Table 3.
Length of peptide or protein (aa)b | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|||||||
Speciesa | Strain | Genbank accession no(s). | |||||
GPC | SP | G1 | G2 | N protein | |||
MPRV | AV I0130006 | JX560798 | 484 | 58 | 192 | 234 | 562 |
MPRV | AV M0040017 | JX560799 | 484 | 58 | 192 | 234 | 562 |
BCNV | AV A0060209 | AF512833 | 483 | 58 | 191 | 234 | 562 |
BCNV | AV 98470029 | AY924392 | 483 | 58 | 191 | 234 | 562 |
BCNV | AV A0070039 | AY924391 | 483 | 58 | 191 | 234 | 562 |
BCNV | AV B0300052 | FJ907243, FJ907244 | 483 | 58 | 191 | 234 | 562 |
BBTV | AV D0390174 | EF619035 | 485 | 58 | 193 | 234 | 562 |
BBTV | AV D0390324 | EF619036 | 485 | 58 | 193 | 234 | 562 |
CTNV | AV A0400135 | DQ865244 | 484 | 58 | 192 | 234 | 562 |
CTNV | AV A0400212 | DQ865245 | 484 | 58 | 192 | 234 | 562 |
RCTV | AV H0030026 | GQ903697 | 483 | 58 | 191 | 234 | 562 |
SKTV | AV D1000090 | EU123328 | 481 | 58 | 189 | 234 | 562 |
TAMV | AV 97140103 | EU486821 | 485 | 58 | 193 | 234 | 562 |
TAMV | W·10777 | AF512828 | 485 | 58 | 193 | 234 | 562 |
TTCV | AV D0150144 | EF619033 | 484 | 58 | 192 | 234 | 562 |
TTCV | AV D0390060 | EF619034 | 485 | 58 | 193 | 234 | 562 |
WWAV | AV 9310135 | AF228063 | 480 | 58 | 188 | 234 | 562 |
WWASC | AV 96010024 | EU123331 | 480 | 58 | 188 | 234 | 562 |
WWASC | AV 96010025 | EU486820 | 480 | 58 | 188 | 234 | 562 |
WWASC | AV 96010151 | EU123330 | 483 | 58 | 191 | 234 | 562 |
WWASC | AV 98490013 | FJ032026, FJ032027 | 482 | 58 | 190 | 234 | 562 |
WWASC | TVP·6038 | FJ719106, FJ719107 | 482 | 58 | 190 | 234 | 562 |
WWASC | AV D1240007 | EU123329 | 484 | 58 | 192 | 234 | 562 |
WWASC | AV H0380005 | EU910959 | 484 | 58 | 192 | 234 | 562 |
MPRV, Middle Pease River virus; BCNV, Bear Canyon virus; BBTV, Big Brushy Tank virus; CTNV, Catarina virus; RCTV, Real de Catorce virus; SKTV, Skinner Tank virus; TAMV, Tamiami virus; TTCV, Tonto Creek virus; WWAV, Whitewater Arroyo virus. MPRV, BBTV, CTNV, RCTV, SKTV, and TTCV are provisional species in the family Arenaviridae, genus Arenavirus. Arenaviruses AV 96010024, AV 96010025, AV 96010151, AV 98490013, TVP·6038, AV D1240007, and AV H0380005 are members of the Whitewater Arroyo species complex (WWASC) (Cajimat et al. 2008).
GPC, glycoprotein precursor; SP, signal peptide; N protein, nucleocapsid protein.