Table 1.
Putative Linear Heparin-Binding Motifs in Candida albicans Surface Proteins
| Gene ID (Assembly 21) | Protein | Referencea | No. of Motifs | Motif 1 | Motif 2 | Motif 3 | Motif 4 | Motif 5 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| orf19.4257 | Int1 | C | 5 | 804QKKHQIHKb | 1383THKGRFc | 1530MKRGKPc | 1593FKKRFFKLb | 1612SHKTRAc |
| orf19.1738 | Ugp1 | B, D | 3 | 176SHRIRVc | 310IKKFKYc | 368IRHFKGc | … | … |
| orf19.3370 | Dot4 | B | 3 | 442NKKGKSc | 519CHKCHNc | 635FKRFKFc | … | … |
| orf19.3651 | Pgk1 | A, B, D | 3 | 136GKKVKAc | 146VKKFRQc | 168AHRAHSc | … | … |
| orf19.4660 | Rps6A | B, D | 2 | 185QRKRALKAb | 192AKKVKNc | … | … | … |
| orf19.5107 | Not5 | B | 2 | 114QKRSRFc | 333VKKLKPc | … | … | … |
| orf19.5130 | Pdi1 | D | 2 | 210NKKFKNc | 301GKKYRGc | … | … | … |
| orf19.6387 | Hsp104 | D | 2 | 53VKRARYc | 199ARRSKSc | … | … | … |
| orf19.1065 | Ssa2 | B, D | 1 | 258LRRLRTc | … | … | … | … |
| orf19.1067 | Gpm2 | B | 1 | 45IKKNHLc | … | … | … | … |
| orf19.1327 | Rbt1 | A, B, C | 1 | 121GKKVKQc | … | … | … | … |
| orf19.2762 | Ahp1 | B, D | 1 | 171LKRIHNc | … | … | … | … |
| orf19.2803 | Hem13 | B, D | 1 | 257IRRGRYc | … | … | … | … |
| orf19.3590 | Ipp1 | B, D | 1 | 74TKKGKLc | … | … | … | … |
| orf19.377 | Phr3 | B, C | 1 | 115PHHHLNRYb | … | … | … | … |
| orf19.395 | Eno1 | B, D | 1 | 141AKKGKFc | … | … | … | … |
| orf19.3966 | Crh12 | A, B, C | 1 | 420TKHIHNc | … | … | … | … |
| orf19.4035 | Pga4 | B, C, D | 1 | 259AKRPRPc | … | … | … | … |
| orf19.4152 | Cef3 | B | 1 | 623LRKYKGc | … | … | … | … |
| orf19.4304 | Gap1 | B | 1 | 72QRKLKTc | … | … | … | … |
| orf19.4980 | Ssa1 | B, D | 1 | 259LRRLRTc | … | … | … | … |
| orf19.5188 | Chs1 | B, C | 1 | 126PKRQKTc | … | … | … | … |
| orf19.5788 | Eft2 | B, D | 1 | 581NKHNRIc | … | … | … | … |
| orf19.6190 | Srb1 | B, D | 1 | 123FHKAHGc | … | … | … | … |
| orf19.6214 | Atc1 | A, B | 1 | 959PKRVKVc | … | … | … | … |
| orf19.6229 | Cat1 | B | 1 | 82GKKTRIc | … | … | … | … |
| orf19.6367 | Ssb1 | B, D | 1 | 263LRRLRTc | … | … | … | … |
| orf19.657 | Sam2 | B, D | 1 | 380PKKLKFc | … | … | … | … |
| orf19.6814 | Tdh3 | B, D | 1 | 70GHKIKVc | … | … | … | … |
| orf19.7021 | Gph1 | B, D | 1 | 656TKHHIPKAb | … | … | … | … |
| orf19.7400 | Als7 | B, C | 1 | 1482SKRNKNc | … | … | … | … |
| orf19.7585 | Ino1 | B, D | 1 | 151MKRAKVc | … | … | … | … |
| orf19.7676 | Xyl2 | A, B, D | 1 | 330THRFKFc | … | … | … | … |
| orf19.940 | Bud2 | B | 1 | 716LRKGKSc | … | … | … | … |
a Letter designations refer to descriptors found in the following sources: A, “cell wall” in the protein description obtained from the Candida Genome Database (as of January 2011); B, “cell wall” in the Gene Ontology annotation (as of January 2011) obtained from the Candida Genome Database; C, “cell wall proteins” in the review by Alberti-Segui et al [12]; and D, “cell wall proteins” in the review by Chaffin [11].
b Weintraub motif.
c Cardin motif.