Table 2.

Association P-values of FTO SNPs with adiposity and glucose homeostasis phenotypes in the IRAS (a) non-Hispanic White Americans, (b) Hispanic Americans and (c) African Americans under the additive model

SNP	Allelesa	MAF	Adjusted for age and gender BMI	Adjusted for age, gender and BMI
				WAIST	WHR	GFAST	SG	FINS	SI	AIR	DI
(a)
rs7186637	C/T	0.19	0.41	0.66	0.85	0.97	0.83	0.16	0.29	0.42	0.78
rs11643744	A/G	0.34	0.026	0.24	0.44	0.32	0.65	0.51	0.70	0.80	0.64
rs9940700	G/C	0.19	0.28	0.69	0.86	0.80	0.73	0.19	0.45	0.47	0.66
rs13334933	A/G	0.18	0.098	0.98	0.73	0.45	0.90	0.20	0.33	0.37	0.56
rs16952517	G/A	0.10	0.16	0.10	0.27	0.38	0.01	0.89	0.22	0.34	0.055
rs6499642	C/T	0.04	0.67	0.17	0.67	0.18	0.20	0.50	0.48	0.65	0.80
rs4784323	G/A	0.35	0.91	0.23	0.24	0.81	0.39	0.44	0.39	0.26	0.82
rs8047395	G/A	0.498	0.051	0.33	0.27	0.054	0.95	0.69	0.96	0.048	0.23
rs1421085b	T/C	0.42	0.015	0.15	0.25	0.0999	0.38	0.70	0.64	0.018	0.071
rs10852521	C/T	0.496	0.048	0.44	0.56	0.026	0.92	0.63	0.79	0.012	0.0998
rs12447107	G/C	0.02	0.38	0.13	0.50	0.87	0.025	0.81	0.10	0.42	0.46
rs11075986	C/G	0.07	0.76	0.75	0.41	0.26	0.82	0.88	0.57	0.92	0.76
rs2058908	C/T	0.29	0.21	0.098	0.093	0.79	0.84	0.94	1.00	0.77	0.99
rs1121980b	G/A	0.44	0.035	0.29	0.36	0.10	0.78	0.74	0.97	0.012	0.11
rs8057044	G/A	0.49	0.044	0.44	0.75	0.071	0.79	0.37	0.71	0.058	0.14
rs17817449b	T/G	0.42	0.027	0.19	0.45	0.16	0.43	0.68	0.53	0.043	0.061
rs8063946	C/T	0.05	0.26	0.64	0.44	0.58	0.72	0.14	0.092	0.064	0.86
rs8050136b	C/A	0.42	0.028	0.19	0.44	0.17	0.44	0.67	0.53	0.047	0.065
rs3751812b	G/T	0.41	0.021	0.17	0.40	0.16	0.47	0.71	0.58	0.046	0.074
rs9939609b	T/A	0.42	0.021	0.18	0.47	0.18	0.52	0.75	0.53	0.043	0.057
rs7199182	A/G	0.003	0.50	0.83	0.73	0.67	0.64	0.96	0.54	0.82	0.49
rs13337696	C/T	0.02	0.32	0.069	0.21	0.70	0.28	0.82	0.18	0.30	0.72
rs7204609	T/C	0.02	0.25	0.79	0.23	0.69	0.22	0.18	0.49	0.26	0.14
rs8044769	C/T	0.47	0.074	0.29	0.71	0.16	0.84	0.85	0.68	0.045	0.30
(b)
rs7186637	C/T	0.161	0.023	0.50	0.86	0.55	0.93	0.66	0.81	0.74	0.82
rs16952508	A/G	0.001	0.53	0.31	0.28	0.17	0.51	0.65	0.87	0.14	0.19
rs1108102	T/A	0.003	0.29	0.40	0.083	0.25	0.82	0.34	0.53	0.36	0.20
rs11643744	A/G	0.408	0.73	0.89	0.85	0.85	0.49	0.94	0.68	0.62	0.33
rs9940700	G/C	0.164	0.063	0.59	0.71	0.43	0.66	0.78	0.74	0.90	0.88
rs13334933	A/G	0.162	0.027	0.43	0.89	0.48	0.95	0.73	0.88	0.95	0.92
rs16952517	G/A	0.104	0.70	0.34	0.44	0.58	0.094	0.51	0.41	0.90	0.20
rs6499642	C/T	0.028	0.62	0.62	0.19	0.54	0.22	0.56	0.15	0.70	0.26
rs4784323	G/A	0.322	0.056	0.44	0.055	0.49	0.34	0.98	0.25	0.49	0.31
rs8047395	G/A	0.427	4.7 × 10−4	0.42	0.27	0.60	0.028	0.59	0.37	0.020	0.027
rs1421085b	T/C	0.237	1.5 × 10−4	0.13	0.011	0.77	0.085	0.71	0.50	0.80	0.59
rs10852521	T/C	0.404	5.2 × 10−4	0.61	0.25	0.91	0.21	0.85	0.72	0.075	0.18
rs12447107	G/C	0.053	0.33	0.66	0.98	0.85	0.38	0.096	0.26	0.15	0.92
rs11075986	C/G	0.113	0.27	0.33	0.12	0.93	0.85	0.62	0.71	0.22	0.26
rs2058908	C/T	0.339	0.059	0.54	0.14	0.48	0.25	0.70	0.24	0.47	0.17
rs1121980b	G/A	0.303	3.6 × 10−3	0.13	0.012	0.65	0.074	0.90	0.64	0.20	0.24
rs8057044	G/A	0.352	5.0 × 10−5	0.60	0.32	0.49	0.019	0.58	0.54	0.017	0.065
rs17817449b	T/G	0.255	6.0 × 10−5	0.11	0.031	0.58	0.031	0.57	0.37	0.51	0.27
rs8063946	C/T	0.125	0.76	0.65	0.58	0.65	0.37	0.56	0.97	0.39	0.49
rs8050136b	C/A	0.255	6.9 × 10−5	0.10	0.026	0.50	0.022	0.56	0.37	0.43	0.23
rs3751812b	G/T	0.234	7.1 × 10−6	0.32	0.057	0.81	0.077	0.74	0.74	0.69	0.70
rs9939609b	T/A	0.257	1.8 × 10−5	0.19	0.052	0.55	0.022	0.63	0.54	0.45	0.34
rs7199182	A/G	0.031	0.74	0.30	0.69	0.14	0.23	0.45	0.34	0.53	0.13
rs13337696	C/T	0.043	0.87	0.31	0.86	0.46	0.31	0.28	0.27	0.31	0.86
rs7204609	T/C	0.093	0.67	0.38	0.87	0.94	0.60	0.85	0.84	0.98	0.49
rs8044769	T/C	0.431	2.5 × 10−4	0.80	0.40	0.77	0.07	0.74	0.89	0.033	0.15
(c)
rs7186637	C/T	0.405	0.12	0.74	0.53	0.52	0.33	0.45	0.19	0.27	0.050
rs16952508	A/G	0.042	0.013	0.64	0.62	0.91	0.12	0.75	0.61	0.51	0.70
rs1108102	T/A	0.125	5.4 × 10−4	0.76	0.46	0.32	0.028	0.65	0.27	0.045	0.048
rs11643744	A/G	0.119	0.37	0.33	0.18	0.21	0.94	4.6 × 10−3	0.21	0.92	0.20
rs9940700	C/G	0.401	0.32	0.94	0.51	0.083	0.99	0.21	0.46	0.70	0.25
rs13334933	G/A	0.397	0.59	0.77	0.71	0.11	0.93	0.20	0.56	0.80	0.33
rs16952517	G/A	0.194	0.84	0.18	0.41	0.96	0.43	0.27	0.61	0.39	0.63
rs6499642	C/T	0.285	0.18	0.96	0.83	0.16	0.92	0.54	0.98	0.57	0.81
rs4784323	G/A	0.13	0.46	0.62	0.98	0.54	0.13	0.39	0.64	0.32	0.28
rs8047395	A/G	0.34	0.011	0.58	0.56	0.87	0.81	0.25	0.43	0.71	0.39
rs1421085b	T/C	0.08	0.24	0.34	0.46	0.39	0.028	0.91	0.61	0.24	0.64
rs10852521	C/T	0.316	4.4 × 10−3	0.65	0.32	0.36	0.90	0.51	0.44	0.73	0.16
rs12447107	G/C	0.27	0.54	0.61	0.27	0.90	0.73	0.33	0.65	0.59	0.64
rs11075986	C/G	0.279	0.11	0.33	0.37	0.61	0.90	0.88	0.36	0.21	0.19
rs2058908	C/T	0.065	0.15	0.10	0.36	0.94	0.32	0.19	0.60	7.0 × 10−3	0.21
rs16952524	C/A	0.051	0.41	0.74	0.29	0.034	0.64	0.71	0.86	0.042	0.30
rs1121980b	G/A	0.424	0.43	0.38	0.42	0.45	0.47	0.37	0.90	0.042	0.50
rs8057044	A/G	0.314	0.039	0.48	0.45	0.49	0.87	0.57	0.54	0.97	0.35
rs17817449b	T/G	0.33	0.55	0.090	0.094	0.15	0.37	0.74	0.90	0.12	0.70
rs8063946	C/T	0.349	0.45	0.44	0.83	0.12	0.48	0.58	0.76	0.074	0.20
rs8050136b	C/A	0.391	0.20	0.18	0.32	0.12	0.24	0.78	0.45	0.072	0.93
rs3751812b	G/T	0.083	0.22	0.33	0.42	0.29	0.084	0.94	0.64	0.29	0.64
rs9939609b	T/A	0.418	0.71	0.25	0.48	0.18	0.056	0.41	0.40	0.033	0.97
rs7199182	A/G	0.26	0.85	0.25	0.30	0.33	0.71	0.80	0.33	0.28	0.73
rs13337696	C/T	0.054	0.43	0.37	0.67	0.74	0.44	0.40	0.25	0.45	0.14
rs7204609	T/C	0.344	0.89	0.57	0.53	0.34	0.85	0.17	0.44	0.58	0.80
rs8044769	C/T	0.27	2.4 × 10−3	0.71	0.50	0.66	0.78	0.54	0.98	0.80	0.73

Abbreviations: AIR, acute insulin response; BMI, body mass index; DI, disposition index; FINS, fasting insulin; GFAST, fasting glucose; IRAS, Insulin Resistance Atherosclerosis Study; MAF, minor allele frequency; S_G glucose effectiveness; S_I, insulin sensitivity; SNP, single-nucleotide polymorphism; WAIST, waist circumference; WHR, waist-to-hip ratio.

^aMajor/minor allele.

^bSNPs prominent in the literature. Numbers in bold indicate P-value ≤0.05 and numbers in italics indicate P-value ≤0.1.