Table 1.

Annotated genes in M. scutellaris mitogenome, upstream/downstream relations, and similarity analysis.

Reference gene		Upstream gene		Downstream gene		Similarity to reference sequence
Name	OCR∗	Name	OCR∗	Name	OCR∗	Blast algorithm	Best identity	E-value
trnI	2	trnA	2	trnQ	2	blastn	—	—
trnA	34	trnT  trnN	27  25	rrnS	30	blastn	92.06	2.00E − 021
trnK	16	trnQ **	5	trnE  trnM	6  4	blastn	93.62	2.00E − 016
trnM	28	trnX **	22	nad2	27	blastn	95.71	2.00E − 028
nad2	36	trnM	27	trnC	32	tblastx	96.43	2.00E − 018
trnC	32	nad2	32	trnW	30	blastn	—	—
trnW	32	trnC	30	trnY	25	blastn	96.92	6.00E − 028
trnY	26	trnW	25	cox1	25	blastn	—	—
cox1	36	trnY	25	trnL2	20	tblastx	98.33	2.00E − 099
trnL2	20	cox1	20	cox2	20	blastn	—	—
cox2	36	tnrL2	20	tnrD	32	tblastx	96.55	3.00E − 063
trnD	32	cox2	32	atp8	31	blastn	—	—
atp8	35	trnD	31	atp6	34	tblastx	93.75	2.00E − 005
atp6	36	atp8	34	cox3	36	tblastx	94.44	1.00E − 009
cox3	36	atp6	36	trnV	17	tblastx	94.12	4.00E − 027
trnS1	27	trnR  nad3	12  10	trnF	19	blastn	96.88	2.00E − 027
trnG	3	cox3	3	nad3  atp8	2  1	blastn	—	—
nad3	36	trnV  cox3	17  14	trnR	24	tblastx	95.00	7.00E − 006
trnR	24	nad3	24	trnS1  trnN	12  9	blastn	—	—
trnN	34	rrnL	25	trnA	25	blastn	96.72	9.00E − 026
trnE	12	trnK	6	trnF	7	blastn	—	—
trnF	28	trnS1	19	nad5	15	blastn	—	—
nad5	36	trnF	15	trnQ **	35	tblastx	95.83	1.00E − 013
trnH	0						—	—
nad4	36	trnQ **	35	nad4l	28	tblastx	95.00	1.00E − 028
nad4l	33	nad4	28	trnP	26	tblastx	94.74	0.13
trnT	32	nad4l	9	trnA	27	blastn	—	—
		trnQ **	7
trnP	35	nad4l	26	nad6	35	blastn	—	—
nad6	35	trnP	36	cob	35	tblastx	94.12	4.00E − 022
cob	36	nad6	35	trnS2	35	tblastx	95.65	1.00E − 011
trnS2	35	cob	35	nad1	35	blastn	100.00	7.00E − 032
nad1	36	trnS2	35	rrnL	34	tblastx	92.86	5.00E − 021
trnL1	2	trnY  nad1	1  1	rrnL  trnL2	1  1	blastn	—	—
rrnL	36	nad1	34	trnN	25	blastn	95.26	3.00E − 095
trnV	23	cox3	17	nad3	17	blastn	—	—
rrnS	36	trnA	30	tnrQ	29	blastn	95.08	4.00E − 024

*OCR: occurrences in different assemblies.

∗∗Genes not found in M. bicolor mitogenome.