Table 3. SNP-string frequency in European and US populations*.
Final “Identified” SNP-String Frequencies (%) * | ||||||||||||||||||||||||
a1 | a2 | a3 | a4 | a5 | a6 | a7 | a8 | a9 | a10 | a11 | a12 | a13 | a14 | a15 | a16 | a17 | a18 | a19 | a20 | a21 | a22 | a23 | a24 | |
DRB1 | ||||||||||||||||||||||||
Cases | ||||||||||||||||||||||||
US | 7 | 27 | 16 | 13 | 1 | 1 | 12 | 6 | 2 | 1 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 2 | 0 | 5 | 1 | ||
EU | 8 | 29 | 15 | 16 | 1 | 1 | 11 | 5 | 2 | 0 | 1 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 4 | 2 | ||
Controls | ||||||||||||||||||||||||
US | 12 | 11 | 19 | 12 | 1 | 2 | 18 | 8 | 3 | 0 | 1 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 7 | 2 | ||
EU | 13 | 13 | 21 | 17 | 0 | 1 | 13 | 7 | 1 | 0 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 6 | 1 | ||
MMEL1 | ||||||||||||||||||||||||
Cases | ||||||||||||||||||||||||
US | 14 | 1 | 48 | 12 | 12 | 2 | 5 | 1 | 1 | 1 | 0 | 1 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
EU | 12 | 1 | 45 | 13 | 14 | 2 | 5 | 1 | 2 | 0 | 0 | 0 | 2 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
Controls | ||||||||||||||||||||||||
US | 15 | 1 | 41 | 13 | 13 | 2 | 5 | 1 | 2 | 0 | 1 | 0 | 1 | 2 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
EU | 14 | 1 | 45 | 10 | 13 | 2 | 5 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 2 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
*Percentages are rounded to the nearest percent. In almost every case, the number 0 does not actually represent zero. Only “identified” SNP-strings are displayed in the Table but numbers are derived from the “complete” analysis (see text).