Table 2.
Gene list of the plastid genome in trebouxiophycean algal species
| |
ArM0029B |
NC64 |
C. vulgaris |
Coccomyxa |
Trebouxiophyceae sp. |
|---|---|---|---|---|---|
| MX-AZ01_NC_018569 | |||||
| accD |
o |
o |
o |
o |
o |
| atpA |
o |
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| atpB |
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| petB |
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| petD |
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| petG |
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| petL |
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| psaA |
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| psaB |
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| psaC |
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| psaI |
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| psaJ |
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| psbA |
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| psbB |
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o* |
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| psbC |
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| psbD |
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o |
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| psbE |
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| psbF |
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| psbH |
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| psbI |
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| psbJ |
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| psbK |
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| psbL |
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| psbM |
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| psbN |
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| psbT |
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| psbZ |
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| rbcL |
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| rpl12 |
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| rpl14 |
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| rpl16 |
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| rpl19 |
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| rpl2 |
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| rpl20 |
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| rpl23 |
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| rpl32 |
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| rpl36 |
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| rpl5 |
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| rpoA |
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| rpoB |
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| rpoC1 |
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| rpoC2 |
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| rps11 |
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| rps12 |
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| rps14 |
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| rps18 |
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| rps19 |
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| rps2 |
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| rps3 |
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| rps4 |
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| rps7 |
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| rps8 |
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| rps9 |
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| tilS |
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o+ |
| tufA |
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| ycf1 |
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| ycf12 |
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| ycf20 |
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| ycf3 |
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| ycf4 |
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| ycf47 |
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o |
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| minE |
- |
- |
o |
- |
- |
| trnA (UGC) |
o |
o |
o |
o |
o |
| TrnC (GCA) |
o |
o |
o |
o |
o |
| trnD (GUC) |
o |
o |
o |
o |
o |
| trnE (UUC) |
o |
o |
o |
o |
o |
| trnF (GAA) |
o |
o |
o |
o |
o |
| trnG (UCC) |
o |
o |
o |
o |
o |
| trnG (GCC) |
oo |
oo |
oo |
o |
o |
| trnH (GUG) |
o |
o |
o |
o |
o |
| trnI (GAU) |
o |
o |
o |
o |
o |
| trnI (CAU) |
o |
o |
o |
o |
o |
| trnK (UUU) |
o |
o |
o |
o |
o |
| trnL (CAA) |
o |
o |
o |
o |
o |
| trnL (GAG) |
o |
o |
o |
o |
o |
| trnL (UAA) |
o* |
o* |
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o |
o |
| trnL (UAG) |
o |
o |
o |
o |
o |
| trnM (CAU) |
oo |
oo |
oo |
oo |
oo |
| trnN (GUU) |
o |
o |
o |
o |
o |
| trnP (UGG) |
o |
o |
o |
o |
o |
| trnQ (UUG) |
o |
o |
o |
o |
o |
| trnR (ACG) |
o |
o |
o |
o |
o |
| trnR (UCU) |
o |
o |
o |
o |
o |
| trnR (CCG) |
o |
o |
o |
o |
o |
| trnR (CCU) |
- |
- |
- |
o |
o |
| trnS (GCU) |
o |
o |
o |
o |
o |
| trnS (GGA) |
o |
o |
o |
o |
o |
| trnS (UGA) |
o |
o |
o |
o |
o |
| trnT (UGU) |
o |
o |
o |
o |
o |
| trnT (GGU) |
o |
o |
o |
o |
o |
| trnV (UAC) |
o |
o |
oo |
o |
o |
| trnW (CCA) |
o |
o |
o |
o |
o |
| trnY (GUA) |
o |
o |
o |
o |
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o |
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o*** |
| rrnS |
o |
o |
o |
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o |
| rrn5 | o | o | o | o | o |
*gene containing one intron; **gene containing two introns; ***gene containing three introns; oo, 2 copies; +, fragmented gene.