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. 2014 May 29;14:294. doi: 10.1186/1471-2334-14-294

Table 4.

Previously reported superantigen genotypes

Genotype speA speC speG speH speI speJ speK speL speM ssa smeZ Othername Countries emm Year
A (n = 1)
X
 
X
 
X
 
 
 
X
 
X
None
 
 
 
B (n = 17)
X
 
X
 
 
 
 
 
 
 
X
R
Australia
1
2001-2002 [6]
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
A
Sweden
1
1989 [15]
C (n = 1)
X
 
X
 
 
X
 
 
 
X
X
F
Australia
1
2001-2001 [6]
D (n = 7)
X
 
X
 
 
X
 
 
 
 
X
D
Australia
1
2001-2002 [6]
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
C
Sweden
1
1988-2001 [15]
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
Not Given
Norway
1
2006-2007 [16]
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
Not Given
New Zealand
1
Not given [17]
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
Not Given
Spain
1
1999-2003 [18]
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
I
Norway
1
1988-2003 [19]
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
Not Given
Sweden
1
2006-2007 [20]
E (n = 3)
X
 
X
 
X
 
 
 
 
 
X
None
 
 
 
F (n = 1)
X
 
X
 
X
X
 
 
 
 
X
None
 
 
 
G (n = 1)
 
 
X
X
X
 
 
 
X
 
X
None
 
 
 
H (n = 2)
 
X
X
X
X
 
 
 
 
X
X
D
China
1
2005-2006 [21]
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
D
China
12
1993-1994, 2005-2006 [21]
J (n = 19)
 
X
X
X
X
 
 
 
 
 
X
H
Australia
12
2001-2002 [6]
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
S3
Sweden
12
1989-1993 [15]
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
Not Given
Norway
12
2006-2007 [16]
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
Not Given
Spain
12
1999-2003 [18]
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
VII
Norway
12
1988-2003 [19]
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
S26
Sweden
66
1989 [15]
K (n = 3)
 
X
X
 
 
 
 
 
 
 
X
None
 
 
 
M (n = 2)
 
X
X
X
X
 
 
 
X
 
X
None
 
 
 
N (n = 8)
 
 
X
X
X
 
 
 
 
 
X
J
Australia
12
2001-2002 [6]
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
Not Given
Norway
12
2006-2007 [16]
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
Not Given
Spain
12
1999-2003 [18]
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
AC
Sweden
66
1988-1990 [15]
O (n = 1)
X
X
X
X
X
 
 
 
 
 
X
None
 
 
 
P (n = 1)
 
 
X
 
 
 
 
 
 
 
X
None
 
 
 
Q (n = 4)
 
X
X
 
X
 
 
 
 
 
X
None
 
 
 
R (n = 1)
 
X
X
X
X
X
 
 
 
 
X
Not Given
ATCC
1
Not given [17]
S (n = 1)
 
X
X
 
X
 
 
 
 
X
X
None
 
 
 
T (n = 1)
 
 
X
X
X
X
 
 
 
 
 
Not Given
New Zealand
12
Not given [17]
U (n = 2)
 
 
X
X
X
 
 
 
 
X
X
T
Australia
12
2001-2002 [6]
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
Not Given
Spain
12
1999-2003 [18]
V (n = 1) X   X X X           X None      

Previously published emm 1, 12 and 66 superantigen genotypes were reviewed and compared to our collection. “Genotype” refers to designations given in this paper. “Other name” refers to pattern name given in previously published work. Citations refer to the reference section.