Table 7.

Empirical power when the multiple traits were correlated with an AR1 structure with correlation coefficient r; the non-zero β_j ~ U(0.2, 0.3). An independence working correlation structure was used in GEE.

									GEE
						MDMR					SPU(γ)
r	SNP	#traits	Average	MultiPhen	TATES	L 1	L 2	MANOVA	Score	UminP	γ = 1	2	3	4	5	6	∞	aSPU
0.5	1	5	0.661	0.458	0.554	0.629	0.634	0.459	0.458	0.522	0.651	0.630	0.624	0.594	0.582	0.564	0.525	0.624
		10	0.390	0.371	0.426	0.496	0.527	0.373	0.388	0.447	0.388	0.555	0.534	0.533	0.513	0.513	0.471	0.516
		20	0.217	0.262	0.332	0.362	0.365	0.263	0.286	0.334	0.214	0.414	0.390	0.427	0.397	0.402	0.343	0.400
0.5	2	5	0.223	0.113	0.165	0.202	0.201	0.113	0.113	0.153	0.220	0.206	0.193	0.182	0.178	0.173	0.162	0.208
		10	0.124	0.107	0.122	0.131	0.129	0.107	0.100	0.112	0.124	0.150	0.137	0.139	0.127	0.129	0.114	0.139
		20	0.084	0.080	0.105	0.121	0.118	0.081	0.069	0.104	0.090	0.113	0.106	0.122	0.109	0.116	0.103	0.111
0.3	1	5	0.780	0.547	0.571	0.698	0.706	0.571	0.546	0.551	0.774	0.706	0.709	0.647	0.637	0.602	0.551	0.737
		10	0.487	0.442	0.469	0.568	0.596	0.444	0.442	0.443	0.482	0.592	0.569	0.546	0.530	0.511	0.454	0.572
		20	0.274	0.309	0.366	0.448	0.490	0.312	0.307	0.349	0.277	0.478	0.456	0.467	0.438	0.434	0.368	0.459
0.3	2	5	0.245	0.129	0.154	0.177	0.179	0.129	0.127	0.146	0.244	0.180	0.185	0.165	0.164	0.153	0.149	0.190
		10	0.147	0.120	0.129	0.157	0.156	0.121	0.119	0.122	0.146	0.161	0.146	0.143	0.139	0.136	0.122	0.156
		20	0.077	0.085	0.093	0.121	0.126	0.087	0.085	0.087	0.078	0.131	0.113	0.115	0.098	0.103	0.091	0.113