Table 3.
Study of pathogenicity islands, phylogenetic classification, and virulence genes in 20 ExPEC strains from human hemocultures.
| Strains | PC | Pathogenicity islands | Virulence genes | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| IV536 | ICFT073 | IICFT073 | IJ96 | kpsII | K1 | fyuA | papC | papG | sfaA | Ibe10 | hly | cnf1 | cnf2 | traT | iutA | iroN | ompT | hlyF | iss | ||
| 1 | B2 | + | + | + | − | + | − | − | + | + | + | − | + | − | − | − | + | + | − | − | − |
| 2 | B2 | + | + | + | − | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | − | − | − |
| 3 | B2 | + | + | − | − | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − |
| 4 | B2 | − | − | − | + | + | + | − | − | − | − | + | − | − | − | − | + | − | − | − | − |
| 5 | A | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | + | + | + | + |
| 6 | A | − | − | − | − | − | − | − | + | + | − | − | − | − | − | + | + | + | − | − | − |
| 7 | B2 | + | + | − | − | + | − | + | + | + | − | − | + | − | − | + | + | + | − | − | − |
| 8 | B2 | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| 9 | B2 | + | + | − | − | + | + | + | + | + | + | − | + | − | − | − | + | − | − | − | − |
| 10 | B1 | + | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | + | − | + | + | − | + | + | + | + |
| 11 | A | + | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | + | − | − | + | + | + | − | − | − |
| 12 | B1 | + | − | − | − | − | − | + | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| 13 | A | − | − | − | − | + | + | + | + | + | − | − | + | − | − | + | + | − | − | − | − |
| 14 | A | − | − | − | − | + | + | − | + | + | − | − | − | − | − | + | + | + | − | − | − |
| 15 | A | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − |
| 16 | B2 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − |
| 17 | D | + | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | + | + | − | − | − | − |
| 18 | B1 | + | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − |
| 19 | D | + | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | + | + | + | − | − | + |
| 20 | B1 | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | − | + |
PC: phylogenetic classification; pathogenicity islands: PAI IV536, PAI ICFT073, PAI IICFT073, and PAI IJ96; adhesions: papC, papG, sfaA, sfaS, and afa; invasion: ibe10; toxins: cnf2, cnf1, hlyA, hlyF, and cvaC; iron uptake systems: fyuA, iutA, and iroN; serum resistance: kps II, K1, traT, and iss; proteases: ompT.