Skip to main content
. Author manuscript; available in PMC: 2014 Jun 9.
Published in final edited form as: Behav Neurosci. 2013 Apr 1;127(3):387–399. doi: 10.1037/a0032026

Table 2.

List of candidate polymorphisms and minor allele frequency. EA, European; AA, African; Other, Asian, Hispanic

Minor allele Frequency

System Gene CHR SNP/mutation Minor Major n TOTAL EA AA other
Dopamine SPR 2 rs2421095 G A 245 0.153 0.128 0.405 0.143
2 rs1876487 A C 244 0.393 0.361 0.786 0.310
DRD3 3 rs6280 A G 245 0.398 0.377 0.568 0.429
DRD1 5 rs4532 A G 245 0.358 0.406 0.091 0.167
DDC 7 rs2060762 A G 243 0.156 0.152 0.143 0.214
7 rs11575543* A G 245 0.043 0.032 0.167 0.023
7 rs11575542* A G 245 0.041 0.030 0.167 0.024
7 rs11575522* A G 244 0.037 0.027 0.143 0.024
7 rs11238131 A G 245 0.318 0.300 0.405 0.405
TH 11 rs71029110 9.3R or 10R Non 9.3R or 10R 245 0.307 0.337 0.205 0.119
DAT1 5 rs28363170 Non 10R 10R 245 0.232 0.232 0.250 0.214
DRD5 4 - 9R Non 9R 226 0.398 0.431 0.237 0.237
DBH 9 rs77905 A G 245 0.473 0.510 0.310 0.286
9 rs6271 A G 245 0.073 0.079 0.024 0.071
9 rs1611115 A G 245 0.229 0.234 0.214 0.190
9 rs1108580 A G 244 0.439 0.438 0.350 0.524
COMT 22 rs4580 A G 245 0.573 0.532 0.818 0.714
DRD4 11 rs4646984 7R Non 7R 243 0.200 0.205 0.227 0.119
DRD2 11 rs1800497 A2 A1 245 0.203 0.187 0.318 0.238
Dopamine/Serotonin MAOA 23 MAOA-LPR 3.5R or 4R Non 3.5R or 4R 245 0.386 0.352 0.500 0.595
Serotonin HTR1A 5 rs6295 C G 245 0.488 0.483 0.405 0.619
5 rs1800044* A C 245 0.006 0.007 0.000 0.000
5 rs1799920* - G 243 0.000 0.000 0.000 0.000
5 rs10042486 G A 245 0.471 0.502 0.357 0.286
HTR1B 6 rs6296 G C 245 0.251 0.236 0.262 0.381
6 rs13212041 G A 245 0.288 0.264 0.548 0.262
6 rs130058 A T 245 0.263 0.288 0.095 0.190
TPH2 12 rs7963720 G A 244 0.457 0.428 0.619 0.571
12 rs7305115 A G 245 0.414 0.414 0.357 0.476
12 rs4290270 T A 245 0.394 0.360 0.571 0.548
12 rs17110690 A G 244 0.172 0.191 0.048 0.119
12 rs1487275 C A 245 0.284 0.266 0.262 0.476
12 rs17110747 A G 245 0.110 0.114 0.000 0.182
HTR2A 13 rs927544 G A 245 0.261 0.273 0.167 0.238
13 rs7997012 A G 245 0.343 0.372 0.095 0.310
13 rs6314 A G 243 0.088 0.097 0.071 0.024
13 rs6313 A G 245 0.427 0.431 0.310 0.500
13 rs6311 A G 237 0.439 0.446 0.310 0.500
13 rs2770296 G A 244 0.283 0.295 0.238 0.214
13 rs1923886 G A 245 0.365 0.394 0.095 0.357
SERT 17 rs2066713 A G 244 0.338 0.354 0.238 0.286
17 rs2020933* A T 245 0.010 0.007 0.048 0.000
17 rs16965628 C G 245 0.108 0.103 0.262 0.000
17 rs1042173 C A 245 0.420 0.441 0.190 0.452
Opioid OPRD 1 rs569356 G A 244 0.117 0.134 0.024 0.048
1 rs2236861 A G 244 0.182 0.204 0.000 0.143
1 rs204076 T A 244 0.305 0.332 0.190 0.167
6 rs7773995 A G 245 0.153 0.158 0.167 0.095
6 rs514980 G A 245 0.204 0.214 0.119 0.190
6 rs2281617* A G 245 0.014 0.012 0.000 0.048
6 rs1799971 G A 245 0.118 0.131 0.000 0.119
6 rs12205732 A G 245 0.061 0.052 0.119 0.095
6 rs10485057 G A 241 0.110 0.109 0.143 0.079
6 rs17174801* G A 239 0.004 0.000 0.053 0.000
*

Excluded based on MAF<0.05