Skip to main content
. 2014 Jun 27;9(6):e99755. doi: 10.1371/journal.pone.0099755

Table 7. Values for the sensitivity (sens.) and the false positive rate (fpr), for the functional annotation for each graph representation using edgeCluster, at different threshold values (ω).

Threshold/Representation ω = 0 ω = 0.1 ω = 0.2 ω = 0.3 ω = 0.4 ω = 0.5 ω = 0.6 ω = 0.7 ω = 0.8 ω = 0.9
Simple sens. 0,8184 0,7163 0,6021 0,5154 0,434 0,3604 0,3028 0,2513 0,1854 0,1374
fpr 0,1403 0,0503 0,0228 0,0137 0,0085 0,0053 0,0036 0,0025 0,0016 0,0011
Weighted Content sens. 0,8992 0,7654 0,6212 0,5328 0,4282 0,3312 0,2636 0,1713 0,1134 0,0737
fpr 0,274 0,1147 0,0513 0,0238 0,0139 0,0077 0,0043 0,0025 0,0012 0,0007
Weighted Structure sens. 0,9171 0,8142 0,6762 0,5888 0,4674 0,3845 0,3018 0,2153 0,1437 0,0997
fpr 0,2613 0,1429 0,0634 0,0219 0,0142 0,007 0,004 0,0022 0,0011 0,0007
Weighted Hybrid sens. 0,9232 0,8152 0,6834 0,5933 0,4779 0,3931 0,3077 0,2246 0,1525 0,1099
fpr 0,2537 0,1242 0,0553 0,0172 0,0102 0,0069 0,0038 0,0021 0,001 0,0007
Protein-Term sens. 0,9997 0,8233 0,6203 0,4623 0,3272 0,2918 0,2191 0,1744 0,1491 0,0118
fpr 0,4104 0,0732 0,0242 0,0128 0,0072 0,0056 0,0045 0,0028 0,0014 0,0009
FFC sens. 0,9823 0,7644 0,5430 0,3648 0,29 0,2483 0,2045 0,1521 0,1194 0,0710
fpr 0,5042 0,0902 0,0319 0,0138 0,0071 0,0049 0,0037 0,0018 0,001 0,0009