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. 2014 Jun 20;4(2):499–516. doi: 10.3390/metabo4020499

Table 1.

Absolute concentrations of each metabolite in μmol/g-drycell weight. S.D. represents standard deviation.

Metabolite PCC6803 PCC7002 PCC7942
Average S.D. Average S.D. Average S.D.
2-Isopropylmalate 4.11 × 10 −1 7.75 × 10 −2 1.34 × 10 −1 2.01 × 10 −2 3.22 × 10 –2 1.18 × 10 −2
2-Oxoglutarate 2.94 × 10 −1 7.06 × 10 −2 1.77 × 100 7.23 × 10 −1 1.77 × 10 −1 5.14 × 10 −2
3PGA 1.48 × 101 1.86 × 100 2.02 × 101 4.87 × 100 7.13 × 100 1.18 × 100
4-Aminobutanoate 9.67 × 10 −3 2.09 × 10 −3 9.23 × 10 −3 2.40 × 10 −3 1.42 × 10 −2 1.01 × 10 −2
6-Phosphogluconate 4.66 × 100 8.35 × 10 −1 1.99 × 100 1.11 × 100 1.87 × 10 −1 4.76 × 10 −2
Acetyl CoA 4.43 × 10 −1 4.29 × 10 −2 6.22 × 10 −2 8.02 × 10 −3 6.54 × 10 −2 9.12 × 10 −3
ADP 6.51 × 100 7.58 × 10 −1 2.68 × 100 1.46 × 10 −2 2.38 × 100 6.44 × 10 −1
ADP-Glc 7.00 × 10 −2 4.13 × 10 −2 6.13 × 10 −1 2.66 × 10 −1 3.88 × 10 −2 1.76 × 10 −2
Alanine 4.53 × 100 1.16 × 100 6.50 × 10 −1 1.48 × 10 −1 8.12 × 10 −1 6.74 × 10 −1
α-Glycerophosphate 4.77 × 10 −1 7.50 × 10 −2 9.83 × 10 −1 1.94 × 10 −1 2.22 × 10 −1 3.74 × 10 −2
AMP 1.07 × 101 1.48 × 100 4.56 × 100 4.09 × 10 −1 3.92 × 100 1.09 × 100
Arginine + Ornithine 2.12 × 10 1 5.02 × 100 4.31 × 100 6.72 × 10 −1 3.52 × 100 9.79 × 10 −1
Asparagine 4.34 × 10 −1 8.01 × 10 −2 2.66 × 10 −2 3.97 × 10 −3 8.68 × 10 −2 3.49 × 10 −2
Aspartate 7.14 × 100 1.20 × 100 2.69 × 100 6.09 × 10 -1 2.53 × 100 1.07 × 100
ATP 2.14 × 100 5.58 × 10 −1 3.09 × 100 3.48 × 10 −1 1.90 × 100 8.72 × 10 −1
Citrate 2.16 × 100 7.83 × 10 −2 4.22 × 100 1.43 × 100 3.57 × 10 −1 8.69 × 10 −2
CMP 3.43 × 10 −1 7.71 × 10 −2 2.17 × 10 −1 4.07 × 10 −2 2.71 × 10 −1 3.67 × 10 −2
CTP 5.97 × 10 −1 1.08 × 10 -1 6.52 × 10 −2 9.81 × 10 −3 2.97 × 10 −2 1.13 × 10 −2
Cystein 4.79 × 10 −1 2.30 × 10 −1 5.28 × 10 −1 1.73 × 10 −1 2.32 × 10 −1 1.89 × 10 −1
Cytidine 1.28 × 10 −2 4.16 × 10 −3 2.11 × 10 −2 5.56 × 10 −3 3.40 × 10 −2 7.35 × 10 −3
DHAP 4.30 × 10 −1 7.71 × 10 −2 5.48 × 10 −1 2.91 × 10 −1 1.15 × 10 −1 1.67 × 10 −2
Disaccharide-P 6.03 × 10 −4 3.27 × 10 −4 1.21 × 10 −2 9.63 × 10 −3 1.56 × 10 −3 1.05 × 10 −3
F1P 1.12 × 10 −2 3.71 × 10 −3 1.90 × 10 −2 4.37 × 10 −3 6.99 × 10 −3 1.04 × 10 −3
F6P 4.61 × 10 −1 9.81 × 10 −2 5.19 × 10 −1 2.13 × 10 −2 2.75 × 10 −1 7.97 × 10 −2
FAD 9.98 × 10 −2 3.19 × 10 −2 1.60 × 10 −1 3.38 × 10 −2 1.98 × 10 −1 2.80 × 10 −2
FBP 2.40 × 10 −1 1.07 × 10 −1 3.39 × 10 −1 1.44 × 10 −2 2.08 × 10 −2 1.37 × 10 −3
FMN 4.77 × 10 −2 1.95 × 10 −2 4.81 × 10 −2 7.94 × 10 −3 5.26 × 10 −2 2.18 × 10 −2
Fumarate 1.63 × 10 −1 2.27 × 10 −2 9.08 × 10 −2 9.45 × 10 −3 5.11 × 10 −2 9.58 × 10 −3
G1P 6.91 × 10 −2 1.04 × 10 −2 1.41 × 10 −1 1.45 × 10 −2 9.23 × 10 −2 4.99 × 10 −2
G6P 1.84 × 100 3.10 × 10 −1 4.19 × 100 7.29 × 10 −1 1.57 × 100 3.43 × 10 −1
GAP 2.63 × 10 −1 7.81 × 10 −2 5.59 × 10 −1 2.24 × 10 −1 1.88 × 10 −1 4.91 × 10 −2
GDP 1.38 × 100 1.73 × 10 −1 9.38 × 10 −1 1.77 × 10 −1 3.46 × 100 4.42 × 100
Glutamate 2.13 × 102 4.79 × 101 4.25 × 101 6.52 × 100 3.39 × 101 8.11 × 100
Glutamine 3.47 × 100 4.61 × 10 −1 5.14 × 10 −1 1.37 × 10 −2 6.34 × 10 −1 2.12 × 10 −1
Glycerate 2.53 × 10 −2 9.28 × 10 −3 2.06 × 10 −2 5.33 × 10 −4 2.09 × 10 −2 1.93 × 10 −2
Glycine 1.67 × 10 1 4.51 × 100 2.17 × 100 8.78 × 10 −1 1.78 × 101 2.66 × 101
Glycolate 7.51 × 10 −2 2.03 × 10 −2 3.18 × 10 −2 1.47 × 10 −2 5.44 × 10 −2 1.49 × 10 −2
GMP 7.30 × 10 −1 2.05 × 10 −1 3.75 × 10 −1 3.47 × 10 −2 3.77 × 10 −1 6.40 × 10 −2
GTP 8.31 × 10 −1 2.35 × 10 −1 9.61 × 10 −1 1.93 × 10 −1 4.11 × 10 −1 1.31 × 10 −1
Guanosine 7.26 × 10 −2 3.51 × 10 −2 2.91 × 10 −1 1.92 × 10 −1 9.43 × 10 −2 3.71 × 10 −2
Histidine 1.10 × 10 −1 3.46 × 10 −2 7.03 × 10 −2 2.20 × 10 −2 6.45 × 10 −2 2.58 × 10 −2
HMBPP 9.27 × 10 −2 2.66 × 10 −2 5.40 × 10 −2 1.90 × 10 −2 3.32 × 10 −2 4.33 × 10 −3
Homoserine 3.05 × 10 −2 1.16 × 10 −2 1.32 × 10 −2 1.33 × 10 −3 1.51 × 10 −2 3.85 × 10 −3
Hydroxyproline 9.27 × 10 −1 3.05 × 10 −1 4.44 × 10 −1 1.72 × 10 −1 7.65 × 10 −1 5.11 × 10 −1
IMP 4.64 × 10 −1 3.84 × 10 −2 2.48 × 10 −1 9.97 × 10 −2 1.72 × 10 −1 6.00 × 10 −2
Inosine 1.46 × 10 −2 5.54 × 10 −3 9.41 × 10 −2 8.20 × 10 −2 6.80 × 10 −2 2.51 × 10 −2
IPP + DMAPP 1.40 × 10 −2 1.60 × 10 −3 9.64 × 10 − 3 1.79 × 10 −3 1.63 × 10 −2 1.28 × 10 −3
Isocitrate 1.45 × 100 1.25 × 10 −1 3.04 × 100 1.43 × 100 1.09 × 10 −1 4.96 × 10 −3
Isoleucine 3.70 × 10 −1 9.37 × 10 −2 7.14 × 10 −2 1.37 × 10 −2 1.50 × 10 −1 1.16 × 10 −1
Leucine 7.72 × 10 −1 1.55 × 10 −1 1.26 × 10 −1 2.32 × 10 −2 1.76 × 10 −1 1.33 × 10 −1
Lysine 1.57 × 10 −1 4.40 × 10 −2 1.02 × 10 −1 1.11 × 10 −2 9.32 × 10 −2 3.62 × 10 −2
Malate 1.82 × 10 −1 2.24 × 10 −2 6.36 × 10 −2 4.72 × 10 −3 2.08 × 10 −1 7.92 × 10 −2
MEP 8.38 × 10 −2 1.64 × 10 −2 3.94 × 10 −2 9.17 × 10 −3 3.83 × 10 −2 8.08 × 10 −3
Methionine 6.13 × 10 −1 1.10 × 10 −1 2.67 × 10 −1 4.40 × 10 −2 2.30 × 10 −1 4.51 × 10 −2
Mn6P 2.92 × 10 −1 4.19 × 10 −2 2.53 × 10 −1 7.48 × 10 −2 2.02 × 10 −1 3.06 × 10 −2
NAD 5.14 × 10 −1 1.26 × 10 −1 3.84 × 10 −1 2.97 × 10 −2 5.64 × 10 −1 1.04 × 10 −1
NADP 6.14 × 10 −1 1.26 × 10 −1 6.82 × 10 −1 1.38 × 10 −1 3.79 × 10 −1 8.28 × 10 −2
Nicotinate 3.56 × 10 −4 7.66 × 10 −5 7.72 × 10 −4 3.27 × 10 −4 4.62 × 10 −4 1.86 × 10 −4
Orotate 1.03 × 10 −2 1.58 × 10 −3 5.97 × 10 −3 2.34 × 10 −3 1.75 × 10 −3 7.23 × 10 −4
Pantothenate 4.91 × 10 −3 1.02 × 10 −3 2.13 × 10 −4 3.22 × 10 −5 4.56 × 10 −4 2.59 × 10 −4
PEP 2.51 × 100 7.59 × 10 −1 2.27 × 10 0 7.18 × 10 −1 1.47 × 100 2.45 × 10 −1
Phenylalanine 1.99 × 10 −1 6.09 × 10 −2 7.73 × 10 −2 1.86 × 10 −2 7.63 × 10 −2 4.77 × 10 −2
Proline 9.14 × 10 −1 1.76 × 10 −1 5.06 × 10 −2 9.05 × 10 −3 1.38 × 10 −1 1.23 × 10 −1
Pyridoxamine-5P 4.58 × 10 −2 5.05 × 10 −3 3.32 × 10 −2 2.92 × 10 −3 3.17 × 10 −2 3.82 × 10 −3
Pyroglutamate 2.81 × 100 7.22 × 10 −1 5.95 × 10 −1 8.06 × 10 −2 1.51 × 100 1.41 × 100
Pyruvate 1.05 × 101 1.38 × 100 1.81 × 10 1 4.20 × 10 0 5.76 × 100 1.12 × 100
R1P 3.62 × 10 −3 7.87 × 10 −4 2.90 × 10 −3 1.36 × 10 −3 9.68 × 10 −4 2.08 × 10 −4
R5P 1.95 × 10 −1 6.88 × 10 −2 1.52 × 10 −1 6.33 × 10 −2 5.82 × 10 −2 8.74 × 10 −3
Ru5P 4.04 × 10 −1 6.01 × 10 −2 2.19 × 10 −1 4.25 × 10 −2 4.48 × 10 −2 5.98 × 10 −3
RuBP 2.92 × 10 −1 5.35 × 10 −2 2.37 × 10 −1 5.29 × 10 −2 8.39 × 10 −2 2.74 × 10 −2
S7P 3.57 × 100 1.10 × 100 5.60 × 10 0 2.50 × 10 0 1.28 × 100 4.41 × 10 −1
Serine 7.12 × 10 −1 2.63 × 10 −1 3.11 × 10 −1 9.71 × 10 −2 9.12 × 10 −1 1.01 × 100
Shikimate 1.32 × 10 −3 5.41 × 10 −4 1.66 × 10 −3 1.13 × 10 −3 1.19 × 10 −3 7.67 × 10 −4
Succinate 3.23 × 10 −1 7.42 × 10 −2 2.15 × 10 −1 6.81 × 10 −2 1.97 × 10 −1 4.21 × 10 −2
Threonine 8.39 × 10 −1 1.99 × 10 −1 2.95 × 10 −1 8.09 × 10 −2 3.52 × 10 –1 2.68 × 10 −1
TMP 2.71 × 10 −2 6.61 × 10 −3 2.23 × 10 −2 6.80 × 10 −3 3.57 × 10 −2 2.71 × 10 −3
Tryptophan 2.19 × 10 −1 4.26 × 10 −2 6.95 × 10 −2 7.88 × 10 −3 8.85 × 10 −2 1.18 × 10 −2
Tyrosine 3.04 × 100 6.83 × 10 −1 6.09 × 10 −1 6.31 × 10 −2 5.62 × 10 −1 2.60 × 10 −1
UDP-Glc 2.24 × 100 2.22 × 10 −1 6.98 × 10 −1 7.48 × 10 −2 1.05 × 100 1.97 × 10 −1
UMP 7.44 × 10 −1 1.52 × 10 −1 6.05 × 10 −1 2.43 × 10 −1 7.79 × 10 −1 1.58 × 10 −1
Uridine 2.16 × 10 −2 9.04 × 10 −3 5.21 × 10 −2 3.01 × 10 −2 8.93 × 10 −2 2.92 × 10 −2
UTP 5.54 × 10 −1 1.49 × 10 −1 3.19 × 10 −1 4.17 × 10 −2 1.75 × 10 −1 4.96 × 10 −2
Valine 9.81 × 10 −1 2.00 × 10 −1 2.09 × 10 −1 3.94 × 10 −2 3.60 × 10 −1 2.13 × 10 −1
XMP 4.73 × 10 −2 1.37 × 10 −2 8.66 × 10 −2 3.06 × 10 −2 1.01 × 10 −1 2.73 × 10 −2