Table 1. Sequences, biophysical and biochemical properties of modified aptamers.
| ID | Sequencea |
Tmb(UV), °C |
Tmb(CD), °C |
CD (positive bands), nm | Clotting timec, s |
|---|---|---|---|---|---|
| TBA | GGTTGGTGTGGTTGG | 51.0 | 51.3 | 245/295 | > 200 |
| A1 | GGTTGGTGTGGTTGG | < 30 | nd | nd | 13.9 |
| A2 | GGTTGGTGTGGTTGG | 51.9 | 52.3 | 245/295 | 14.0 |
| A3 | GGTTGGTGTGGTTGG | 60.3 | 60.8 | 245/295 | 14.4 |
| A4 | GGTTGGTGTGGTTGG | 40.7 | 39.7 | 245/295 | 15.1 |
| A5 | GGTTGGTGTGGTTGG | 49.6 | 48.9 | 245/295 | 14.4 |
| A6 | GGTTGGTGTGGTTGG | 41.7 | 42.5 | 245/295 | > 200 |
| A7 | GGTTGGTGTGGTTGG | 42.8 | 45.4 | 245/295 | 48 |
| A8 | GGTTGGTGTGGTTGG | nd | nd | nd | 14.6 |
| A9 | GGTTGGTGTGGTTGG | nd | nd | nd | 14.3 |
| A10 | GGTTGGTGTGGTTGG | nd | nd | nd | 14.3 |
| A11 | GGTTGGTGTGGTTGG | 54.0 | 55.9 | 245/295 | 14.0 |
| A12 | GGTTGGTGTGGTTGG | 38.9 | 39.8d | 265 | 14.8 |
| A13 | GGTTGGTGTGGTTGG | nd | nd | nd | 15.3 |
a
Alpha nucleotides are underlined. bAt 5 μM oligonucleotide concentration. cAt a final aptamer concenration of 1.5 μM. dAt 265 nm.