | trpC2 ΔepsA : : aphA3 ΔtkmA : : spc xkdE : : Pxyl-epsA ermC | pGP2147 → GP1567 |
| GP1575 | ΔepsB : : aphA3 | GP1535 → NCIB3610* |
| GP1577 | ΔptkA ΔepsB : : aphA3 | GP1535 → NRS2544* |
| GP1589 | trpC2 sinR : : tet epsA-3x FLAG spc | GP736 → GP1526 |
| GP1600 | ΔepsA : : aphA3 | GP1540 → NCIB3610* |
| GP1602 | tkmA : : spc | GP1566 → NCIB3610* |
| GP1611 | ΔepsA : : aphA3 tkmA : : spc | GP1566 → GP1600* |
| GP1622 | ΔsinR-tasA : : cat | GP1672 → NCIB3610* |
| GP1623 | ΔepsB : : aphA3 ΔsinR-tasA : : cat | GP1672 → GP1575* |
| GP1624 | ΔptkA ΔsinR-tasA : : cat | GP1672 → NRS2544* |
| GP1625 | ΔepsB : : aphA3 ΔptkA ΔsinR-tasA : : cat | GP1672 → GP1577* |
| GP1626 | ΔepsA : : aphA3 ΔsinR-tasA : : cat | GP1672 → GP1600* |
| GP1627 | ΔtkmA : : spc ΔsinR-tasA : : cat | GP1672 → GP1602* |
| GP1628 | ΔepsA : : aphA3 ΔtkmA : : spc ΔsinR-tasA : : cat | GP1672 → GP1611* |
| GP1629 | ΔepsA-O : : tet ΔsinR-tasA : : cat | GP1672 → NRS2450* |
| GP1634 | ΔepsB : : aphA3 ΔptkA xkdE : : Pxyl-epsB ermC | GP1542 → GP1577* |
| GP1636 | ΔepsA : : aphA3 ΔtkmA : : spc xkdE : : Pxyl-epsA ermC | GP1568 → GP1611* |
| GP1637 | ΔepsAB : : aphA3 | GP1528 → NCIB3610* |
| GP1672 | trpC2 ΔsinR-tasA : : cat | this work |
| NRS2450 | ΔepsA-O : : tet | Ostrowski et al. (2011) |
| NRS2499 | epsB (D81A+D83A) | pNW329 → NCIB3610* |
| NRS2544 | ΔptkA | Kiley & Stanley-Wall (2010) |
†
Arrows indicate construction by transformation.
‡
Asterisks indicate construction by SPP1 phage transduction. BSGC represents the Bacillus genetic stock centre. Antibiotic resistance cassettes are: aphA3, kanamycin; cat, chloramphenicol; tet, tetracycline; spc, spectinomycin; ermC, erythromycin.