Skip to main content
. Author manuscript; available in PMC: 2014 Dec 26.
Published in final edited form as: Virus Res. 2013 Oct 24;178(2):486–494. doi: 10.1016/j.virusres.2013.10.004

Table 3.

North American arenaviruses included in the analyses of nucleotide and amino acid sequence data.

Length of peptide or protein (aa)b

Speciesa Strain Genbank accession no(s).
GPC SP G1 G2 N protein
MPRV AV I0130006 JX560798 484 58 192 234 562
MPRV AV M0040017 JX560799 484 58 192 234 562
BCNV AV A0060209 AF512833 483 58 191 234 562
BCNV AV 98470029 AY924392 483 58 191 234 562
BCNV AV A0070039 AY924391 483 58 191 234 562
BCNV AV B0300052 FJ907243, FJ907244 483 58 191 234 562
BBTV AV D0390174 EF619035 485 58 193 234 562
BBTV AV D0390324 EF619036 485 58 193 234 562
CTNV AV A0400135 DQ865244 484 58 192 234 562
CTNV AV A0400212 DQ865245 484 58 192 234 562
RCTV AV H0030026 GQ903697 483 58 191 234 562
SKTV AV D1000090 EU123328 481 58 189 234 562
TAMV AV 97140103 EU486821 485 58 193 234 562
TAMV W·10777 AF512828 485 58 193 234 562
TTCV AV D0150144 EF619033 484 58 192 234 562
TTCV AV D0390060 EF619034 485 58 193 234 562
WWAV AV 9310135 AF228063 480 58 188 234 562
WWASC AV 96010024 EU123331 480 58 188 234 562
WWASC AV 96010025 EU486820 480 58 188 234 562
WWASC AV 96010151 EU123330 483 58 191 234 562
WWASC AV 98490013 FJ032026, FJ032027 482 58 190 234 562
WWASC TVP·6038 FJ719106, FJ719107 482 58 190 234 562
WWASC AV D1240007 EU123329 484 58 192 234 562
WWASC AV H0380005 EU910959 484 58 192 234 562
a

MPRV, Middle Pease River virus; BCNV, Bear Canyon virus; BBTV, Big Brushy Tank virus; CTNV, Catarina virus; RCTV, Real de Catorce virus; SKTV, Skinner Tank virus; TAMV, Tamiami virus; TTCV, Tonto Creek virus; WWAV, Whitewater Arroyo virus. MPRV, BBTV, CTNV, RCTV, SKTV, and TTCV are provisional species in the family Arenaviridae, genus Arenavirus. Arenaviruses AV 96010024, AV 96010025, AV 96010151, AV 98490013, TVP·6038, AV D1240007, and AV H0380005 are members of the Whitewater Arroyo species complex (WWASC) (Cajimat et al. 2008).

b

GPC, glycoprotein precursor; SP, signal peptide; N protein, nucleocapsid protein.