Table 3.
Results of genotyping
| Strain | rfb O1 | rfb O139 | ctxA | toxR | ace | zot | tcpA class | tcpA El-Tor | rstR class | rstR El-Tor | rstR Calcutta | VSP-1 | VSP-2 | hlyA class | hlyA El-Tor | mshA | ompU | rtxA | rtxC | chxA | dth | TTSS vcsC2 | TTSS vcsN2 | TTSS vspD | TTSS vcsV2 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| VN-0168 | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | −a | − | + | + | − | + | − | + | − | + | − | − | − | − |
| VN-0169 | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | −a | − | + | + | − | + | − | + | − | + | − | − | − | − |
| VN-0210 | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | − | + | + | + | + | + | − | − | − | − |
| VN-0211 | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | +b | − | + | + | − | − | + | + | − | + | + | + | + | + |
| VN-0297 | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | − | + | − | + | − | + | − | − | − | − |
| VN-0298 | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | − | + | − | + | − | + | − | − | − | − |
| VN-0299 | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | − | − | − | + | − | + | + | + | + | + |
| VN-0300 | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | −a | − | + | + | − | + | − | + | + | + | + | + | + | + |
| VN-0301 | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | − | − | − | + | + | − | − | − | − | − |
| VN-0302 | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | − | − | − | + | − | + | + | + | + | + |
| VN-0303 | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | −c | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − |
| VN-0304 | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | +b | + | + | − | − | + | + | − | + | − | − | − | − |
| VN-0305 | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | − | + | − | + | − | + | − | − | − | − |
| VN-0307 | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | − | + | − | + | − | + | − | − | − | − |
| VN-0308 | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | − | − | + | + | − | + | + | + | + | + |
| VN-0313 | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | − | − | − | + | − | + | − | − | − | − |
| VN-0314 | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | − | − | − | + | − | + | − | − | − | − |
| VN-0315 | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | +b | + | + | − | + | + | + | − | + | + | + | + | + |
| NIH35A3 | + | − | + | + | + | + | + | + | + | − | − | − | − | + | − | + | + | − | − | − | + | − | − | − | − |
| NIH41 | + | − | + | + | + | + | + | + | + | − | − | − | − | + | − | + | + | − | − | − | + | − | − | − | − |
| 1576 | + | − | + | + | + | + | + | + | + | − | − | − | − | + | − | + | + | − | − | − | + | − | − | − | − |
| 1360 | + | − | + | + | + | + | + | + | + | − | − | − | − | + | − | + | + | − | − | − | + | − | − | − | − |
| MO45 | − | + | + | + | + | + | − | + | − | + | − | +b | +b | − | + | + | + | + | + | − | + | − | − | − | − |
Absence of VSP-1 and VSP-2 is demonstrated by generating PCR products of 1,700 bp and 800 bp, respectively, as primers bind to genomic sites flanking the islands
aPCR product of ca. 3 kbp
bNo visible PCR product
cOnly 481-bp PCR product visible