Table 7. Values for the sensitivity (sens.) and the false positive rate (fpr), for the functional annotation for each graph representation using edgeCluster, at different threshold values (ω).
Threshold/Representation | ω = 0 | ω = 0.1 | ω = 0.2 | ω = 0.3 | ω = 0.4 | ω = 0.5 | ω = 0.6 | ω = 0.7 | ω = 0.8 | ω = 0.9 | |
Simple | sens. | 0,8184 | 0,7163 | 0,6021 | 0,5154 | 0,434 | 0,3604 | 0,3028 | 0,2513 | 0,1854 | 0,1374 |
fpr | 0,1403 | 0,0503 | 0,0228 | 0,0137 | 0,0085 | 0,0053 | 0,0036 | 0,0025 | 0,0016 | 0,0011 | |
Weighted Content | sens. | 0,8992 | 0,7654 | 0,6212 | 0,5328 | 0,4282 | 0,3312 | 0,2636 | 0,1713 | 0,1134 | 0,0737 |
fpr | 0,274 | 0,1147 | 0,0513 | 0,0238 | 0,0139 | 0,0077 | 0,0043 | 0,0025 | 0,0012 | 0,0007 | |
Weighted Structure | sens. | 0,9171 | 0,8142 | 0,6762 | 0,5888 | 0,4674 | 0,3845 | 0,3018 | 0,2153 | 0,1437 | 0,0997 |
fpr | 0,2613 | 0,1429 | 0,0634 | 0,0219 | 0,0142 | 0,007 | 0,004 | 0,0022 | 0,0011 | 0,0007 | |
Weighted Hybrid | sens. | 0,9232 | 0,8152 | 0,6834 | 0,5933 | 0,4779 | 0,3931 | 0,3077 | 0,2246 | 0,1525 | 0,1099 |
fpr | 0,2537 | 0,1242 | 0,0553 | 0,0172 | 0,0102 | 0,0069 | 0,0038 | 0,0021 | 0,001 | 0,0007 | |
Protein-Term | sens. | 0,9997 | 0,8233 | 0,6203 | 0,4623 | 0,3272 | 0,2918 | 0,2191 | 0,1744 | 0,1491 | 0,0118 |
fpr | 0,4104 | 0,0732 | 0,0242 | 0,0128 | 0,0072 | 0,0056 | 0,0045 | 0,0028 | 0,0014 | 0,0009 | |
FFC | sens. | 0,9823 | 0,7644 | 0,5430 | 0,3648 | 0,29 | 0,2483 | 0,2045 | 0,1521 | 0,1194 | 0,0710 |
fpr | 0,5042 | 0,0902 | 0,0319 | 0,0138 | 0,0071 | 0,0049 | 0,0037 | 0,0018 | 0,001 | 0,0009 |