Table 2.
Relative abundance of bacterial families present within insect gut communities
| Taxonomic designation | Ha01 | Ha02 | Ha03 | Md01 | Md02 | Md03 | Cp01 | Cp02 | Cp03 | PaL01 | PaL02 | PaL03 | PaW01 | PaW02 | PaW03 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Actinobacteria; Actinobacteria | 1.06 (8) | 0.23 (7) | 1.01 (8) | 2.74 (8) | 2.74 (10) | 4.14 (9) | 0.70 (10) | 0.37 (10) | 0.49 (9) | n.d. (0) | n.d. (0) | n.d. (1) | 0.18 (6) | 0.91 (7) | 0.51 (8) |
| Actinobacteria; Coriobacteria | 0.05 (2) | 0.02 (2) | 0.01 (2) | 0.55 (3) | 1.21 (3) | 0.47 (3) | 1.00 (4) | 1.07 (4) | 0.86 (4) | 0.12 (2) | 0.08 (2) | 0.13 (2) | 4.49 (2) | 1.44 (2) | 0.99 (2) |
| Bacteroidetes; Bacteroidia | 75.83 (21) | 95.68 (17) | 83.53 (18) | 42.41 (52) | 28.31 (51) | 33.95 (50) | 36.66 (46) | 48.57 (50) | 44.71 (50) | 41.02 (89) | 58.21 (88) | 56.59 (100) | 1.51 (50) | 19.75 (55) | 14.83 (88) |
| Candidate division TM7 | 0.04 (2) | 0.01 (1) | 0.04 (2) | 1.53 (13) | 2.22 (14) | 0.94 (11) | 1.08 (12) | 1.09 (10) | 0.65 (8) | 0.26 (4) | 0.09 (3) | 0.31 (6) | 0.31 (5) | 1.87 (7) | 0.29 (6) |
| Deferribacteres; Deferribacteres | n.d. (0) | n.d. (0) | n.d. (0) | n.d. (0) | n.d. (0) | n.d. (0) | 3.51 (1) | 4.81 (1) | 1.45 (1) | 0.02 (1) | 0.23 (2) | 0.23 (2) | n.d. (0) | n.d. (0) | 0.05 (2) |
| Elusimicrobia; Elusimicrobia | 0.04 (2) | 0.01 (2) | 0.02 (2) | 4.31 (8) | 1.87 (9) | 6.07 (7) | 0.57 (2) | 0.26 (3) | 0.8 (2) | 2.16 (5) | 1.07 (5) | 0.26 (3) | 0.01 (1) | 0.05 (1) | 0.1 (3) |
| Firmicutes; Bacilli | 5.92 (9) | 0.2 (7) | 0.81 (11) | 4.18 (5) | 3.47 (5) | 1.54 (4) | 5.79 (9) | 7.88 (8) | 7.98 (8) | 20.29 (7) | 0.24 (5) | 0.01 (2) | 1.54 (8) | 4.13 (6) | 24.8 (10) |
| Firmicutes; Clostridia | 4.00 (67) | 1.05 (50) | 3.11 (67) | 24.75 (97) | 38.2 (109) | 17.7 (84) | 35.02 (140) | 24.5 (138) | 29.19 (147) | 22.98 (117) | 22.4 (151) | 15.86 (151) | 61.81 (142) | 48.82 (100) | 44.06 (186) |
| Firmicutes; Erysipelotrichi | n.d. (0) | n.d. (0) | n.d. (0) | 0.16 (2) | 0.43 (2) | 0.07 (2) | 0.05 (1) | 0.09 (1) | 0.02 (1) | 0.9 (6) | 0.23 (7) | 0.55 (7) | 1.58 (5) | 0.96 (3) | 0.4 (5) |
| Fusobacteria; Fusobacteria | n.d. (0) | n.d. (0) | n.d. (0) | 3.00 (1) | 4.25 (1) | 6.12 (1) | n.d. (0) | n.d. (0) | n.d. (0) | 0.02 (1) | n.d. (0) | n.d. (0) | 13.71 (1) | 1.11 (1) | 0.22 (1) |
| Lentisphaerae; Lentisphaeria | n.d. (0) | n.d. (0) | n.d. (0) | 0.30 (3) | 0.25 (3) | 0.1 (2) | n.d. (0) | n.d. (0) | n.d. (0) | 0.26 (4) | 1.49 (5) | 3.17 (5) | 0.18 (2) | n.d. (0) | 0.08 (2) |
| Planctomycetes; Planctomycetacia | 0.43 (2) | 0.01 (1) | 0.13 (2) | 0.24 (3) | 0.12 (2) | 0.19 (3) | 0.24 (1) | 0.26 (2) | 0.12 (2) | 0.12 (3) | 0.29 (6) | 0.14 (5) | 0.83 (5) | 0.19 (4) | 1.85 (6) |
| Planctomycetes; vadinHA49 | 0.04 (1) | 0.03 (1) | 0.11 (1) | n.d. (0) | n.d. (0) | n.d. (0) | 2.65 (4) | 1.49 (3) | 2.36 (4) | 0.05 (2) | 0.28 (5) | 0.67 (5) | 3.29 (4) | 1.06 (4) | 2.65 (5) |
| Proteobacteria; Alphaproteobacteria | 0.08 (4) | 0.06 (3) | 0.04 (4) | 0.14 (6) | 0.61 (9) | 0.24 (4) | 1.62 (15) | 1.17 (14) | 0.86 (14) | 1.88 (9) | 2.3 (14) | 1.42 (16) | 0.03 (3) | 0.1 (1) | 0.04 (5) |
| Proteobacteria; Betaproteobacteria | 0.70 (5) | 0.42 (6) | 0.71 (6) | 0.73 (5) | 1.22 (5) | 0.6 (4) | 1.52 (7) | 1.36 (9) | 2.39 (9) | 0.71 (3) | 0.36 (6) | 0.19 (6) | 3.39 (6) | 0.43 (1) | 0.27 (3) |
| Proteobacteria; Deltaproteobacteria | 0.35 (5) | 0.06 (5) | 0.41 (6) | 0.02 (1) | 0.03 (1) | 0.15 (1) | 0.85 (9) | 0.16 (7) | 0.46 (8) | 3.26 (20) | 5.94 (26) | 10.38 (32) | 5.84 (20) | 12.88 (15) | 5.69 (26) |
| Proteobacteria; Gammaproteobacteria | 0.59 (2) | 0.01 (1) | 0.1 (2) | 0.22 (2) | 0.34 (3) | 0.23 (2) | 0.35 (4) | 0.19 (6) | 0.42 (6) | 0.64 (2) | 0.18 (1) | n.d. (0) | 0.03 (2) | 0.05 (1) | 0.04 (2) |
| Spirochaetes; Spirochaetes | 8.84 (39) | 1.87 (32) | 8.34 (40) | 9.67 (45) | 5.93 (39) | 20.02 (42) | 4.74 (15) | 4.47 (15) | 4.88 (16) | 2.38 (7) | 2.69 (11) | 2.96 (12) | 0.43 (1) | 1.3 (4) | 0.72 (6) |
| Synergistetes; Synergistia | 1.24 (5) | 0.12 (5) | 0.75 (5) | 0.55 (7) | 1.09 (8) | 0.6 (7) | 1.31 (5) | 0.77 (5) | 0.79 (5) | 0.26 (2) | 0.47 (4) | 1.21 (4) | 0.35 (3) | 1.78 (2) | 0.81 (3) |
| Tenericutes; Mollicutes | 0.01 (1) | 0.02 (1) | 0.02 (1) | 1.42 (7) | 5.02 (7) | 4.87 (5) | 0.66 (7) | 0.33 (6) | 0.47 (8) | 0.64 (4) | 1.55 (4) | 1.25 (5) | 0.22 (3) | 0.86 (3) | 0.25 (5) |
| Verrucomicrobia; Opitutae | 0.02 (1) | 0.01 (1) | 0.03 (1) | 2.30 (5) | 1.3 (4) | 1.27 (5) | 0.55 (6) | 0.53 (7) | 0.31 (8) | 0.07 (1) | 0.08 (2) | 0.05 (2) | n.d. (0) | 0.05 (1) | 0.04 (1) |
| Other bacterial families (21 families) | 0.77 (8) | 0.19 (5) | 0.83 (8) | 0.52 (10) | 1.14 (14) | 0.19 (5) | 0.98 (12) | 0.38 (12) | 0.61 (14) | 1.69 (9) | 1.2 (14) | 3.88 (16) | 0.2 (4) | 2.07 (5) | 1.22 (12) |
| Archaea (4 families) | n.d. (0) | n.d. (0) | n.d. (0) | 0.25 (3) | 0.25 (3) | 0.54 (2) | 0.14 (2) | 0.26 (3) | 0.17 (3) | 0.26 (1) | 0.64 (3) | 0.73 (2) | 0.06 (2) | 0.19 (2) | 0.1 (4) |
Values represent the percentage of all taxonomically-assigned OTUs within each sample. Parenthesized values represent the real number of OTUs within each sample assigned to that taxonomic group. n.d.-not detected.