Table 6.

Detection of the conserved region (pAQU backbone) and tra genes specific for pAQU1 and ICEVchMex in donors and transconjugants by PCR.

	Region number												Representative genes required for conjugative transfer
													pAQU1							ICEVchMex
Strain	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	rep	traA2	traB	traC	traF	traN	traL	int	traN	traF
04Ya001	+	+	+	+	+	+	+	+	+	−	+	+	+	+	+	+	+	+	+	−	−	ND
TJ001	+	+	+	+	+	+	+	+	+	−	+	+	+	+	+	+	+	+	+	−	−	ND
04Ya007	+	+	*	−	+	−	−	−	+	+	+	+	+	−	−	−	+	−	−	+	+	+
TJ007	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	+	+	+
04Ya016	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	−	−	ND
TJ016	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	−	−	ND
04Ya090	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	−	−	ND
TJ090	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	−	−	ND
04Ya108	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	ND
TJ108	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−
04Ya265	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	−	−	ND
TJ265	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	−	−	ND
04Ya311	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	−	−	−
TJ311	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	−	−	−
W3110	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−

^*Amplicon sizes were smaller than expected sizes.