Table 3.

Abundance of miRNAs with precursors identified^*

name	miRNA						miRNA*
	CF	IF	CH	IH	IF/CF	IH/CH	CF	IF	CH	IH	IF/CF	IH/CH
mse-miR-1	48891	5310	3012	1293	0.11	0.43
mse-miR-1b	6		3	8
mse-miR-2a	897	318	1234	482	0.35	0.39	456	107	404	216	0.23	0.53
mse-miR-2b	243	82	367	160	0.34	0.44	84	19	50	23	0.23	0.46
mse-miR-7	90	16	205	118	0.18	0.58			1
mse-miR-8	34494	24829	7961	8698	0.72	1.09	10939	1469	4233	2888	0.13	0.68
mse-miR-9a	660	264	715	354	0.40	0.50	63	64	77	22	1.02	0.29
mse-miR-9b	117	14	10	4	0.12	0.40	201	14	17	2	0.07	0.12
mse-miR-10a	771	88	130	114	0.11	0.88	9	3	2
mse-miR-11	1830	563	2065	2937	0.31	1.42		1
mse-miR-12	828	541	140	247	0.65	1.76
mse-miR-14	195	221	579	72	1.13	0.12	33	29	39	20	0.88	0.51
mse-miR-31		3	5	2			110299	10207	71413	34506	0.09	0.48
mse-miR-33	180	80	97	47	0.44	0.48		1	3	2
mse-miR-34	309	179	585	677	0.58	1.16		11	12	20		1.67
mse-miR-71	732	229	877	993	0.31	1.13	3	28	56	20	9.33	0.36
mse-miR-79	336	306	361	191	0.91	0.53	12	10	35	25	0.83	0.71
mse-miR-87	243	76	300	349	0.31	1.16		2	3	1
mse-miR-92a	30	30	63	77	1.00	1.22				3
mse-miR-92b	6	10	3	40	1.67	13.33				1
mse-miR-100	33	26	28	2	0.79	0.07
mse-miR-124		2
mse-miR-133		9		1
mse-miR-184	82770	22483	67853	105093	0.27	1.55		1
mse-miR-190	78	14	56	108	0.18	1.93		1	7	3
mse-miR-252	2715	482	433	513	0.18	1.18
mse-miR-263a	1377	137	280	180	0.10	0.64	3		2
mse-miR-263b							3
mse-miR-275	1515	524	684	853	0.35	1.25	3	2	1
mse-miR-276	2460	1898	2916	3564	0.77	1.22	330	167	547	345	0.51	0.63
mse-miR-277	219	429	181	417	1.96	2.30		3	9	1
mse-miR-278	27	26	30	30	0.96	1.00	6		2
mse-miR-279a	780	207	832	298	0.27	0.36	9	2	15	13	0.22	0.87
mse-miR-279b	1266	668	800	340	0.53	0.43			2	3
mse-miR-279c	210	130	100	67	0.62	0.67			2	3
mse-miR-279d	14214	3779	12756	3939	0.27	0.31		2	3	4
mse-miR-281	6	4	1	1			2595	950	262	299	0.37	1.14
mse-miR-282	318	42	45	24	0.13	0.53	3
mse-miR-283	66	110	26	112	1.67	4.31
mse-miR-306	9997	2065	3447	406	0.21	0.12
mse-miR-307	32115	10677	128054	22303	0.33	0.17		1	2
mse-miR-308	927	179	328	128	0.19	0.39		4	9	4
mse-miR-316	57	3	5	3	0.05	0.60			1
mse-miR-317	282	319	611	335	1.13	0.55		3	3	1
mse-miR-745	786	292	1791	627	0.37	0.35
mse-miR-750	15	3	6	1	0.20	0.17			2
mse-miR-929	3
mse-miR-932		3	6	7			3		1
mse-miR-965	105	25	66	6	0.24	0.09	228	43	135	172	0.19	1.27
mse-miR-970	16353	8984	58144	52406	0.55	0.90		1	3	6
mse-miR-989	30	3	17	7	0.10	0.41
mse-miR-998	30	25	111	165	0.83	1.49
mse-miR-2755	696	682	1325	848	0.98	0.64	36	22	35	29	0.61	0.83
mse-miR-2763	42	6	7	4	0.14	0.57
mse-miR-2766	10960	4959	17985	9178	0.45	0.51	399	131	381	127	0.33	0.33
mse-miR-2767	5387	3710	14360	7845	0.69	0.55
mse-miR-2768	9	4
mse-miR-2779	96	21	36	44	0.22	1.22
mse-miR-2796		1
mse-miR-3286		1
mse-miR-6100	426	46	247	169	0.11	0.68
mse-bantam	549	329	498	419	0.60	0.84		1		2
mse-miR-iab-4	30	47	6	6	1.57	1.00
mse-let-7a	10300	4919	19444	10340	0.48	0.53		3	1

^*Abundance is shown with normalized read numbers (reads per million) in the control (C) and induced (I) fat body (F) and hemocyte (H) libraries. Read numbers are shown as blank for those either non-detectable or whose values are below 0.5 after normalization. Up (I/C >1.25) and down (I/C <0.80) regulated ones are shaded orange and green, respectively.