. 2014 Jun 4;5:167. doi: 10.3389/fgene.2014.00167

Table 4.

Comparison of minor allele frequencies for selected genetic variants in the 3′-UTR of pharmacogenomically-relevant genes among different world populations.

dbSNP rs^#	N	rs11636419	rs45564134	rs17861162	rs1038376	rs1042389	rs707265	rs3181842	rs7246465	rs28969420	rs10511395	rs1054190	rs1054191	rs3732359	rs3732360	rs3814057	rs3814058	rs6600893	rs6851533
Allele		G	–	G	T	C	A	C	T	T	A	T	A	A	T	C	C	C	C
South African	30	0.24	0.12	0.15	0.34	0.15	0.23	0.25	0.29	0.20	0.14	0.18	0.26	0.56	0.52	0.25	0.27	0.28	0.36
AFR	691	0.14	0.16	0.16	0.31	0.28	0.18	0.24	0.21	0.23	0.16	0.04^*	0.16	0.34^*	0.33^*	0.47^*	0.47^*	0.19	0.19^*
ASW	66	0.17	0.15	0.19	0.31	0.2	0.21	0.28	0.26	0.15	0.17	0.07	0.17	0.44	0.43	0.42	0.42	0.24	0.24
LWK	116	0.13	0.16	0.16	0.3	0.36^*	0.16	0.24	0.18	0.30	0.22	0.05^*	0.21	0.37	0.35	0.47^*	0.47^*	0.17	0.17^*
YRI	116	0.14	0.16	0.16	0.33	0.24	0.18	0.24	0.21	0.21	0.1	0.02^*	0.10^*	0.24^*	0.24^*	0.51^*	0.51^*	0.15	0.15^*
MKK^#	180	N/A	N/A	N/A	N/A	0.24	0.21	0.02^*	N/A	N/A	0.1	0.05^*	0.09^*	0.45	0.45	0.38	N/A	0.29	0.29
AMR	355	0.08^*	0.01^*	0.08	0.43	0.16	0.22	0.22	0.23	0.07^*	0.15	0.11	0.15	0.76^*	0.73^*	0.2	0.2	0.35	0.35
CLM	95	0.10	0.01^*	0.10	0.48	0.14	0.18	0.18	0.20	0.11	0.18	0.13	0.18	0.76^*	0.73^*	0.18	0.18	0.43	0.43
MXL	69	0.09^*	0^*	0.09	0.39	0.15	0.23	0.23	0.23	0.04^*	0.13	0.08	0.13	0.78^*	0.74^*	0.2	0.2	0.27	0.27
PUR	105	0.04^*	0.01^*	0.04^*	0.42	0.19	0.25	0.25	0.25	0.07^*	0.15	0.1	0.14	0.75^*	0.72^*	0.21	0.21	0.36	0.37
GIH^#	100	N/A	N/A	N/A	N/A	0.22	0.19	0^*	N/A	N/A	0.1	0.06	0.07^*	0.45	0.45	0.28	N/A	0.48^*	0.48
ASN	523	0.22	0^*	0.22	0.14^*	0.28	0.35	0.35	0.33	0.03^*	0^*	0^*	0^*	0.47	0.46	0.48^*	0.48^*	0.28	0.28
CHB	106	0.27	0.01^*	0.27	0.12^*	0.31	0.34	0.33	0.32	0.04^*	0^*	0^*	0^*	0.49	0.49	0.46	0.46	0.31	0.31
CHS	112	0.22	0^*	0.22	0.16^*	0.26	0.37	0.37	0.33	0.02^*	0.01^*	0^*	0.01^*	0.39	0.38	0.55^*	0.55^*	0.25	0.25
JPT	105	0.17	0.01^*	0.17	0.14^*	0.28	0.34	0.37	0.36	0.02^*	0^*	0^*	0^*	0.52	0.52	0.44	0.44	0.29	0.29
CHD^#	100	N/A	N/A	N/A	N/A	0.32	0.36	0^*	N/A	N/A	0.01^*	0^*	0^*	0.44	0.44	0.48^*	N/A	0.32	0.32
EUR	514	0.08^*	0^*	0.07	0.26	0.21	0.39	0.40	0.38	0.06^*	0.16	0.13	0.16	0.79^*	0.76^*	0.17	0.17	0.49^*	0.49
CEU	103	0.04^*	0^*	0.04^*	0.31	0.19	0.39	0.42	0.38	0.04^*	0.18	0.15	0.16	0.84^*	0.81^*	0.12^*	0.12^*	0.48^*	0.48
FIN	100	0.11	0^*	0.10	0.17	0.19	0.43	0.43	0.43	0.06^*	0.06	0.05^*	0.06^*	0.72	0.7	0.21	0.21	0.45	0.45
GBR	94	0.06^*	0^*	0.06	0.25	0.26	0.39	0.41	0.39	0.05^*	0.19	0.16	0.19	0.78^*	0.75^*	0.17	0.17	0.48^*	0.48
IBS	107	0.04^*	0^*	0.04^*	0.25	0.36^*	0.29	0.29	0.29	0.07^*	0.11	0.07	0.11^*	0.86^*	0.82^*	0.14	0.14	0.46	0.46
TSI	110	0.09^*	0^*	0.09	0.32	0.18	0.36	0.36	0.36	0.08	0.21	0.18	0.21	0.8^*	0.76^*	0.18	0.18	0.48^*	0.48

Indicate significant differences in allele frequency compared to the South Africans,

Allele frequencies were obtained from the HapMap project, while allele frequencies for other populations were obtained from the 1000 genomes project, AFR, African; ASW, Americans of African ancestry in SW USA; LWK, Luhya in Webuye (Kenya); YRI, Yoruba in Ibadan (Nigeria); MKK, Maasai in Kinyawa (Kenya); AMR, Ad mixed American; CLM, Colombians from Medellin (Colombia); MXL, Mexican ancestry from Los Angeles USA; PUR, Puerto Ricans from Puerto Rico; GIH, Gujarati Indian from Houston Texas; ASN, East Asian; CHB, Han Chinese in Bejing (China); CHS, Southern Han Chinese; JPT, Japanese in Tokyo (Japan); CHD, Chinese in Metropolitan Denver (Colorado); EUR, European; CEU, Utah residents with Northern and Western European ancestry; FIN, Finnish in Finland; GBR, British in England and Scotland; IBS, Iberian population in Spain; TSI, Toscani in Italy; N/A, not available.