Skip to main content
. 2014 Apr 15;3:190. doi: 10.1186/2193-1801-3-190

Table 2.

Identity (above the diagonal) and divergence (under the diagonal) between GCRV isolates based on the vp4 , vp6 , vp7 gene [×1000]

Based on the vp4 gene Based on the vp7 gene
GCRV 155 ARV 096 097 873 108 988 794 H08 106 918 GCRV 155 AVR 096 873 875 876 991 108 H08 J01 J02
155 1000 599 317 603 299 293 292 286 293 296 155 1000 203 303 279 287 289 219 214 302 213
ARV 0 599 317 603 299 293 292 286 293 296 ARV 0 203 303 279 287 289 219 214 302 213
096 453 453 295 993 303 299 298 304 298 304 096 1178 1178 212 196 197 197 199 208 213 207
097 946 946 827 311 981 990 987 994 990 987 873 767 767 920 902 999 1000 199 197 994 205
873 445 445 5 827 298 297 296 299 296 302 875 856 856 910 100 901 902 222 208 899 206
108 967 967 886 20 872 970 970 963 971 968 876 776 776 855 1 102 999 204 200 993 197
988 971 971 891 10 882 31 997 986 998 986 991 782 782 848 0 100 1 204 200 995 195
794 977 977 896 13 888 31 3 985 998 985 108 1218 1218 920 885 891 865 870 986 203 987
H08 941 941 875 6 863 35 14 14 986 984 H08 1194 1194 904 863 880 843 848 14 202 998
106 973 973 893 10 884 30 2 2 13 987 J01 772 772 897 6 103 7 5 890 864 193
918 962 962 897 13 888 33 15 15 17 13 J02 1300 1300 913 858 876 839 844 14 2 859
Based on the vp6 gene
GCRV 155 ARV 096 104 873 875 876 991 108 988 H12 H11 794 H08 J12 N11 Q11 Q12 Y11 Z11 106 918
155 1000 548 230 548 547 547 548 196 233 241 235 233 204 235 235 235 235 235 233 233 232
ARV 0 548 230 548 547 547 548 196 233 241 235 233 204 235 235 235 235 235 233 233 232
096 500 500 220 994 998 998 997 201 242 235 235 241 202 233 233 239 233 233 243 241 241
104 936 936 769 238 246 246 246 190 232 229 232 232 198 238 238 228 238 232 232 232 223
873 503 503 6 751 999 999 998 204 243 235 235 242 205 232 232 239 232 232 243 242 242
875 516 516 3 751 1 1000 999 211 238 231 231 238 203 233 233 236 233 233 238 238 237
876 516 516 3 751 1 0 999 211 238 231 231 238 203 233 233 236 233 233 238 238 237
991 514 514 4 755 2 1 1 211 238 231 236 238 200 233 233 236 233 233 238 238 237
108 1427 1427 1340 1527 1261 1236 1236 1236 207 197 203 207 965 204 204 203 204 197 200 200 199
988 834 834 682 939 693 665 665 665 1157 975 972 998 208 971 971 990 971 973 998 998 995
H12 844 844 680 959 692 659 659 659 1214 26 991 975 210 990 990 979 990 992 975 976 973
H11 850 850 683 962 694 662 662 662 1211 29 9 973 205 998 998 981 998 999 973 974 971
794 838 838 685 931 697 670 670 670 1149 2 25 28 206 972 972 990 972 974 998 999 996
H08 1400 1400 1288 1510 1210 1196 1196 1196 32 1113 1165 1162 1106 204 204 200 204 205 206 206 204
J12 850 850 683 958 694 662 662 662 1228 29 10 2 29 1178 1000 980 1000 998 972 973 970
N11 850 850 683 958 694 662 662 662 1228 29 10 2 29 1178 0 980 1000 998 972 973 970
Q11 834 834 689 923 701 670 670 670 1142 10 22 19 10 1099 20 20 980 982 992 991 988
Q12 850 850 683 958 694 662 662 662 1228 29 10 2 29 1178 0 20 20 988 972 973 970
Y11 854 854 686 958 698 667 667 667 1219 28 8 1 27 1170 2 2 19 2 974 975 971
Z11 834 834 682 939 693 665 665 665 1142 2 25 28 2 1099 29 29 8 29 27 999 996
106 838 838 685 935 697 670 670 670 1149 2 24 27 1 1106 28 28 9 28 26 1 997
918 851 851 692 946 704 677 677 677 1154 5 28 30 4 1124 31 31 12 31 29 4 3