Skip to main content
. 2014 Jul 5;14:181. doi: 10.1186/1471-2180-14-181

Table 3.

Comparative genomic analysis of A. baumannii phage IME-AB2, A. baumannii phage AB1, A. baumanni i phage AP22, and A3 baumannii phage phiAC-1

IME-AB2 (82CDSs) AB1 (85CDSs) Score (bits) E-value phiAC-1 (82CDSs) Score (bits) E-value AP22 (89CDSs) Score (bits) E-value
CDS.01
gp01
134
9e-35
0055
190
1e-51
gp42
290
1e-81
CDS.02
gp02
192
4e-52
0054
205
3e-56
gp41
130
9e-34
CDS.03
gp03
895
0.0
0053
645
0.0
gp40
813
0.0
CDS.04
gp04
334
5e-95
0052
207
1e-56
gp39
325
4e-92
CDS.05
gp06
345
2e-98
0051
220
1e-60
gp38
329
2e-93
CDS.06
 
 
 
 
 
 
 
 
 
CDS.07
gp08
57
8e-12
0050
45
3e-08
gp36
52
3e-10
CDS.08
gp09
270
7e-76
0049
99
3e-24
gp35
262
3e-73
CDS.09
gp10
150
4e-40
0048
128
2e-33
gp34
150
4e-40
CDS.10
gp12
298
3e-84
0047
221
5e-61
gp32
299
2e-84
CDS.11
gp13
74
1e-16
0046
75
6e-17
gp31
65
4e-14
CDS.12
gp15
207
2e-56
0043
208
1e-56
gp30
250
2e-69
CDS.13
gp16
120
2e-30
0042
124
1e-31
gp29
99
6e-24
CDS.14
gp17
523
e-151
0041
402
e-115
gp28
546
e-158
CDS.15
 
 
 
 
 
 
 
 
 
CDS.16
gp19
144
4e-38
0038
31
5e-04
gp27
36
1e-05
CDS.17
 
 
 
 
 
 
 
 
 
CDS.18
 
 
 
 
 
 
 
 
 
CDS.19
 
 
 
 
 
 
 
 
 
CDS.20
 
 
 
 
 
 
 
 
 
CDS.21
gp23
55
4e-11
 
 
 
gp22
71
9e-16
CDS.22
 
 
 
 
 
 
 
 
 
CDS.23
 
 
 
0022
40
1e-06
gp21
39
2e-06
CDS.24
gp27
414
e-119
0031
325
6e-92
gp18
404
e-116
CDS.25
gp28
204
4e-56
 
 
 
 
 
 
CDS.26
gp30
831
0.0
0029
658
0.0
gp17
804
0.0
CDS.27
gp31
627
0.0
0028
64
7e-13
gp16
60
8e-12
CDS.28
gp33
305
2e-86
0027
22
0.82
gp15
20
2.7
CDS.29
gp34
31
6e-04
0038
35
3e-05
gp27
32
3e-04
CDS.30
gp34
35
2e-05
 
 
 
gp14
30
6e-04
CDS.31
gp34
31
6e-04
 
 
 
 
 
 
CDS.32
gp35
149
1e-39
 
 
 
gp12
83
1e-19
CDS.33
gp36
112
1e-28
 
 
 
gp10
114
4e-29
CDS.34
 
 
 
 
 
 
 
 
 
CDS.35
gp39
133
6e-35
 
 
 
gp05
137
4e-36
CDS.36
 
 
 
 
 
 
 
 
 
CDS.37
 
 
 
 
 
 
 
 
 
CDS.38
gp40
147
3e-39
0010
50
1e-09
gp02
124
3e-32
CDS.39
gp42
186
1e-50
0021
152
1e-40
 
 
 
CDS.40
 
 
 
 
 
 
gp88
139
8e-37
CDS.41
gp43
92
3e-22
 
 
 
 
 
 
CDS.42
gp44
152
5e-40
 
 
 
gp87
71
1e-15
CDS.43
gp45
97
7e-24
 
 
 
gp86
95
2e-23
CDS.44
gp46
379
e-108
 
 
 
gp85
390
e-112
CDS.45
gp47
388
e-111
 
 
 
gp84
186
6e-50
CDS.46
gp48
68
5e-15
 
 
 
gp83
70
9e-16
CDS.47
gp49
72
2e-16
0019
42
2e-07
gp82
71
4e-16
CDS.48
gp50
192
1e-52
 
 
 
 
 
 
CDS.49
gp51
126
8e-33
0009
42
2e-07
gp79
159
9e-43
CDS.50
gp52
863
0.0
 
 
 
gp77
619
e-180
CDS.51
gp53
204
2e-55
 
 
 
gp76
157
2e-41
CDS.52
 
 
 
 
 
 
 
 
 
CDS.53
gp54
130
5e-34
 
 
 
gp75
133
7e-35
CDS.54
 
 
 
 
 
 
 
 
 
CDS.55
gp57
150
5e-40
 
 
 
gp72
128
3e-33
CDS.56
 
 
 
 
 
 
 
 
 
CDS.57
gp60
72
3e-16
 
 
 
gp69
74
8e-17
CDS.58
gp62
216
6e-59
 
 
 
gp68
295
4e-83
CDS.59
gp63
153
6e-41
 
 
 
 
 
 
CDS.60
gp64
187
9e-51
 
 
 
gp66
192
2e-52
CDS.61
 
 
 
 
 
 
gp65
123
8e-32
CDS.62
gp66
594
e-173
 
 
 
 
 
 
CDS.63
gp67
489
e-141
 
 
 
gp63
38
2e-05
CDS.64
gp68
189
2e-51
 
 
 
gp62
187
5e-51
CDS.65
gp70
59
2e-12
 
 
 
gp61
60
8e-13
CDS.66
gp71
125
5e-32
 
 
 
 
 
 
CDS.67
gp72
143
5e-38
0079
80
1e-18
gp59
128
2e-33
CDS.68
 
 
 
 
 
 
 
 
 
CDS.69
gp74
171
3.00E-46
 
 
 
gp56
174
4e-47
CDS.70
gp75
175
2e-47
 
 
 
gp55
174
3e-47
CDS.71
gp76
221
4e-60
0069
189
1e-50
gp54
252
1e-69
CDS.72
gp77
304
1e-85
0068
216
3e-59
gp53
313
2e-88
CDS.73
gp78
418
e-120
0067
332
3e-94
gp52
421
e-121
CDS.74
gp79
790
0.0
0066
585
e-170
gp51
796
0.0
CDS.75
gp80
213
1e-58
0065
164
4e-44
gp50
214
6e-59
CDS.76
 
 
 
 
 
 
gp49
59
2e-12
CDS.77
gp81
429
e-123
0064
200
2e-54
gp48
430
e-123
CDS.78
gp82
575
e-167
0063
437
e-125
gp47
573
e-166
CDS.79
 
 
 
0061
124
4e-32
gp46
170
5e-46
CDS.80
gp83
352
e-100
0060
277
1e-77
gp45
351
e-100
CDS.81
gp84
710
0.0
0057
368
e-104
gp44
715
0.0
CDS.82 gp85 77 6e-18 0056 61 6e-13 gp43 145 2e-38

IME-AB2 is the reference for alignments and comparisons to the three other strains (AB1,phiAC-1 and AP22).