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. 2014 May 20;14:131. doi: 10.1186/1471-2180-14-131

Table 3.

Resistance genotypes, PBP3 types and PBP3 substitutions

Resistance genotypes a PBP3 types b n c Sg d Bla e PBP3 substitutions f
D
 S
 A
 M
 S
 P
 A
 I
 G
 A
 V
 R
 N
 A
 T
 V
 D
 A
 N
350 357 368 377 385 392 437 449 490 502 511 517 526 530 532 547 551 554 569
High-rPBP3
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
 Group III
 -
 1
  
  
 N
 N
  
  
 T
  
  
  
  
 T
  
  
 Kg
  
  
 I
  
  
 S
 Group III-like
 -
 2
  
  
 N
 N
  
 I
 T
  
  
  
  
  
  
 H
  
  
 S
 I
  
  
  
Low-rPBP3
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
 Group II
 A
 48
  
 1
 N
  
  
 I
  
  
  
  
  
 V
  
  
 Kh
  
  
 I
  
  
 S
 
 B
 19
  
 5
  
  
  
  
  
  
  
 V
  
  
  
  
 Kg
  
  
 I
  
  
 S
 
 C
 5
  
  
 N
  
  
 I
  
  
  
  
 E
  
  
  
 Kh
  
  
 I
  
  
 S
 
 D
 17
  
  
 N
  
  
  
  
  
  
  
 E
  
  
  
 Kg
 S
  
  
  
  
  
 
 F
 1
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
 Kg
  
  
  
  
  
  
 
 H
 6
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
 V
  
  
 Kh
  
  
  
  
  
  
 
 I
 4
  
  
 N
  
  
  
  
  
 S
  
  
 V
  
  
 Kg
  
  
 I
  
  
 S
 
 J
 3
  
  
 N
  
  
  
  
  
  
  
  
 T
  
  
 Kg
  
  
 I
  
  
 S
 
 K
 2
  
  
  
  
 T
  
  
  
  
  
  
 T
  
  
 Kg
  
  
  
  
  
  
 
 L
 1
  
  
 N
  
  
  
  
  
  
  
 E
  
  
  
 Kg
  
  
 I
  
 Di
 S
 
 M
 1
  
  
 N
  
  
  
  
  
  
  
  
 V
  
  
 Kh
  
  
 I
  
  
 S
 
 N
 1
  
 1
 N
  
  
  
  
  
 S
 V
  
  
  
  
 Kg
  
  
 I
  
  
 S
 
 O
 1
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
 T
  
  
 Kg
  
  
 I
  
  
 S
 
 P
 1
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
 T
  
  
 Kg
  
  
 I
  
  
  
 
 Q
 1
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
 E
 V
  
  
 Kh
  
  
 I
  
  
 S
 Group I
 -
 2
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
 H
  
  
  
 I
  
 T
  
sPBP3 z0
 51
 15
 6
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
z4
 9
 1
  
 N
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
 I
  
  
 S
z1
 7
 3
 2
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
 I
  
  
  
z6
 3
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
 I
  
  
 S
z7
 3
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
 I
  
 T
 S
z5
 1
  
 1
  
  
  
  
  
  
  
  
  
 S
  
  
  
  
  
  
  
  
  
z8
 1
  
  
 N
  
  
  
  
  
  
  
  
 T
  
  
  
  
  
 I
  
  
 S
z9
 1
  
  
 N
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
 I
  
  
  
z10
 1
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
 I
 Ai
  
  
z11
 1
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
 A
  
  
  
  
 I
  
  
  
z12
 1
  
  
  
  
  
  
  
 Si
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
z13 1                       T                  

aSee Table 1.

bPBP3 types according to Skaare et al.[11] (types A – G) and this study (types H – Q and z0 – z13). ‘-‘, not designated.

cn, No. of study isolates.

dSg, No. of isolates from the Susceptible group included in n.

eBla, No. of beta-lactamase positive isolates (all TEM-1) included in n.

fAmino acid substitutions in PBP3 (transpeptidase domain, 338–573) with the amino acid sequence of H. influenzae Rd KW20 [GenBank:U32793] as reference (z0). Essential substitutions in bold.

gN526K encoded by the DNA triplet AAG.

hN526K encoded by the DNA triplet AAA.

iNovel substitution.