Table 3.
Distribution of the mt protein-coding gene and trn gene among trebouxiophycean algae and chlorophycean algae
| |
Trebouxiophyceae |
Chlorophyceae |
|||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ArM0029B | Prototheca | Helicosporidium | Coccomyxa | MX-AZ01 | Scenedesmus | Dunaliella | Gonium | Chlamydomonas | |
| atp1 |
o |
o |
o |
o |
o |
- |
- |
- |
- |
| atp4 |
o |
- |
o |
o |
o |
- |
- |
- |
- |
| atp6 |
o |
o |
o |
o |
o |
o |
- |
- |
- |
| atp8 |
o |
o |
o |
o |
o |
- |
- |
- |
- |
| atp9 |
o |
o |
o |
o |
o |
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- |
- |
| cob |
o |
o |
o |
o |
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| cox1 |
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| cox2 |
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| cox3 |
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o |
o |
o |
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| nad1 |
o |
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o |
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| nad2 |
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o |
o |
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| nad3 |
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o |
o |
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| nad4 |
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o |
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o |
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| nad4L |
o |
o |
o |
o |
o |
o |
- |
- |
- |
| nad5 |
o |
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o |
o |
o |
o |
o |
o |
o |
| nad6 |
o |
o |
o |
o |
o |
o |
o |
o |
o |
| nad7 |
o |
o |
o |
o |
o |
- |
- |
- |
- |
| nad9 |
o |
o |
o |
o |
o |
- |
- |
- |
- |
| rpl5 |
o |
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o |
o |
o |
- |
- |
- |
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| rpl6 |
o |
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- |
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| rpl16 |
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o |
o |
o |
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| rps2 |
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o |
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| rps3 |
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o |
o |
o |
o |
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- |
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| rps4 |
o |
o |
o |
o |
o |
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| rps7 |
o |
o |
o |
o |
o |
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| rps10 |
o |
o |
o |
o |
o |
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- |
| rps11 |
o |
o |
o |
- |
- |
- |
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- |
| rps12 |
o |
o |
o |
o |
o |
- |
- |
- |
- |
| rps13 |
o |
o |
o |
o |
o |
- |
- |
- |
- |
| rps14 |
o |
o |
o |
o |
o |
- |
- |
- |
- |
| rps19 |
o |
o |
o |
o |
o |
- |
- |
- |
- |
| tatC |
o |
o |
o |
o |
o |
- |
- |
- |
- |
| size |
65,049 |
55,328 |
49,343 |
65,497 |
74,423 |
42,781 |
28,331 |
15,993 |
15,758 |
|
tRNAs |
Trebouxiophyceae |
Chlorophyceae |
|||||||
| |
ArM0029B |
Prototheca
|
Helicosporidium
|
Coccomyxa
|
MX-AZ01
|
Scenedesmus
|
Dunaliella
|
Gonium
|
Chlamydomonas
|
| trnA (UGC) |
o |
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o |
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| trnC (GCA) |
o |
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o |
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| trnD (GUC) |
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o |
o |
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| trnE (UUC) |
o |
o |
o |
o |
o |
o |
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| trnF (GAA) |
o |
o |
o |
o |
o |
o |
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| trnG (GCC) |
o |
o |
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o |
o |
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| trnG (UCC) |
o |
o |
o |
o |
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o |
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| trnH (GUG) |
o |
o |
o |
o* |
o* |
o |
_ |
_ |
_ |
| trnI (CAU) |
o |
o |
o |
o |
o |
_ |
_ |
_ |
_ |
| trnI (GAU) |
o |
o |
o |
o |
o |
o |
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_ |
_ |
| trnI (UAU) |
_ |
_ |
_ |
_ |
_ |
o |
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| trnK (UUU) |
o |
o |
o |
o |
o |
o |
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| trnL (AAG) |
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o |
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_ |
| trnL (CAA) |
o |
_ |
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o |
o |
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_ |
| trnL (CAG) |
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_ |
o |
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_ |
| trnL (UAA) |
o |
o |
o |
o |
o |
_ |
_ |
_ |
_ |
| trnL (UAG) |
o |
o |
o |
o |
o |
_ |
_ |
_ |
_ |
| trnM (CAU) |
oo |
oo |
oo |
oo |
o |
oo |
o |
oo |
o |
| trnN (GUU) |
o |
o |
o |
o |
o |
o |
_ |
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_ |
| trnP (UGG) |
o |
o |
o |
o |
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o |
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| trnQ (UUG) |
o |
o |
o |
o |
o |
o |
o |
o |
o |
| trnR (ACG) |
o |
o |
o |
o |
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o |
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| trnR (CCU) |
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| trnR (UCU) |
o |
o |
o |
o |
o |
o |
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| trnS (GCU) |
o |
o |
o |
o* |
o* |
o |
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| trnS (GGA) |
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| trnS (UGA) |
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o |
o |
o* |
o* |
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| trnT (UGU) |
o |
o |
o |
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| trnV (UAC) |
o |
o |
o |
o |
o |
o |
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| trnW (CCA) |
o |
o |
o |
o* |
o* |
o |
o |
o |
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| trnW (CUA) |
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| trnY (GUA) |
o |
o |
o |
o |
o |
o |
_ |
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_ |
| Total number | 27 | 26 | 25 | 26 | 23 | 27 | 3 | 4 | 3 |
*gene containing intron; oo, 2 copies.